160 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_4641 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_4641  ATP-dependent endonuclease  100 
 
 		 626 aa  1279    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.01769  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4848  ATP-dependent OLD family endonuclease  72.8 
 
 		 626 aa  939    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4711  ATP-dependent endonuclease of the OLD family- like protein  45.16 
 
 		 648 aa  499  1e-140  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0257  hypothetical protein  77.78 
 
 		 159 aa  245  1.9999999999999999e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00160125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3140  ATP-dependent endonuclease, OLD family protein  31.91 
 
 		 681 aa  219  8.999999999999998e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.239895  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0505  ATP-dependent endonuclease, OLD family protein  27.19 
 
 		 663 aa  208  2e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0949649  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3711  SMC domain protein  29.03 
 
 		 653 aa  191  4e-47  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1846  ATP-dependent OLD family endonuclease  24.07 
 
 		 589 aa  111  4.0000000000000004e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000147928 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1111  ATP-dependent OLD family endonuclease  24.09 
 
 		 603 aa  92  3e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4449  ATP-dependent endonuclease of the OLD family-like protein  23.16 
 
 		 564 aa  90.9  7e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2727  ATP-dependent OLD family endonuclease  22.55 
 
 		 607 aa  87  9e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0801  SMC domain protein  24.06 
 
 		 564 aa  80.5  0.00000000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.779455  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1866  ATP-dependent OLD family endonuclease  28.27 
 
 		 595 aa  78.2  0.0000000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2624  hypothetical protein  25.12 
 
 		 505 aa  77.8  0.0000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3363  hypothetical protein  22.37 
 
 		 607 aa  75.1  0.000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.194578  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3567  OLD family ATP-dependent endonuclease-like protein  28.85 
 
 		 604 aa  65.9  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.274046 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003289  pathogenesis related protein  21.43 
 
 		 714 aa  66.2  0.000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.31747  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1844  ATP-dependent OLD family endonuclease  23.15 
 
 		 640 aa  64.3  0.000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3087  ATP-dependent OLD family endonuclease  26.54 
 
 		 605 aa  64.3  0.000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1087  ATP-dependent OLD family endonuclease  21 
 
 		 616 aa  62.8  0.00000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.14427  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1497  ATP-dependent OLD family endonuclease  22.6 
 
 		 573 aa  62.4  0.00000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0673  ATP-dependent endonuclease family protein  26.13 
 
 		 619 aa  60.8  0.00000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.924756 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2518  ATP-dependent OLD family endonuclease  25.44 
 
 		 613 aa  60.1  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0215068  normal  0.744672 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0870  ATP-dependent OLD family endonuclease  20.55 
 
 		 591 aa  59.7  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0571  ATP-dependent OLD family endonuclease  24.39 
 
 		 614 aa  58.9  0.0000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3445  hypothetical protein  27.92 
 
 		 628 aa  58.5  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.919866  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2994  ATP-dependent OLD family endonuclease  36.36 
 
 		 608 aa  58.2  0.0000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0630  hypothetical protein  35.29 
 
 		 513 aa  58.2  0.0000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3056  ATP-dependent endonuclease family protein  25.24 
 
 		 598 aa  57.8  0.0000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3185  ATP-dependent endonuclease family protein  25.91 
 
 		 641 aa  57.4  0.0000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.196277  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0753  ATP-dependent OLD family endonuclease  20.42 
 
 		 594 aa  57  0.000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.362493  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0794  ATP-dependent OLD family endonuclease  24.51 
 
 		 647 aa  55.8  0.000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3650  hypothetical protein  53.06 
 
 		 426 aa  55.1  0.000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.574815  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02258  hypothetical protein  37.25 
 
 		 626 aa  55.1  0.000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6914  initiation factor 2 associated domain-containing protein  46.51 
 
 		 680 aa  53.9  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.622246  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2627  hypothetical protein  41.67 
 
 		 347 aa  52.8  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1302  ATP-dependent OLD family endonuclease  34.18 
 
 		 634 aa  52  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.314426  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6911  ATP-dependent OLD family endonuclease  24.7 
 
 		 669 aa  52  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0857845  hitchhiker  0.000559752 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3452  hypothetical protein  48.98 
 
 		 519 aa  51.6  0.00004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3047  ATP-dependent endonuclease family protein  24.76 
 
 		 598 aa  51.6  0.00004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.300622  normal  0.13978 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0137  hypothetical protein  26.58 
 
 		 666 aa  50.8  0.00007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0744  ATP-dependent OLD family endonuclease  20.19 
 
 		 642 aa  50.8  0.00007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1883  SMC protein-like protein  21.97 
 
 		 688 aa  50.4  0.00009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4083  ATP-dependent OLD family endonuclease  25.61 
 
 		 566 aa  50.4  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.186045  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0949  hypothetical protein  23.18 
 
 		 603 aa  50.1  0.0001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3277  hypothetical protein  24.78 
 
 		 728 aa  49.7  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0296184  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2073  ATPase-like protein  36.67 
 
 		 497 aa  49.3  0.0002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.672394  normal  0.790362 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3680  hypothetical protein  36.9 
 
