245 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_0527 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008698  Tpen_0527  SMC domain-containing protein  100 
 
 		 784 aa  1507    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1882  SMC domain-containing protein  24.94 
 
 		 805 aa  169  1e-40  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0300452  normal  0.0368515 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1637  SMC domain-containing protein  26.67 
 
 		 795 aa  141  4.999999999999999e-32  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1811  SMC domain-containing protein  27.07 
 
 		 794 aa  137  9e-31  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.305534 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0884  SMC domain-containing protein  26.07 
 
 		 790 aa  136  9.999999999999999e-31  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.922995  normal  0.368139 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1444  SMC domain-containing protein  26.35 
 
 		 795 aa  121  3.9999999999999996e-26  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.353031  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0068  Rad50 zinc hook domain protein  22.47 
 
 		 864 aa  82  0.00000000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.191393  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0823  SMC protein-like protein  32.75 
 
 		 910 aa  80.5  0.0000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.465313  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1882  SMC domain protein  27.32 
 
 		 904 aa  79.3  0.0000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.600097  normal  0.549876 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0985  SMC domain-containing protein  24.03 
 
 		 702 aa  74.3  0.000000000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000497741 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1332  SMC domain-containing protein  24.45 
 
 		 993 aa  74.3  0.000000000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0772  SMC domain protein  29.8 
 
 		 961 aa  74.3  0.000000000008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00238509  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0982  SMC domain-containing protein  30.77 
 
 		 906 aa  74.3  0.000000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0961  SMC domain protein  23.55 
 
 		 891 aa  73.6  0.00000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000356641  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0762  SMC domain-containing protein  25.54 
 
 		 858 aa  72.8  0.00000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0108669  decreased coverage  0.00239369 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0586  SMC domain-containing protein  25.1 
 
 		 993 aa  72  0.00000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.594919  normal  0.0182683 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1919  SMC protein, N-terminal  27.15 
 
 		 1155 aa  72  0.00000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0302  SMC domain-containing protein  23.74 
 
 		 702 aa  71.6  0.00000000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1303  SMC domain-containing protein  26.26 
 
 		 1234 aa  70.5  0.0000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11550  ATP-dependent dsDNA exonuclease SbcC  30.67 
 
 		 1137 aa  70.1  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.055976  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0237  SMC domain-containing protein  25.65 
 
 		 993 aa  70.1  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0769992  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2789  SMC domain protein  23.3 
 
 		 926 aa  68.6  0.0000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000033  exonuclease SbcC  22.42 
 
 		 1018 aa  67  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00466596  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0652  SMC domain-containing protein  29.71 
 
 		 1019 aa  67  0.000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.105285  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1006  SMC domain protein  29.88 
 
 		 1227 aa  65.9  0.000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.817412  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0451  exonuclease subunit SbcC  24.48 
 
 		 1046 aa  65.1  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.8799  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1730  exonuclease  23.89 
 
 		 1223 aa  65.5  0.000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0842079  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0948  SMC domain protein  22.55 
 
 		 789 aa  65.1  0.000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.217826  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1081  SMC domain-containing protein  26.29 
 
 		 804 aa  65.1  0.000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000660429  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1501  SMC-like protein  28.31 
 
 		 888 aa  64.7  0.000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0711  SMC domain-containing protein  22.42 
 
 		 994 aa  64.7  0.000000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.00173757  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3304  exonuclease SbcC  28.4 
 
 		 1227 aa  64.3  0.000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04030  Exodeoxyribonuclease I subunit C  24.25 
 
 		 1108 aa  64.3  0.000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0894457  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1158  SMC domain protein  25.82 
 
 		 1226 aa  64.3  0.000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.1908  normal  0.473044 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3538  SMC domain-containing protein  26.88 
 
 		 1144 aa  64.3  0.000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.862786  normal  0.561749 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0493  exonuclease subunit SbcC  23.88 
 
 		 1046 aa  63.5  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0433  exonuclease subunit SbcC  23.88 
 
 		 1046 aa  63.5  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.2903  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0438  exonuclease subunit SbcC  23.88 
 
 		 1046 aa  63.5  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4031  SMC domain-containing protein  27.78 
 
 		 810 aa  63.2  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.515725  normal  0.378288 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00345  exonuclease, dsDNA, ATP-dependent  26.32 
 
 		 1048 aa  62.8  0.00000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3212  exonuclease SbcC  25.38 
 
 		 1048 aa  63.2  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.223053  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0472  exonuclease subunit SbcC  26.32 
 
 		 1047 aa  62.8  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.227308  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00349  hypothetical protein  26.32 
 
 		 1048 aa  62.8  0.00000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0894  SMC domain-containing protein  28.86 
 
 		 1165 aa  63.2  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.60496  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0084  exonuclease sbcC  24.21 
 
 		 1039 aa  63.2  0.00000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3236  exonuclease subunit SbcC  26.32 
 
 		 1047 aa  62.8  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.528521  hitchhiker  0.0000322457 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0316  exonuclease subunit SbcC  26.32 
 
 		 1047 aa  62.8  0.00000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.53041  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0464  exonuclease subunit SbcC  26.32 
 
 		 1047 aa  62.8  0.00000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28736  predicted protein  27.78 
 
