More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1617 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_1617  SMC domain-containing protein  100 
 
 		 1057 aa  2089    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1484  SMC domain-containing protein  28.07 
 
 		 1061 aa  290  1e-76  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0728646  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0939  SMC domain-containing protein  45.58 
 
 		 812 aa  255  4.0000000000000004e-66  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0924914  normal  0.567341 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0652  SMC domain-containing protein  22.58 
 
 		 1019 aa  120  9.999999999999999e-26  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.105285  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0948  SMC domain protein  25.59 
 
 		 789 aa  115  4.0000000000000004e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.217826  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0237  SMC domain-containing protein  25.92 
 
 		 993 aa  102  3e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0769992  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0711  SMC domain-containing protein  20.06 
 
 		 994 aa  100  1e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.00173757  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0586  SMC domain-containing protein  25.52 
 
 		 993 aa  97.4  1e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.594919  normal  0.0182683 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0448  SMC protein-like protein  33.52 
 
 		 955 aa  96.3  3e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.507994  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1332  SMC domain-containing protein  27.89 
 
 		 993 aa  95.5  5e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2951  SMC domain protein  23.77 
 
 		 1031 aa  84  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00128287  unclonable  0.000000102622 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0181  chromosome segregation protein  27.36 
 
 		 902 aa  81.3  0.00000000000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2898  chromosome segregation protein  27.21 
 
 		 891 aa  80.1  0.0000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1495  SMC domain protein  27 
 
 		 895 aa  79.7  0.0000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1819  SMC domain-containing protein  31 
 
 		 702 aa  79.3  0.0000000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  decreased coverage  0.000524613  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2437  SMC domain protein  27.76 
 
 		 924 aa  78.6  0.0000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4561  exonuclease SbcC  20.13 
 
 		 1007 aa  78.6  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05654  DNA repair exonuclease  25.26 
 
 		 1018 aa  75.5  0.000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0961  SMC domain protein  21.19 
 
 		 891 aa  73.2  0.00000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000356641  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1081  SMC domain-containing protein  25.59 
 
 		 804 aa  72.8  0.00000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000660429  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000033  exonuclease SbcC  24.23 
 
 		 1018 aa  71.6  0.00000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00466596  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2789  SMC domain protein  25.57 
 
 		 926 aa  71.2  0.00000000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0360  chromosome segregation protein  27.65 
 
 		 1074 aa  71.2  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0302  SMC domain-containing protein  29.25 
 
 		 702 aa  70.5  0.0000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2305  SMC domain protein  28.11 
 
 		 1025 aa  70.5  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000506659 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0068  Rad50 zinc hook domain protein  23.38 
 
 		 864 aa  69.3  0.0000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.191393  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1257  SMC domain protein  25.24 
 
 		 1019 aa  68.9  0.0000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.861215  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0371  chromosome segregation protein  28.47 
 
 		 890 aa  68.2  0.0000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1574  SMC domain-containing protein  30.53 
 
 		 840 aa  68.2  0.0000000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0162335  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2553  SMC domain protein  34.65 
 
 		 829 aa  67.8  0.000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2384  exonuclease SbcC  26.02 
 
 		 1099 aa  67.4  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00297099  hitchhiker  0.00111486 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1422  nuclease SbcCD, C subunit, putative  25.4 
 
 		 724 aa  66.6  0.000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1501  SMC-like protein  24.5 
 
 		 888 aa  66.2  0.000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27300  DNA repair ATPase  30.49 
 
 		 1022 aa  66.2  0.000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0427932  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1300  SMC domain-containing protein  30.14 
 
 		 852 aa  65.9  0.000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.975813  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04030  Exodeoxyribonuclease I subunit C  23.16 
 
 		 1108 aa  65.9  0.000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0894457  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1155  SMC domain-containing protein  30.14 
 
 		 852 aa  65.9  0.000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0052  SMC domain protein  24.54 
 
 		 1049 aa  65.5  0.000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2326  putative exonuclease  21.36 
 
 		 1029 aa  65.5  0.000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.678825  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0985  SMC domain-containing protein  26.77 
 
 		 702 aa  64.7  0.000000008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000497741 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1142  SMC domain protein  26.01 
 
 		 857 aa  63.9  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1874  SMC domain protein  22.46 
 
 		 1021 aa  63.9  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4093  SMC domain-containing protein  26.19 
 
 		 1022 aa  63.2  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.240758  normal  0.708538 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1224  nuclease SbcCD, C subunit, putative  25.62 
 
 		 723 aa  62.4  0.00000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000926455 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2301  SMC domain protein  27.08 
 
 		 987 aa  62  0.00000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1245  SMC domain-containing protein  26.16 
 
 		 693 aa  62  0.00000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2461  putative exonuclease  21.23 
 
 		 1029 aa  62.4  0.00000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000696116  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2736  chromosome segregation protein SMC  27.25 
 
 		 1188 aa  62  0.00000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1831  chromosome segregation protein SMC  27.22 
 
 		 1147 aa  62.4  0.00000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0747  chromosome segregation protein SMC  27.59 
 
 		 1146 aa  61.6  0.00000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.204801  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0655  condensin subunit Smc  32.07 
 
