123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_3009 on replicon NC_013206
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013206  Aaci_3009  SMC domain protein  100 
 
 		 514 aa  1061    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1245  SMC domain-containing protein  23.65 
 
 		 693 aa  69.7  0.0000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2009  hypothetical protein  43.24 
 
 		 922 aa  63.5  0.000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1257  SMC domain protein  34.69 
 
 		 1019 aa  62.8  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.861215  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3877  exonuclease SbcC  26.88 
 
 		 1016 aa  61.2  0.00000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.371142  normal  0.0827458 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1484  SMC domain-containing protein  28.47 
 
 		 1061 aa  60.5  0.00000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0728646  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0652  SMC domain-containing protein  33.33 
 
 		 1019 aa  59.3  0.0000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.105285  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0586  SMC domain-containing protein  23.53 
 
 		 993 aa  57.8  0.0000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.594919  normal  0.0182683 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1375  DNA repair ATPase  36.78 
 
 		 814 aa  57.8  0.0000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000000366162  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1332  SMC domain-containing protein  34.95 
 
 		 993 aa  57.8  0.0000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2951  SMC domain protein  25.18 
 
 		 1031 aa  57.4  0.0000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00128287  unclonable  0.000000102622 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3541  exonuclease SbcC  36.78 
 
 		 1003 aa  57.4  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.757761  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1725  nuclease SbcCD, C subunit, putative  34.83 
 
 		 813 aa  57.4  0.0000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.536729  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0360  chromosome segregation protein  47.27 
 
 		 1074 aa  57.4  0.0000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0237  SMC domain-containing protein  34.95 
 
 		 993 aa  57  0.0000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0769992  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2301  SMC domain protein  32.58 
 
 		 987 aa  57  0.0000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1722  SMC domain-containing protein  28.03 
 
 		 580 aa  56.2  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.198567  hitchhiker  0.0000514519 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0037  RecF/RecN/SMC domain-containing protein  29.94 
 
 		 638 aa  55.5  0.000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000359393  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4561  exonuclease SbcC  27.94 
 
 		 1007 aa  55.1  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0068  Rad50 zinc hook domain protein  40.54 
 
 		 864 aa  54.7  0.000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.191393  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1922  SMC domain protein  32.89 
 
 		 987 aa  54.3  0.000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.664102 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0003  DNA replication and repair protein RecF  30.77 
 
 		 370 aa  53.5  0.000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1501  SMC-like protein  34.21 
 
 		 888 aa  53.1  0.00001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_52607  predicted protein  25.51 
 
 		 1232 aa  53.1  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2343  SMC domain protein  37.08 
 
 		 912 aa  53.5  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0823  SMC protein-like protein  28.42 
 
 		 910 aa  52  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.465313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1418  chromosome segregation protein SMC  25.75 
 
 		 1181 aa  52.4  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1350  SMC domain-containing protein  28.08 
 
 		 1174 aa  52  0.00002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2898  chromosome segregation protein  36.25 
 
 		 891 aa  52.8  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1495  SMC domain protein  35.44 
 
 		 895 aa  52  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1874  SMC domain protein  41.56 
 
 		 1021 aa  51.6  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3179  SMC domain-containing protein  32.99 
 
 		 1023 aa  52  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0019664  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0015  DNA replication and repair protein RecF  39.73 
 
 		 340 aa  52  0.00003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.486493  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4583  RecF/RecN/SMC N domain, putative  27.45 
 
 		 875 aa  52  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0004  DNA replication and repair protein RecF  41.82 
 
 		 353 aa  52  0.00003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000383314  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0905  SMC domain-containing protein  33.75 
 
 		 1022 aa  51.2  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.995306  hitchhiker  0.000299578 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1142  SMC domain protein  46.15 
 
 		 857 aa  51.2  0.00004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1709  exonuclease SbcC  33.73 
 
 		 1008 aa  50.8  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1081  SMC domain-containing protein  33.33 
 
 		 804 aa  51.2  0.00005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000660429  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0696  exonuclease SbcC  32.97 
 
 		 1007 aa  50.8  0.00006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0985  SMC domain-containing protein  23.08 
 
 		 702 aa  50.4  0.00008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000497741 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0762  SMC domain-containing protein  25.2 
 
 		 858 aa  50.4  0.00008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0108669  decreased coverage  0.00239369 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1362  DNA replication and repair protein RecF  29.63 
 
 		 339 aa  50.1  0.00009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0004  recombination protein F  29.09 
 
 		 401 aa  50.1  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.582462  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0525  SMC domain-containing protein  34.57 
 
 		 859 aa  49.7  0.0001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0315541  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0711  SMC domain-containing protein  31.37 
 
 		 994 aa  50.1  0.0001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.00173757  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_490  DNA repair ATPase  33.33 
 
 		 859 aa  48.9  0.0002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.0000109294  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1688  hypothetical protein  34.43 
 
 		 427 aa  48.9  0.0002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00694516  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4093  SMC domain-containing protein  32.1 
 
