More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_0939 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_0939  SMC domain-containing protein  100 
 
 		 812 aa  1622    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0924914  normal  0.567341 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1617  SMC domain-containing protein  45.58 
 
 		 1057 aa  259  2e-67  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0948  SMC domain protein  27.88 
 
 		 789 aa  196  1e-48  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.217826  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1484  SMC domain-containing protein  28.69 
 
 		 1061 aa  137  9.999999999999999e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0728646  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1725  nuclease SbcCD, C subunit, putative  25.79 
 
 		 813 aa  102  3e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.536729  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1375  DNA repair ATPase  24.77 
 
 		 814 aa  99  3e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000000366162  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0762  SMC domain-containing protein  22.76 
 
 		 858 aa  97.4  9e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0108669  decreased coverage  0.00239369 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0448  SMC protein-like protein  37.14 
 
 		 955 aa  91.7  5e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.507994  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1332  SMC domain-containing protein  33.67 
 
 		 993 aa  90.1  2e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0586  SMC domain-containing protein  33.67 
 
 		 993 aa  88.6  4e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.594919  normal  0.0182683 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0237  SMC domain-containing protein  33.16 
 
 		 993 aa  87.4  8e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0769992  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0711  SMC domain-containing protein  33.13 
 
 		 994 aa  84.7  0.000000000000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.00173757  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0549  exonuclease SbcC, putative  23.45 
 
 		 859 aa  82.4  0.00000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1142  SMC domain protein  21.58 
 
 		 857 aa  82.4  0.00000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0961  SMC domain protein  24.02 
 
 		 891 aa  80.5  0.0000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000356641  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0181  chromosome segregation protein  32.75 
 
 		 902 aa  80.1  0.0000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0652  SMC domain-containing protein  30.49 
 
 		 1019 aa  78.2  0.0000000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.105285  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2898  chromosome segregation protein  27.8 
 
 		 891 aa  77.8  0.0000000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1495  SMC domain protein  30.94 
 
 		 895 aa  72.8  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0018  SMC domain protein  22.99 
 
 		 862 aa  72  0.00000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0623828 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0371  chromosome segregation protein  31.07 
 
 		 890 aa  71.2  0.00000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1819  SMC domain-containing protein  29.28 
 
 		 702 aa  70.9  0.00000000008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  decreased coverage  0.000524613  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0823  SMC protein-like protein  28.36 
 
 		 910 aa  69.3  0.0000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.465313  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1501  SMC-like protein  26.9 
 
 		 888 aa  68.9  0.0000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2437  SMC domain protein  29.28 
 
 		 924 aa  67.4  0.0000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0985  SMC domain-containing protein  29.94 
 
 		 702 aa  67.4  0.000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000497741 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2301  SMC domain protein  29.79 
 
 		 987 aa  65.5  0.000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1574  SMC domain-containing protein  29.33 
 
 		 840 aa  65.1  0.000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0162335  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0360  chromosome segregation protein  26.32 
 
 		 1074 aa  64.7  0.000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3179  SMC domain-containing protein  28.68 
 
 		 1023 aa  64.3  0.000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0019664  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0748  SMC domain-containing protein  27.81 
 
 		 935 aa  63.5  0.00000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.874201  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1422  nuclease SbcCD, C subunit, putative  28.29 
 
 		 724 aa  62.8  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1626  SMC domain protein  32.54 
 
 		 978 aa  61.6  0.00000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0696  SMC domain protein  25.55 
 
 		 618 aa  61.2  0.00000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0747  chromosome segregation protein SMC  25.59 
 
 		 1146 aa  60.8  0.00000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.204801  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27300  DNA repair ATPase  29.44 
 
 		 1022 aa  60.5  0.0000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0427932  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2789  SMC domain protein  23.39 
 
 		 926 aa  60.1  0.0000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1922  SMC domain protein  29.26 
 
 		 987 aa  60.5  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.664102 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05654  DNA repair exonuclease  30.52 
 
 		 1018 aa  60.1  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0855  chromosome segregation protein SMC  31.02 
 
 		 1200 aa  58.9  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00379552  normal  0.0307887 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01270  DNA repair ATPase  26.74 
 
 		 1047 aa  58.9  0.0000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1381  chromosome segregation protein SMC  27.92 
 
 		 1184 aa  58.5  0.0000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.530369  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1831  chromosome segregation protein SMC  27.71 
 
 		 1147 aa  58.2  0.0000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0781  chromosome segregation ATPase  28.97 
 
 		 1186 aa  57.8  0.0000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.4951e-20 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0356  SMC domain-containing protein  30.54 
 
 		 700 aa  57.8  0.0000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3877  exonuclease SbcC  27.33 
 
 		 1016 aa  57  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.371142  normal  0.0827458 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0982  SMC domain-containing protein  27.56 
 
 		 906 aa  57  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0052  SMC domain protein  29.41 
 
 		 1049 aa  56.2  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0331  chromosome segregation protein SMC  30.85 
 
 		 1201 aa  56.2  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.535871  normal  0.0329796 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0905  SMC domain-containing protein  28.19 
 
 		 1022 aa  56.2  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.995306  hitchhiker  0.000299578 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0521  SMC domain protein  24.67 
 
