240 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_2789 on replicon NC_012028
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012028  Hlac_2789  SMC domain protein  100 
 
 		 926 aa  1836    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2898  chromosome segregation protein  29.14 
 
 		 891 aa  289  2e-76  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1501  SMC-like protein  26.05 
 
 		 888 aa  283  1e-74  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1495  SMC domain protein  29.27 
 
 		 895 aa  270  7e-71  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2437  SMC domain protein  28.71 
 
 		 924 aa  258  3e-67  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0371  chromosome segregation protein  29.06 
 
 		 890 aa  253  1e-65  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0360  chromosome segregation protein  28.35 
 
 		 1074 aa  159  3e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0181  chromosome segregation protein  34.75 
 
 		 902 aa  158  4e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0068  Rad50 zinc hook domain protein  22.97 
 
 		 864 aa  108  4e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.191393  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0586  SMC domain-containing protein  22.71 
 
 		 993 aa  102  2e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.594919  normal  0.0182683 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0237  SMC domain-containing protein  29.9 
 
 		 993 aa  99.4  3e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0769992  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0762  SMC domain-containing protein  24 
 
 		 858 aa  99.4  3e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0108669  decreased coverage  0.00239369 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1332  SMC domain-containing protein  29.9 
 
 		 993 aa  99  4e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1874  SMC domain protein  23.4 
 
 		 1021 aa  96.3  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0961  SMC domain protein  22.01 
 
 		 891 aa  89.4  3e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000356641  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0985  SMC domain-containing protein  22.57 
 
 		 702 aa  89.4  3e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000497741 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0652  SMC domain-containing protein  24.34 
 
 		 1019 aa  89  4e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.105285  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1626  SMC domain protein  27.16 
 
 		 978 aa  87.4  0.000000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1081  SMC domain-containing protein  25.22 
 
 		 804 aa  84  0.00000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000660429  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1257  SMC domain protein  24.16 
 
 		 1019 aa  84  0.00000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.861215  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0711  SMC domain-containing protein  28.19 
 
 		 994 aa  82.4  0.00000000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.00173757  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0018  SMC domain protein  22.28 
 
 		 862 aa  79.7  0.0000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0623828 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1142  SMC domain protein  22.27 
 
 		 857 aa  79.3  0.0000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4031  SMC domain-containing protein  24.71 
 
 		 810 aa  76.6  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.515725  normal  0.378288 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1551  SMC domain-containing protein  29.41 
 
 		 824 aa  75.1  0.000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.875451  normal  0.721096 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1488  SMC domain protein  24.79 
 
 		 1114 aa  71.2  0.00000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1245  SMC domain-containing protein  22.22 
 
 		 693 aa  68.6  0.0000000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1574  SMC domain-containing protein  22.4 
 
 		 840 aa  68.6  0.0000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0162335  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6131  SMC domain protein  28.28 
 
 		 851 aa  67  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.983245 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0527  SMC domain-containing protein  23.29 
 
 		 784 aa  66.2  0.000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1496  SMC domain-containing protein  30 
 
 		 824 aa  66.2  0.000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00508772  hitchhiker  0.000363104 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0982  SMC domain-containing protein  24.62 
 
 		 906 aa  65.9  0.000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0283  SMC domain protein  28.8 
 
 		 1223 aa  64.7  0.000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1915  SMC domain protein  27.27 
 
 		 815 aa  64.7  0.000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00125008  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1617  SMC domain-containing protein  25.82 
 
 		 1057 aa  64.7  0.000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1709  exonuclease SbcC  23 
 
 		 1008 aa  64.3  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0823  SMC protein-like protein  25.28 
 
 		 910 aa  64.3  0.00000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.465313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0855  SMC domain protein  24.18 
 
 		 802 aa  63.5  0.00000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.128097  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0948  SMC domain protein  26.63 
 
 		 789 aa  63.5  0.00000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.217826  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4886  SMC domain protein  25.51 
 
 		 1244 aa  63.5  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.110633  normal  0.678618 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4561  exonuclease SbcC  24.77 
 
 		 1007 aa  62.8  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1540  SMC domain protein  29.65 
 
 		 1182 aa  62.8  0.00000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1381  chromosome segregation protein SMC  22.63 
 
 		 1184 aa  61.6  0.00000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.530369  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1882  SMC domain protein  26.81 
 
 		 904 aa  62  0.00000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.600097  normal  0.549876 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0205  SMC domain-containing protein  26.11 
 
 		 1180 aa  61.2  0.00000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27300  DNA repair ATPase  25.11 
 
 		 1022 aa  60.8  0.0000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0427932  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3777  exonuclease SbcC  26.46 
 
 		 1103 aa  60.8  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  unclonable  0.00618704  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1420  condensin subunit Smc  30.48 
 
 		 1183 aa  59.7  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0527  chromosome segregation protein SMC  25.12 
 
 		 1193 aa  60.5  0.0000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.534964 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3877  exonuclease SbcC  23.16 
 
 		 1016 aa  60.1  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.371142  normal  0.0827458 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0939  SMC domain-containing protein  23.39 
 