 		 1313 aa  63.2  0.00000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0426  exonuclease subunit SbcC  26.82 
 
 		 1047 aa  62.8  0.00000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.442969  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1039  exonuclease SbcC  26.75 
 
 		 1083 aa  62  0.00000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.772605  normal  0.479303 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0424  exonuclease subunit SbcC  25.94 
 
 		 1047 aa  61.2  0.00000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0448  SMC protein-like protein  31.52 
 
 		 955 aa  61.2  0.00000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.507994  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0207  exonuclease SbcC  28.24 
 
 		 1172 aa  60.8  0.00000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0205  exonuclease SbcC  28.24 
 
 		 1172 aa  61.2  0.00000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.305096  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2570  SMC domain-containing protein  25.82 
 
 		 1230 aa  60.8  0.00000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1245  SMC domain-containing protein  22 
 
 		 693 aa  60.1  0.0000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1819  SMC domain-containing protein  23.9 
 
 		 702 aa  60.5  0.0000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  decreased coverage  0.000524613  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1488  SMC domain protein  30.51 
 
 		 1114 aa  59.7  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1980  SMC domain-containing protein  26.71 
 
 		 1227 aa  60.1  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1495  SMC domain protein  33.33 
 
 		 895 aa  58.9  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0052  SMC domain protein  26.37 
 
 		 1049 aa  59.3  0.0000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0521  SMC domain protein  23.49 
 
 		 1011 aa  58.5  0.0000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2437  SMC domain protein  33.33 
 
 		 924 aa  58.5  0.0000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1399  SMC protein-like  25.11 
 
 		 1303 aa  58.9  0.0000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2451  SMC domain-containing protein  28.02 
 
 		 1232 aa  58.5  0.0000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2355  SMC domain-containing protein  27.44 
 
 		 1247 aa  58.2  0.0000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2822  SMC domain-containing protein  37.14 
 
 		 1020 aa  58.5  0.0000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2637  SMC domain-containing protein  26.01 
 
 		 1164 aa  58.5  0.0000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.257916  normal  0.0339127 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5583  exonuclease SbcC, putative  32.45 
 
 		 1020 aa  57.8  0.0000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0704  ATP-dependent dsDNA exonuclease (SbcC)  25.66 
 
 		 1091 aa  57.8  0.0000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.859038  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1315  SMC domain protein  27.44 
 
 		 1223 aa  57.8  0.0000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.082994  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0865  exonuclease subunit SbcC  28.48 
 
 		 1042 aa  57.8  0.0000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.379439  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0760  SMC domain protein  29.1 
 
 		 1165 aa  57  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000289262  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1496  chromosome partition protein SmC, putative  22.71 
 
 		 980 aa  57  0.000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0360  chromosome segregation protein  29.74 
 
 		 1074 aa  57  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2505  SMC protein-like protein  26.37 
 
 		 1265 aa  57.4  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0217131  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10590  DNA repair ATPase  29.94 
 
 		 1081 aa  57  0.000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.659565  hitchhiker  0.0000000614784 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6131  SMC domain protein  28.57 
 
 		 851 aa  57  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.983245 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5894  DNA repair ATPase-like protein  26.24 
 
 		 1029 aa  57  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0510725  hitchhiker  0.00862936 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2848  exonuclease SbcC  24.35 
 
 		 1308 aa  56.6  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1063  exonuclease SbcCD, C subunit  24.31 
 
 		 1307 aa  56.6  0.000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2080  exonuclease SbcC  26.04 
 
 		 1219 aa  56.6  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0568  SMC domain-containing protein  24.34 
 
 		 1091 aa  56.2  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.564542  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0939  SMC domain-containing protein  22.78 
 
 		 812 aa  55.8  0.000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0924914  normal  0.567341 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03135  exonuclease SbcC  23.7 
 
 		 1238 aa  55.5  0.000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.520091  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3139  nuclease SbcCD, C subunit  27.78 
 
 		 1229 aa  55.5  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.642669  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3278  SMC domain-containing protein  27.78 
 
 		 1229 aa  55.1  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.116021  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0673  SMC domain protein  26.37 
 
 		 1116 aa  55.5  0.000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00700495  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0205  SMC domain-containing protein  27.45 
 
 		 1180 aa  55.1  0.000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3179  SMC domain-containing protein  29.21 
 
 		 1023 aa  55.1  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0019664  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3289  nuclease SbcCD, C subunit  27.78 
 
 		 1220 aa  55.1  0.000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.267466 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0855  SMC domain protein  24.18 
 
 		 802 aa  54.7  0.000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.128097  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1540  SMC domain protein  28.03 
 
 		 1182 aa  55.1  0.000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1354  SMC domain-containing protein  26.54 
 
 		 1224 aa  54.7  0.000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2917  SMC domain protein  26.22 
 
 		 1227 aa  54.7  0.000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.605657  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0748  SMC domain-containing protein  21.73 
 
 		 935 aa  54.7  0.000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.874201  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2898  chromosome segregation protein  34.9 
 
 		 891 aa  54.7  0.000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3108  SMC domain protein  27.15 
 
 		 1227 aa  54.7  0.000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.885936  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0525  SMC domain-containing protein  23.85 
 
 		 859 aa  54.7  0.000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0315541  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>