75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tneu_1444 on replicon NC_010525
Organism: Thermoproteus neutrophilus V24Sta



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009376  Pars_1811  SMC domain-containing protein  65.65 
 
 
794 aa  994    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.305534 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1444  SMC domain-containing protein  100 
 
 
795 aa  1531    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.353031  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0884  SMC domain-containing protein  68.27 
 
 
790 aa  1068    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.922995  normal  0.368139 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1637  SMC domain-containing protein  62.9 
 
 
795 aa  951    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1882  SMC domain-containing protein  31.26 
 
 
805 aa  285  2.0000000000000002e-75  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0300452  normal  0.0368515 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0527  SMC domain-containing protein  26.97 
 
 
784 aa  144  5e-33  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0762  SMC domain-containing protein  23.22 
 
 
858 aa  95.1  5e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0108669  decreased coverage  0.00239369 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0985  SMC domain-containing protein  27.09 
 
 
702 aa  94.4  7e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000497741 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0302  SMC domain-containing protein  26.05 
 
 
702 aa  86.7  0.000000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1819  SMC domain-containing protein  26.96 
 
 
702 aa  85.1  0.000000000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  decreased coverage  0.000524613  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1142  SMC domain protein  24.76 
 
 
857 aa  73.6  0.00000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0356  SMC domain-containing protein  28.81 
 
 
700 aa  72.8  0.00000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1626  SMC domain protein  22.45 
 
 
978 aa  73.2  0.00000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2789  SMC domain protein  23.18 
 
 
926 aa  69.3  0.0000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0961  SMC domain protein  20.48 
 
 
891 aa  70.1  0.0000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000356641  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0586  SMC domain-containing protein  22.64 
 
 
993 aa  66.6  0.000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.594919  normal  0.0182683 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0772  SMC domain protein  26.2 
 
 
961 aa  62.8  0.00000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00238509  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0711  SMC domain-containing protein  25.27 
 
 
994 aa  62.4  0.00000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.00173757  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2437  SMC domain protein  23.17 
 
 
924 aa  60.8  0.0000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0068  Rad50 zinc hook domain protein  21.56 
 
 
864 aa  60.5  0.0000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.191393  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0018  SMC domain protein  23.14 
 
 
862 aa  57.4  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0623828 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0982  SMC domain-containing protein  24.61 
 
 
906 aa  57  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1332  SMC domain-containing protein  21.38 
 
 
993 aa  56.6  0.000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1922  SMC domain protein  27.16 
 
 
987 aa  54.7  0.000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.664102 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0237  SMC domain-containing protein  24.84 
 
 
993 aa  54.3  0.000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0769992  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1213  SMC domain-containing protein  19.45 
 
 
806 aa  53.9  0.00001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0823  SMC protein-like protein  25.89 
 
 
910 aa  53.5  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.465313  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0859  exonuclease SbcC  24.64 
 
 
950 aa  53.5  0.00002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0549  exonuclease SbcC, putative  24.43 
 
 
859 aa  52.8  0.00002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0525  SMC domain-containing protein  25 
 
 
859 aa  53.1  0.00002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0315541  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1882  SMC domain protein  26.67 
 
 
904 aa  52.4  0.00003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.600097  normal  0.549876 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1501  SMC-like protein  27.22 
 
 
888 aa  52.4  0.00003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2305  SMC domain protein  27.47 
 
 
1025 aa  52  0.00004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000506659 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0748  SMC domain-containing protein  21.55 
 
 
935 aa  52.4  0.00004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.874201  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5894  DNA repair ATPase-like protein  24.31 
 
 
1029 aa  52  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0510725  hitchhiker  0.00862936 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1725  nuclease SbcCD, C subunit, putative  26.78 
 
 
813 aa  52  0.00005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.536729  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2573  SMC domain-containing protein  27.13 
 
 
1023 aa  52  0.00005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0084  exonuclease sbcC  21.87 
 
 
1039 aa  52  0.00005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31440  DNA repair ATPase  30.11 
 
 
986 aa  51.6  0.00006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.651152 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_490  DNA repair ATPase  23.86 
 
 
859 aa  51.6  0.00006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.0000109294  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0360  chromosome segregation protein  27.98 
 
 
1074 aa  51.2  0.00007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1199  SMC domain protein  26.84 
 
 
1134 aa  51.2  0.00007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0652  SMC domain-containing protein  23.89 
 
 
1019 aa  50.8  0.0001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.105285  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30705  predicted protein  41.77 
 
 
1225 aa  50.4  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.830885  normal  0.342415 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2570  SMC domain-containing protein  28.07 
 
 
984 aa  49.3  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1085  DNA repair ATPase-like protein  29.21 
 
 
741 aa  48.9  0.0003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0841172  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0448  SMC protein-like protein  30.73 
 
 
955 aa  48.9  0.0004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.507994  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0944  SMC protein-like protein  24.32 
 
 
483 aa  48.9  0.0004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.665094  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2301  SMC domain protein  23.76 
 
 
987 aa  47  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0052  SMC domain protein  23.27 
 
 
1049 aa  47.4  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0708  chromosome segregation protein SMC  23.88 
 
 
1199 aa  47  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.175471  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0171  nuclease SbcCD, C subunit, putative  21.76 
 
 
1030 aa  47  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05654  DNA repair exonuclease  23.64 
 
 
1018 aa  47  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1495  SMC domain protein  27.71 
 
 
895 aa  47.4  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3319  chromosome segregation protein SMC  24.94 
 
 
1176 aa  47.4  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.240957  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0855  SMC domain protein  47.92 
 
 
802 aa  46.6  0.002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.128097  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0004  DNA replication and repair protein RecF  30.43 
 
 
376 aa  46.6  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0733  DNA repair exonuclease, SbcC  28.02 
 
 
962 aa  46.6  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1087  ATP-dependent OLD family endonuclease  48.84 
 
 
616 aa  46.2  0.002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.14427  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1375  DNA repair ATPase  27.42 
 
 
814 aa  46.6  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000000366162  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0674  condensin subunit Smc  22.7 
 
 
1199 aa  46.2  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0709  chromosome segregation protein SMC  23.53 
 
 
1199 aa  45.8  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0453495  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02963  subunit of the multiprotein cohesin complex (Eurofung)  39.71 
 
 
1261 aa  45.4  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.869659  normal  0.319828 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1890  DNA repair exonuclease, SbcC  27.68 
 
 
989 aa  45.4  0.005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.295467  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1081  SMC domain-containing protein  28.65 
 
 
804 aa  44.7  0.007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000660429  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0627  exonuclease  25.54 
 
 
995 aa  44.7  0.007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.246624  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1201  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  28.93 
 
 
257 aa  44.3  0.008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.173549  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04030  Exodeoxyribonuclease I subunit C  21.89 
 
 
1108 aa  44.3  0.009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0894457  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND02930  chromosome associated protein, putative  33.77 
 
 
1208 aa  44.3  0.01  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.828344  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0521  SMC domain protein  22.91 
 
 
1011 aa  43.9  0.01  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1443  ATPase for DNA repair  20.8 
 
 
1046 aa  44.3  0.01  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2822  SMC domain-containing protein  24.69 
 
 
1020 aa  43.9  0.01  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0939  SMC domain-containing protein  25.56 
 
 
812 aa  44.3  0.01  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0924914  normal  0.567341 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0719  chromosome segregation protein SMC  25.7 
 
 
1198 aa  43.9  0.01  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0474833 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2480  SMC domain-containing protein  41.51 
 
 
699 aa  44.3  0.01  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000187418  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>