 		 1011 aa  56.6  0.000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000033  exonuclease SbcC  28.21 
 
 		 1018 aa  56.2  0.000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00466596  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5583  exonuclease SbcC, putative  26.04 
 
 		 1020 aa  55.8  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0696  exonuclease SbcC  28.57 
 
 		 1007 aa  55.8  0.000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2951  SMC domain protein  36.56 
 
 		 1031 aa  55.8  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00128287  unclonable  0.000000102622 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2384  exonuclease SbcC  26.4 
 
 		 1099 aa  55.8  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00297099  hitchhiker  0.00111486 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3541  exonuclease SbcC  31.73 
 
 		 1003 aa  56.2  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.757761  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1788  DNA repair ATPase-like protein  33.08 
 
 		 901 aa  55.5  0.000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.284461  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1915  SMC domain protein  28.65 
 
 		 815 aa  55.5  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00125008  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2144  DNA repair exonuclease, SbcC  28.87 
 
 		 1006 aa  55.5  0.000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.214587  normal  0.18739 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1882  SMC domain-containing protein  26.52 
 
 		 805 aa  55.1  0.000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0300452  normal  0.0368515 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0454  putative exonuclease SbcC  26.63 
 
 		 1013 aa  55.1  0.000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_490  DNA repair ATPase  39.36 
 
 		 859 aa  55.1  0.000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.0000109294  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0527  SMC domain-containing protein  28.14 
 
 		 784 aa  55.1  0.000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0283  SMC domain protein  27.04 
 
 		 1223 aa  54.7  0.000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2270  chromosome segregation protein SMC  27.36 
 
 		 1147 aa  54.7  0.000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4093  SMC domain-containing protein  38.2 
 
 		 1022 aa  54.7  0.000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.240758  normal  0.708538 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1245  SMC domain-containing protein  24.46 
 
 		 693 aa  54.7  0.000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0480  hypothetical protein  24.9 
 
 		 1194 aa  54.7  0.000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1592  chromosome segregation protein, Smc family protein  29.79 
 
 		 1178 aa  54.3  0.000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00176998  normal  0.493606 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2553  SMC domain protein  26.02 
 
 		 829 aa  54.3  0.000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10415  DNA repair protein Rad18, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G05440)  21.74 
 
 		 1146 aa  53.9  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0107863  hitchhiker  0.00000500177 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1224  nuclease SbcCD, C subunit, putative  24.78 
 
 		 723 aa  53.5  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000926455 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3916  chromosome segregation protein SMC  27.46 
 
 		 1301 aa  53.5  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.581201  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2051  SMC domain protein  34 
 
 		 1080 aa  53.9  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.380302  normal  0.930097 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1199  SMC domain protein  27.01 
 
 		 1134 aa  53.9  0.00001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1257  SMC domain protein  27.85 
 
 		 1019 aa  53.5  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.861215  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4561  exonuclease SbcC  27.03 
 
 		 1007 aa  53.5  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1130  chromosome segregation SMC protein, putative  27.27 
 
 		 1175 aa  52.8  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2130  chromosome segregation protein SMC  28.3 
 
 		 1175 aa  53.5  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1061  hypothetical protein  34 
 
 		 712 aa  53.5  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00298037  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3801  SMC domain-containing protein  34.29 
 
 		 682 aa  53.1  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0420971  hitchhiker  0.000733932 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf735  chromosome segregation ATPase Smc  25.32 
 
 		 978 aa  52.8  0.00002  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2736  chromosome segregation protein SMC  39.71 
 
 		 1188 aa  52.8  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5894  DNA repair ATPase-like protein  28.83 
 
 		 1029 aa  52.4  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0510725  hitchhiker  0.00862936 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3009  exonuclease SbcC  27.16 
 
 		 1008 aa  52.8  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.291694  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3111  exonuclease SbcC  27.16 
 
 		 1008 aa  52.4  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0103  hypothetical protein  27.16 
 
 		 711 aa  52.8  0.00003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1364  ATP-dependent dsDNA exonuclease  25.87 
 
 		 1059 aa  52.8  0.00003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0525  SMC domain-containing protein  38.3 
 
 		 859 aa  52.8  0.00003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0315541  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0302  SMC domain-containing protein  26.95 
 
 		 702 aa  52.4  0.00003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1709  exonuclease SbcC  26.79 
 
 		 1008 aa  52  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3248  condensin subunit Smc  25.97 
 
 		 1167 aa  52  0.00004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3429  chromosome segregation protein SMC  30.33 
 
 		 1218 aa  52  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1341  chromosome segregation protein SMC  26.94 
 
 		 1196 aa  52.4  0.00004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1012  condensin subunit Smc  27.38 
 
 		 1149 aa  52  0.00004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.750966 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0985  chromosome segregation protein SMC  41.82 
 
 		 1191 aa  51.6  0.00005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.112036  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7655  chromosome segregation protein SMC  25.62 
 
 		 1148 aa  51.6  0.00005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00190533  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1167  chromosome segregation protein SMC  28.72 
 
 		 1255 aa  51.6  0.00005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.469719  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1874  SMC domain protein  25.58 
 
 		 1021 aa  51.6  0.00006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>