208 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B0257 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B0257  hypothetical protein  100 
 
 		 159 aa  326  1.0000000000000001e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00160125  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4641  ATP-dependent endonuclease  77.78 
 
 		 626 aa  245  2e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.01769  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4848  ATP-dependent OLD family endonuclease  65.25 
 
 		 626 aa  201  4e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4711  ATP-dependent endonuclease of the OLD family- like protein  51.03 
 
 		 648 aa  143  1e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3711  SMC domain protein  33.72 
 
 		 653 aa  77.8  0.00000000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0505  ATP-dependent endonuclease, OLD family protein  30.34 
 
 		 663 aa  72.8  0.000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0949649  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3140  ATP-dependent endonuclease, OLD family protein  31.54 
 
 		 681 aa  67.8  0.00000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.239895  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2624  hypothetical protein  32.24 
 
 		 505 aa  58.9  0.00000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0630  hypothetical protein  35.29 
 
 		 513 aa  55.1  0.0000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2994  ATP-dependent OLD family endonuclease  35.06 
 
 		 608 aa  54.3  0.0000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02258  hypothetical protein  33.63 
 
 		 626 aa  54.3  0.0000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3650  hypothetical protein  53.06 
 
 		 426 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.574815  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1302  ATP-dependent OLD family endonuclease  35.44 
 
 		 634 aa  52  0.000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.314426  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6914  initiation factor 2 associated domain-containing protein  44.19 
 
 		 680 aa  51.6  0.000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.622246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3087  ATP-dependent OLD family endonuclease  32.41 
 
 		 605 aa  51.6  0.000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3445  hypothetical protein  38.46 
 
 		 628 aa  50.8  0.000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.919866  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1846  ATP-dependent OLD family endonuclease  28.89 
 
 		 589 aa  49.3  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000147928 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2627  hypothetical protein  40 
 
 		 347 aa  48.9  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4083  ATP-dependent OLD family endonuclease  32.91 
 
 		 566 aa  48.5  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.186045  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1387  ATPase-like protein  47.5 
 
 		 392 aa  48.5  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.365214  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0949  hypothetical protein  43.1 
 
 		 603 aa  48.1  0.00005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1111  ATP-dependent OLD family endonuclease  42.55 
 
 		 603 aa  48.1  0.00005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3680  hypothetical protein  39.44 
 
 		 667 aa  47.8  0.00006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.228767  hitchhiker  0.00106717 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3452  hypothetical protein  29.46 
 
 		 519 aa  47.8  0.00006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0886  ATP-dependent endonuclease of the OLD family-like protein  35.23 
 
 		 579 aa  47.8  0.00007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0477165  normal  0.341394 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0294  ATP-dependent endonuclease, OLD family  34.92 
 
 		 773 aa  47.4  0.00008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0724498 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4449  ATP-dependent endonuclease of the OLD family-like protein  32.97 
 
 		 564 aa  47.4  0.00009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5825  SMC domain protein  41.86 
 
 		 369 aa  46.6  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.408353 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1087  ATP-dependent OLD family endonuclease  36.9 
 
 		 616 aa  47  0.0001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.14427  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0144  putative RecF protein  44.19 
 
 		 132 aa  46.2  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6911  ATP-dependent OLD family endonuclease  34.43 
 
 		 669 aa  46.2  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0857845  hitchhiker  0.000559752 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4276  Fis family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 645 aa  46.2  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.237058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0586  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  42.19 
 
 		 272 aa  46.2  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.518906 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2161  hypothetical protein  48.57 
 
 		 392 aa  45.4  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.587323  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1418  chromosome segregation protein SMC  40 
 
 		 1181 aa  45.4  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1844  ATP-dependent OLD family endonuclease  45.24 
 
 		 640 aa  45.4  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1541  hypothetical protein  40.91 
 
 		 131 aa  45.1  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0141757 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0863  hypothetical protein  35.87 
 
 		 223 aa  45.1  0.0004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.172073 
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_3009  SMC domain protein  41.67 
 
 		 514 aa  45.1  0.0004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5187  ATPase-like  42.5 
 
 		 391 aa  45.1  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.633614 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3923  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  51.11 
 
 		 258 aa  45.1  0.0004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1824  ATPase-like protein  42.5 
 
 		 391 aa  45.1  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.248078  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5526  hypothetical protein  29.51 
 
 		 384 aa  45.1  0.0004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.768664  normal  0.0253524 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07370  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  40 
 
 		 301 aa  45.1  0.0004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.171579  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1796  ATPase-like protein  42.5 
 
 		 391 aa  45.1  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0870  ATP-dependent OLD family endonuclease  32.91 
 
 		 591 aa  44.7  0.0005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1849  SMC domain protein  36.62 
 
 		 422 aa  44.7  0.0005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6192  ATPase-like  42.5 
 
