56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ANIA_03619 on replicon BN001302
Organism: Aspergillus nidulans FGSC A4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
BN001302  ANIA_03619  subunit of MRX complex (Eurofung)  100 
 
 
1319 aa  2688    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.296767 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53629  DNA repair protein  32.25 
 
 
1306 aa  610  1e-173  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.440366 
 
 
-
 
NC_006683  CNN01100  telomere maintenance protein, putative  33 
 
 
1289 aa  550  1e-155  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.28116  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28736  predicted protein  28.57 
 
 
1313 aa  278  4e-73  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_51876  Rad50 DNA repair/recombination protein  39.02 
 
 
1436 aa  223  9.999999999999999e-57  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.347937  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0961  SMC domain protein  38.71 
 
 
891 aa  62.8  0.00000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000356641  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1245  SMC domain-containing protein  35.56 
 
 
693 aa  57  0.000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0762  SMC domain-containing protein  37.63 
 
 
858 aa  56.2  0.000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0108669  decreased coverage  0.00239369 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0068  Rad50 zinc hook domain protein  37.36 
 
 
864 aa  55.1  0.000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.191393  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2125  ABC transporter related  30.83 
 
 
641 aa  49.3  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.279958 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0527  SMC domain-containing protein  29.27 
 
 
784 aa  49.3  0.0005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1409  ABC transporter related  37.33 
 
 
530 aa  48.5  0.0008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1349  ABC transporter related  38.67 
 
 
522 aa  48.1  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2535  ABC transporter related  37.33 
 
 
530 aa  48.1  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.776559  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2343  SMC domain protein  36.11 
 
 
912 aa  47  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1722  SMC domain-containing protein  35.42 
 
 
580 aa  47.4  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.198567  hitchhiker  0.0000514519 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0302  SMC domain-containing protein  23.84 
 
 
702 aa  47  0.003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003501  ABC transporter ATP-binding protein  37.33 
 
 
530 aa  46.6  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2753  ABC transporter related  36 
 
 
530 aa  47  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0936  ABC transporter ATP-binding protein  36 
 
 
530 aa  46.2  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.337532  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1716  chromosome segregation protein SMC  21.55 
 
 
1196 aa  46.2  0.004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.651651  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1517  ABC transporter related protein  36 
 
 
530 aa  46.2  0.004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0906  ABC transporter ATP-binding protein  36 
 
 
530 aa  46.2  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.753314  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0969  ABC transporter ATP-binding protein  36 
 
 
531 aa  46.2  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.138083  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0990  ABC transporter ATP-binding protein  36 
 
 
531 aa  46.2  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.166125  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0878  ABC transporter, ATP-binding protein  36 
 
 
530 aa  46.2  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.720445  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1484  SMC domain-containing protein  39.58 
 
 
1061 aa  46.2  0.004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0728646  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0470  SMC domain-containing protein  32.69 
 
 
666 aa  46.6  0.004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.349593  normal  0.0900334 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2301  SMC domain protein  30.08 
 
 
987 aa  45.8  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1922  SMC domain protein  30.08 
 
 
987 aa  45.8  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.664102 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2570  SMC domain-containing protein  35.62 
 
 
984 aa  45.8  0.005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1676  ABC transporter-related protein  37.33 
 
 
531 aa  45.8  0.005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.762171  unclonable  0.00000352126 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4129  putative ABC transporter ATP-binding protein  28.69 
 
 
549 aa  45.4  0.006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1167  chromosome segregation protein SMC  30.61 
 
 
1255 aa  45.4  0.006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.469719  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3190  ABC transporter related  37.33 
 
 
531 aa  45.8  0.006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.593825 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2581  ABC transporter related  36 
 
 
531 aa  45.4  0.006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2131  putative ABC transporter ATP-binding protein  28.69 
 
 
549 aa  45.4  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.198515  normal  0.0197095 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1486  ABC transporter-related protein  37.33 
 
 
524 aa  45.8  0.006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2483  ABC transporter, ATP-binding protein  36 
 
 
531 aa  45.4  0.006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1311  ABC transporter related  37.33 
 
 
531 aa  45.8  0.006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2771  ABC transporter related  37.33 
 
 
522 aa  45.4  0.007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3051  ABC transporter related  33.67 
 
 
198 aa  45.4  0.007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3260  ABC transporter ATP-binding protein, two fused  37.33 
 
 
523 aa  45.4  0.007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0410854  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2528  ABC transporter, ATP-binding protein  34.67 
 
 
530 aa  45.1  0.008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.138533  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2269  ABC transporter, ATP-binding protein  34.67 
 
 
530 aa  45.4  0.008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1882  SMC domain-containing protein  20.45 
 
 
805 aa  45.1  0.008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0300452  normal  0.0368515 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0969  ABC transporter, ATP-binding protein  34.67 
 
 
530 aa  45.1  0.009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.12537  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06614  hypothetical protein  34.94 
 
 
526 aa  45.1  0.009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00804  hypothetical protein  34.67 
 
 
530 aa  45.1  0.009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2240  ABC transporter related  36 
 
 
522 aa  45.1  0.009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1919  putative ABC transporter ATP-binding protein  28.69 
 
 
549 aa  45.1  0.009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.137087  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3414  putative ABC transporter ATP-binding protein  28.93 
 
 
555 aa  45.1  0.009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.106241  normal  0.225653 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2822  ABC transporter related protein  34.67 
 
 
530 aa  45.1  0.009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.596097  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00787  fused predicted transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  34.67 
 
 
530 aa  45.1  0.009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1545  ABC transporter-related protein  34.67 
 
 
522 aa  45.1  0.01  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3452  putative ABC transporter ATP-binding protein  25.9 
 
 
549 aa  45.1  0.01  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.747993  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>