 		 1183 aa  61.6  0.00000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0905  SMC domain-containing protein  29.96 
 
 		 1022 aa  61.2  0.00000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.995306  hitchhiker  0.000299578 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0762  SMC domain-containing protein  26.13 
 
 		 858 aa  61.2  0.0000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0108669  decreased coverage  0.00239369 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0525  SMC domain-containing protein  26.44 
 
 		 859 aa  60.8  0.0000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0315541  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4031  SMC domain-containing protein  26.92 
 
 		 810 aa  61.2  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.515725  normal  0.378288 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1915  SMC domain protein  26.97 
 
 		 815 aa  61.2  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00125008  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2480  SMC domain-containing protein  25.85 
 
 		 699 aa  60.5  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000187418  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3541  exonuclease SbcC  32.74 
 
 		 1003 aa  60.1  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.757761  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1922  SMC domain protein  25.87 
 
 		 987 aa  60.1  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.664102 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3179  SMC domain-containing protein  40 
 
 		 1023 aa  60.5  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0019664  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0216  chromosome segregation protein SMC  32.61 
 
 		 1181 aa  59.7  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2391  exonuclease, putative  21.33 
 
 		 1029 aa  59.3  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.15331  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1315  SMC domain protein  25.69 
 
 		 1223 aa  59.3  0.0000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.082994  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2776  chromosome segregation protein SMC  30.05 
 
 		 1234 aa  59.3  0.0000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.371529  normal  0.187776 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1890  DNA repair exonuclease, SbcC  28.24 
 
 		 989 aa  58.9  0.0000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.295467  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0823  SMC protein-like protein  29.27 
 
 		 910 aa  58.9  0.0000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.465313  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1213  SMC domain-containing protein  26.92 
 
 		 806 aa  58.9  0.0000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1551  SMC domain-containing protein  31.33 
 
 		 1074 aa  58.9  0.0000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00625316 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1736  SMC domain-containing protein  25.82 
 
 		 1029 aa  58.5  0.0000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0965884  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_490  DNA repair ATPase  25.13 
 
 		 859 aa  58.5  0.0000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.0000109294  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0549  exonuclease SbcC, putative  32.41 
 
 		 859 aa  58.2  0.0000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3877  exonuclease SbcC  20.49 
 
 		 1016 aa  58.5  0.0000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.371142  normal  0.0827458 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6131  SMC domain protein  30.41 
 
 		 851 aa  58.5  0.0000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.983245 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7990  chromosome segregation SMC protein  30.65 
 
 		 1227 aa  58.2  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.900943  normal  0.462175 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2167  SMC domain-containing protein  23.65 
 
 		 1029 aa  58.2  0.0000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0876433  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1592  chromosome segregation protein, Smc family protein  36.36 
 
 		 1178 aa  57.8  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00176998  normal  0.493606 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0855  SMC domain protein  23.72 
 
 		 802 aa  57  0.000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.128097  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1571  chromosome segregation protein SMC  32.21 
 
 		 1170 aa  57  0.000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1570  condensin subunit Smc  30.98 
 
 		 1188 aa  57  0.000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.069704 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1390  chromosome segregation protein SMC  27.96 
 
 		 1191 aa  57  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0475682 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1637  chromosome segregation protein SMC  32.21 
 
 		 1170 aa  56.6  0.000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0219  chromosome segregation ATPase  26.03 
 
 		 1225 aa  56.6  0.000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8008  chromosome segregation protein SMC  27.18 
 
 		 1224 aa  56.2  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2822  SMC domain-containing protein  25.75 
 
 		 1020 aa  56.2  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1268  exonuclease SbcC, putative  25.43 
 
 		 1020 aa  56.6  0.000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0566832  hitchhiker  0.000365685 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1626  SMC domain protein  29.84 
 
 		 978 aa  55.8  0.000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2136  exonuclease SbcC  25.82 
 
 		 1029 aa  55.8  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.142558  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2122  exonuclease  25.82 
 
 		 1029 aa  55.8  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.837048  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0953  condensin subunit Smc  34.4 
 
 		 1187 aa  55.8  0.000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0696  SMC domain protein  28.32 
 
 		 618 aa  55.8  0.000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2051  SMC domain protein  32.32 
 
 		 1080 aa  56.2  0.000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.380302  normal  0.930097 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2199  exonuclease  25.82 
 
 		 1029 aa  55.5  0.000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2360  exonuclease  25.82 
 
 		 1029 aa  55.5  0.000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.293135  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2379  putative exonuclease  25.82 
 
 		 1029 aa  55.8  0.000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0124  putative exonuclease  27.46 
 
 		 1046 aa  55.5  0.000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0895241  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1730  exonuclease  25.99 
 
 		 1223 aa  55.1  0.000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0842079  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1159  chromosome segregation protein SMC  30.43 
 
 		 1203 aa  55.1  0.000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2456  SMC domain-containing protein  24.62 
 
 		 1018 aa  55.1  0.000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.053709  unclonable  0.00000627318 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3429  chromosome segregation protein SMC  30.43 
 
 		 1218 aa  55.1  0.000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2637  SMC domain-containing protein  25.15 
 
 		 1164 aa  55.1  0.000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.257916  normal  0.0339127 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>