 		 391 aa  44.7  0.0006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1910  ATPase-like protein  42.5 
 
 		 391 aa  44.7  0.0006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00358131 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1887  ATPase-like protein  42.5 
 
 		 391 aa  44.7  0.0006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0944  SMC protein-like protein  35.29 
 
 		 483 aa  44.3  0.0006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.665094  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7563  ATPase-like protein  38.46 
 
 		 409 aa  44.3  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0586  SMC domain-containing protein  37.74 
 
 		 993 aa  44.7  0.0006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.594919  normal  0.0182683 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2281  ATPase  35.29 
 
 		 390 aa  44.3  0.0007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2379  chromosome segregation protein SMC  43.48 
 
 		 1141 aa  44.3  0.0007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.882333  unclonable  0.00000367062 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1737  ABC transporter related  33.64 
 
 		 284 aa  43.9  0.0008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0324533  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1811  hypothetical protein  42.5 
 
 		 390 aa  43.9  0.0009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.93186  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1858  hypothetical protein  42.5 
 
 		 390 aa  43.9  0.0009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.111795 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3552  hypothetical protein  46 
 
 		 416 aa  43.9  0.0009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2851  SMC domain protein  37.5 
 
 		 423 aa  43.9  0.0009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0808223 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2831  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  50 
 
 		 273 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.830296 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1709  exonuclease SbcC  36.23 
 
 		 1008 aa  43.5  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1362  DNA replication and repair protein RecF  39.58 
 
 		 339 aa  43.5  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0144  ATPase  39.53 
 
 		 565 aa  43.9  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1794  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  44.68 
 
 		 295 aa  43.5  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0186801  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1462  SMC domain protein  33.8 
 
 		 423 aa  43.9  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3132  ABC transporter-related protein  43.18 
 
 		 272 aa  43.5  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.318916  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0112  hypothetical protein  47.06 
 
 		 430 aa  43.9  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3540  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  43.18 
 
 		 258 aa  43.1  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.702552  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3292  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  50 
 
 		 273 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1514  ATPase-like protein  40.91 
 
 		 131 aa  43.9  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5469  hypothetical protein  40.32 
 
 		 763 aa  43.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.913319  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1792  hypothetical protein  42.5 
 
 		 390 aa  43.9  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.118132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4312  hypothetical protein  42.5 
 
 		 388 aa  43.1  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1599  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  38.46 
 
 		 278 aa  43.5  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4154  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  39.39 
 
 		 272 aa  43.9  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.914841  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1249  ABC transporter, ATP-binding protein  31.03 
 
 		 323 aa  42.7  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3412  putative branched chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  36.67 
 
 		 260 aa  43.1  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1399  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  51.22 
 
 		 273 aa  42.7  0.002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.5206 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0224  phosphate ABC transporter, ATP-binding protein  45.83 
 
 		 259 aa  42.7  0.002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0355  phosphate transporter ATP-binding protein  48.94 
 
 		 258 aa  42.7  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.584479  normal  0.0138641 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1080  hypothetical protein  43.48 
 
 		 369 aa  42.7  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.629407  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0013  RecF/RecN/SMC domain protein  26.42 
 
 		 362 aa  43.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2516  chromosome segregation protein SMC  39.13 
 
 		 1138 aa  42.7  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0576231  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1774  chromosome segregation protein SMC  41.3 
 
 		 1164 aa  43.1  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.21183  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1592  chromosome segregation protein, Smc family protein  33.66 
 
 		 1178 aa  42.7  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00176998  normal  0.493606 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3877  exonuclease SbcC  35.21 
 
 		 1016 aa  43.1  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.371142  normal  0.0827458 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2463  chromosome segregation protein SMC  41.3 
 
 		 1144 aa  42.7  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000141924  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54090  hypothetical protein  47.37 
 
 		 387 aa  42.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60070  hypothetical protein  36 
 
 		 807 aa  42.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.0000000312719  hitchhiker  0.0000000420342 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1484  SMC domain-containing protein  36.84 
 
 		 1061 aa  42.7  0.002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0728646  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0779  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  40.35 
 
 		 248 aa  42.7  0.002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1691  SMC domain protein  42.86 
 
 		 385 aa  43.1  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.253328  hitchhiker  0.000000699352 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1332  SMC domain-containing protein  35.85 
 
 		 993 aa  42.7  0.002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0696  exonuclease SbcC  36.76 
 
 		 1007 aa  43.1  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1290  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  42.31 
 
 		 261 aa  42.7  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2727  ATP-dependent OLD family endonuclease  30.86 
 
 		 607 aa  42.7  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2267  phosphate transporter ATP-binding protein  41.67 
 
 		 303 aa  42.4  0.002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0711  SMC domain-containing protein  44.44 
 
 		 994 aa  42.7  0.002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.00173757  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4732  hypothetical protein  47.37 
 
 		 387 aa  43.1  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>