 		 1022 aa  48.9  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.240758  normal  0.708538 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1882  SMC domain-containing protein  26.67 
 
 		 805 aa  48.9  0.0002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0300452  normal  0.0368515 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0643  chromosome segregation protein SMC  26.07 
 
 		 1185 aa  48.9  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.126357  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05899  Condensin subunit [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8J150]  22.3 
 
 		 1179 aa  48.5  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.566819 
 
 
-
 
NC_002936  DET0549  exonuclease SbcC, putative  33.33 
 
 		 859 aa  48.1  0.0003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2437  SMC domain protein  30.86 
 
 		 924 aa  48.5  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1915  SMC domain protein  46.15 
 
 		 815 aa  48.1  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00125008  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1535  hypothetical protein  46 
 
 		 457 aa  48.1  0.0004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0940  DNA replication and repair protein RecF  34.33 
 
 		 355 aa  47.8  0.0005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0630  hypothetical protein  30.56 
 
 		 513 aa  47.8  0.0005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3009  exonuclease SbcC  40.38 
 
 		 1008 aa  47.4  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.291694  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4848  ATP-dependent OLD family endonuclease  39.58 
 
 		 626 aa  47.4  0.0006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3111  exonuclease SbcC  42.55 
 
 		 1008 aa  47.4  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4596  hypothetical protein  38.89 
 
 		 879 aa  47.4  0.0007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0852353  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0371  chromosome segregation protein  31.25 
 
 		 890 aa  47  0.0008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND03960  DNA repair-related protein, putative  28.36 
 
 		 1125 aa  46.2  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4641  ATP-dependent endonuclease  39.58 
 
 		 626 aa  47  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.01769  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2480  SMC domain-containing protein  40.82 
 
 		 699 aa  46.6  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000187418  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0889  chromosome segregation protein SMC  28.57 
 
 		 1153 aa  46.6  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0518869  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0939  SMC domain-containing protein  38.89 
 
 		 812 aa  46.2  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0924914  normal  0.567341 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1549  DNA replication and repair protein RecF  25.97 
 
 		 359 aa  46.2  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.638976  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1626  SMC domain protein  26.96 
 
 		 978 aa  46.2  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0004  recombination protein F  28.18 
 
 		 402 aa  46.2  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000215476 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0181  chromosome segregation protein  29.66 
 
 		 902 aa  46.6  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0003  DNA replication and repair protein RecF  26.4 
 
 		 415 aa  45.4  0.002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000000951254  normal  0.107465 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0302  SMC domain-containing protein  32.5 
 
 		 702 aa  46.2  0.002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2553  SMC domain protein  29.5 
 
 		 829 aa  45.4  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0498  SMC domain-containing protein  35 
 
 		 642 aa  45.4  0.002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.29132  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0748  SMC domain-containing protein  48.94 
 
 		 935 aa  45.8  0.002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.874201  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2443  chromosome segregation protein SMC  31.33 
 
 		 1185 aa  45.8  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.211812  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1341  chromosome segregation protein SMC  44.9 
 
 		 1196 aa  45.8  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4711  ATP-dependent endonuclease of the OLD family- like protein  36.73 
 
 		 648 aa  45.4  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0002  RecF protein  25.23 
 
 		 369 aa  45.1  0.003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000642266  normal  0.645599 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0257  hypothetical protein  41.67 
 
 		 159 aa  45.1  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00160125  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0448  SMC protein-like protein  27.4 
 
 		 955 aa  45.1  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.507994  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0884  SMC domain-containing protein  37.5 
 
 		 790 aa  45.1  0.003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.922995  normal  0.368139 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0467  SMC domain-containing protein  43.75 
 
 		 1280 aa  45.1  0.003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2377  hypothetical protein  30.77 
 
 		 581 aa  45.4  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.169203  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2167  SMC domain-containing protein  28.92 
 
 		 1029 aa  45.1  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0876433  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0917  SMC domain protein  24.34 
 
 		 1180 aa  45.1  0.003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_54192  predicted protein  22.73 
 
 		 1099 aa  45.4  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2736  chromosome segregation protein SMC  42.86 
 
 		 1188 aa  45.4  0.003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2201  hypothetical protein  40.74 
 
 		 690 aa  44.7  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.668811  normal  0.078416 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2151  hypothetical protein  39.62 
 
 		 690 aa  44.7  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1213  SMC domain-containing protein  31.68 
 
 		 806 aa  44.7  0.004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_25506  predicted protein  46 
 
 		 1237 aa  44.7  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3199  hypothetical protein  37.74 
 
 		 693 aa  44.7  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2920  hypothetical protein  37.74 
 
 		 693 aa  44.7  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0318  condensin subunit Smc  43.14 
 
 		 1307 aa  44.3  0.005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0224  ATPase  36.14 
 
 		 352 aa  44.3  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0363611 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0349  SMC protein-like  43.14 
 
 		 1318 aa  44.3  0.005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0772  SMC domain protein  29.73 
 
 		 961 aa  44.3  0.005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00238509  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>