 		 667 aa  48.9  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.228767  hitchhiker  0.00106717 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1516  ATP-dependent endonuclease family protein  25.93 
 
 		 586 aa  48.9  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.749e-16 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5825  SMC domain protein  46.51 
 
 		 369 aa  48.9  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.408353 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0886  ATP-dependent endonuclease of the OLD family-like protein  25.32 
 
 		 579 aa  48.5  0.0003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0477165  normal  0.341394 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2572  hypothetical protein  24.59 
 
 		 650 aa  48.5  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00339016  normal  0.0605496 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0863  hypothetical protein  35.16 
 
 		 223 aa  48.1  0.0005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.172073 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1709  exonuclease SbcC  31.58 
 
 		 1008 aa  47.8  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0294  ATP-dependent endonuclease, OLD family  28.7 
 
 		 773 aa  48.1  0.0005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0724498 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4276  Fis family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 645 aa  47.8  0.0005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.237058  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1387  ATPase-like protein  47.5 
 
 		 392 aa  48.1  0.0005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.365214  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3543  SMC protein-like  23.77 
 
 		 695 aa  47.8  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.429688 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0546  ATP-dependent OLD family endonuclease  30.65 
 
 		 708 aa  47.8  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1418  chromosome segregation protein SMC  38.18 
 
 		 1181 aa  47.8  0.0007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5526  hypothetical protein  29.69 
 
 		 384 aa  47.8  0.0007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.768664  normal  0.0253524 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0144  putative RecF protein  30.61 
 
 		 132 aa  47.4  0.0009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0586  SMC domain-containing protein  37.78 
 
 		 993 aa  47.4  0.0009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.594919  normal  0.0182683 
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_3009  SMC domain protein  39.58 
 
 		 514 aa  47  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0143  ATP-dependent OLD family endonuclease  30.91 
 
 		 681 aa  46.6  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.128728  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1811  hypothetical protein  47.5 
 
 		 390 aa  46.6  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.93186  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3807  hypothetical protein  25.12 
 
 		 691 aa  46.6  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0465768  normal  0.185185 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0112  hypothetical protein  43.28 
 
 		 430 aa  47  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1858  hypothetical protein  47.5 
 
 		 390 aa  46.6  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.111795 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1317  hypothetical protein  39.13 
 
 		 388 aa  46.6  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.361107  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0944  SMC protein-like protein  36.73 
 
 		 483 aa  47  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.665094  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1792  hypothetical protein  47.5 
 
 		 390 aa  46.6  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.118132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2379  chromosome segregation protein SMC  41.67 
 
 		 1141 aa  47  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.882333  unclonable  0.00000367062 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1120  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  30.43 
 
 		 266 aa  46.6  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.721216  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2051  SMC domain protein  37.7 
 
 		 1080 aa  47  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.380302  normal  0.930097 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1362  DNA replication and repair protein RecF  39.58 
 
 		 339 aa  46.6  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2422  hypothetical protein  36.36 
 
 		 442 aa  46.6  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1462  SMC domain protein  36.62 
 
 		 423 aa  45.8  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2281  ATPase  32.26 
 
 		 390 aa  45.8  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3224  ATP-dependent OLD family endonuclease  24.88 
 
 		 615 aa  45.8  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2516  chromosome segregation protein SMC  37.5 
 
 		 1138 aa  45.8  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0576231  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3877  exonuclease SbcC  35.14 
 
 		 1016 aa  46.2  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.371142  normal  0.0827458 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3540  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  39.29 
 
 		 258 aa  45.8  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.702552  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1849  SMC domain protein  36.62 
 
 		 422 aa  46.2  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4435  hypothetical protein  33.78 
 
 		 885 aa  46.2  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.149901  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0225  ATP-dependent OLD family endonuclease  29.11 
 
 		 578 aa  46.6  0.002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000140656 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1535  RloH  27.03 
 
 		 588 aa  45.8  0.002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.000290266  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1915  ATP-dependent endonuclease of the OLD family- like protein  27.68 
 
 		 529 aa  46.2  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1604  hypothetical protein  31.18 
 
 		 685 aa  45.8  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0681  overcoming lysogenization defect protein  24.02 
 
 		 696 aa  46.2  0.002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0696  exonuclease SbcC  32.86 
 
 		 1007 aa  46.2  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1399  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  41.94 
 
 		 273 aa  45.4  0.003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.5206 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2222  phosphate transporter ATP-binding protein  35.82 
 
 		 264 aa  45.8  0.003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.150141 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1774  chromosome segregation protein SMC  39.58 
 
 		 1164 aa  45.4  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.21183  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1564  condensin subunit Smc  32.14 
 
 		 1185 aa  45.4  0.003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2264  hypothetical protein  27.78 
 
 		 385 aa  45.4  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  unclonable  0.000000152095  unclonable  0.0000000148287 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0237  SMC domain-containing protein  35.56 
 
 		 993 aa  45.4  0.003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0769992  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0586  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  47.92 
 
 		 272 aa  45.8  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.518906 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1794  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  41.07 
 
 		 295 aa  45.8  0.003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0186801  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1332  SMC domain-containing protein  35.56 
 
 		 993 aa  45.4  0.003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>