 		 812 aa  60.1  0.0000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0924914  normal  0.567341 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1484  SMC domain-containing protein  24.44 
 
 		 1061 aa  59.3  0.0000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0728646  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0181  condensin subunit Smc  22.42 
 
 		 1189 aa  59.3  0.0000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.797796  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2587  chromosome segregation protein SMC  24.52 
 
 		 1189 aa  58.9  0.0000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0302  SMC domain-containing protein  23.59 
 
 		 702 aa  58.9  0.0000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01270  DNA repair ATPase  26.05 
 
 		 1047 aa  58.5  0.0000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2637  SMC domain-containing protein  26.27 
 
 		 1164 aa  58.2  0.0000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.257916  normal  0.0339127 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0124  putative exonuclease  26.8 
 
 		 1046 aa  58.2  0.0000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0895241  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0004  DNA replication and repair protein RecF  25 
 
 		 353 aa  58.2  0.0000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000383314  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01211  SMC ATPase superfamily chromosome segregation protein  29.15 
 
 		 1201 aa  57.8  0.0000008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1890  DNA repair exonuclease, SbcC  25.11 
 
 		 989 aa  57.4  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.295467  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0748  SMC domain-containing protein  22.6 
 
 		 935 aa  57.8  0.000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.874201  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1819  SMC domain-containing protein  22.5 
 
 		 702 aa  57.4  0.000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  decreased coverage  0.000524613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1099  SMC domain-containing protein  22.61 
 
 		 1346 aa  57.4  0.000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.00011196  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00651  SMC ATPase superfamily chromosome segregation protein  28.21 
 
 		 1207 aa  56.6  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.929261  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0704  ATP-dependent dsDNA exonuclease (SbcC)  21.8 
 
 		 1091 aa  57  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.859038  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0448  SMC protein-like protein  22.39 
 
 		 955 aa  56.6  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.507994  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1364  ATP-dependent dsDNA exonuclease  22.71 
 
 		 1059 aa  56.6  0.000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2917  SMC domain protein  24.47 
 
 		 1227 aa  56.2  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.605657  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1341  chromosome segregation protein SMC  26.6 
 
 		 1196 aa  55.8  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2384  exonuclease SbcC  24.38 
 
 		 1099 aa  56.2  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00297099  hitchhiker  0.00111486 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2255  condensin subunit Smc  28.99 
 
 		 1202 aa  55.5  0.000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.204212 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0358  SMC protein-like protein  26.38 
 
 		 673 aa  55.5  0.000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0988635 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1811  SMC domain-containing protein  24.21 
 
 		 794 aa  55.5  0.000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.305534 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2553  SMC domain protein  27.41 
 
 		 829 aa  55.5  0.000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0592  condensin subunit Smc  26.09 
 
 		 1175 aa  55.1  0.000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1399  SMC protein-like  26.63 
 
 		 1303 aa  55.1  0.000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1158  SMC domain protein  23.31 
 
 		 1226 aa  55.1  0.000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.1908  normal  0.473044 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3111  exonuclease SbcC  25.13 
 
 		 1008 aa  54.7  0.000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3009  exonuclease SbcC  25.13 
 
 		 1008 aa  54.3  0.000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.291694  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00345  exonuclease, dsDNA, ATP-dependent  20.33 
 
 		 1048 aa  53.9  0.00001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5113  hypothetical protein  48.84 
 
 		 422 aa  53.9  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0419  hypothetical protein  48 
 
 		 421 aa  54.3  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.247719  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0772  SMC domain protein  23.08 
 
 		 961 aa  53.9  0.00001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00238509  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1063  exonuclease SbcCD, C subunit  26.63 
 
 		 1307 aa  53.9  0.00001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0425  chromosome segregation protein SMC  28.5 
 
 		 1204 aa  54.3  0.00001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.501211  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4093  SMC domain-containing protein  22.17 
 
 		 1022 aa  53.9  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.240758  normal  0.708538 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0894  SMC domain-containing protein  27.15 
 
 		 1165 aa  54.3  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.60496  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00349  hypothetical protein  20.33 
 
 		 1048 aa  53.9  0.00001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3108  SMC domain protein  23.94 
 
 		 1227 aa  53.9  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.885936  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03271  hypothetical protein  28.27 
 
 		 1184 aa  53.9  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0521  SMC domain protein  24.42 
 
 		 1011 aa  53.9  0.00001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1736  SMC domain-containing protein  21.47 
 
 		 1029 aa  53.9  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0965884  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0549  exonuclease SbcC, putative  25.3 
 
 		 859 aa  53.5  0.00002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0426  exonuclease subunit SbcC  20.83 
 
 		 1047 aa  53.5  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.442969  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_490  DNA repair ATPase  25.3 
 
 		 859 aa  53.1  0.00002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.0000109294  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2080  exonuclease SbcC  24.08 
 
 		 1219 aa  53.5  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3236  exonuclease subunit SbcC  20.33 
 
 		 1047 aa  53.5  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.528521  hitchhiker  0.0000322457 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0673  SMC domain protein  25.67 
 
 		 1116 aa  53.5  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00700495  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1831  chromosome segregation protein SMC  22.3 
 
 		 1147 aa  53.1  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>