265 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0448 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0448  SMC protein-like protein  100 
 
 
955 aa  1789    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.507994  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1484  SMC domain-containing protein  27.03 
 
 
1061 aa  182  4e-44  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0728646  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1617  SMC domain-containing protein  28.47 
 
 
1057 aa  178  4e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0948  SMC domain protein  23.99 
 
 
789 aa  118  5e-25  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.217826  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2951  SMC domain protein  24.64 
 
 
1031 aa  107  7e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00128287  unclonable  0.000000102622 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0939  SMC domain-containing protein  37.14 
 
 
812 aa  91.7  7e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0924914  normal  0.567341 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1332  SMC domain-containing protein  23.69 
 
 
993 aa  89.7  3e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0237  SMC domain-containing protein  20.53 
 
 
993 aa  89.4  3e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0769992  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0652  SMC domain-containing protein  30.05 
 
 
1019 aa  87.8  8e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.105285  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0586  SMC domain-containing protein  26.75 
 
 
993 aa  87.4  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.594919  normal  0.0182683 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0982  SMC domain-containing protein  26.01 
 
 
906 aa  87  0.000000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2437  SMC domain protein  29.63 
 
 
924 aa  85.9  0.000000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0961  SMC domain protein  19.2 
 
 
891 aa  80.1  0.0000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000356641  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1574  SMC domain-containing protein  32.58 
 
 
840 aa  78.2  0.0000000000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0162335  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0711  SMC domain-containing protein  26.9 
 
 
994 aa  78.2  0.0000000000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.00173757  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1495  SMC domain protein  29.76 
 
 
895 aa  75.5  0.000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1501  SMC-like protein  28.98 
 
 
888 aa  75.1  0.000000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2789  SMC domain protein  22.72 
 
 
926 aa  74.7  0.000000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0181  chromosome segregation protein  30 
 
 
902 aa  72.4  0.00000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0360  chromosome segregation protein  25 
 
 
1074 aa  70.5  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1142  SMC domain protein  23.26 
 
 
857 aa  70.5  0.0000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1626  SMC domain protein  35.48 
 
 
978 aa  68.6  0.0000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0823  SMC protein-like protein  30.83 
 
 
910 aa  65.9  0.000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.465313  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2553  SMC domain protein  28.16 
 
 
829 aa  65.1  0.000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0525  SMC domain-containing protein  25.22 
 
 
859 aa  63.9  0.00000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0315541  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0696  SMC domain protein  27.32 
 
 
618 aa  63.2  0.00000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0527  SMC domain-containing protein  31.52 
 
 
784 aa  62  0.00000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0374  chromosome segregation protein SMC  37.93 
 
 
1151 aa  61.6  0.00000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2572  hypothetical protein  27.94 
 
 
870 aa  61.2  0.00000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.257377  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1081  SMC domain-containing protein  27.21 
 
 
804 aa  61.2  0.0000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000660429  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4374  chromosome segregation protein SMC  36.78 
 
 
1154 aa  60.1  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.95695  normal  0.0465691 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3824  chromosome segregation protein SMC  29.93 
 
 
1151 aa  59.3  0.0000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0542546 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1874  SMC domain protein  25.21 
 
 
1021 aa  59.3  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0205  SMC domain-containing protein  24.13 
 
 
1180 aa  58.5  0.0000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2608  chromosome segregation protein SMC  33.71 
 
 
1168 aa  58.2  0.0000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.198178  normal  0.335966 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2738  chromosome segregation protein SMC  40.24 
 
 
1167 aa  58.2  0.0000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1637  SMC domain-containing protein  31.28 
 
 
795 aa  58.2  0.0000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0549  exonuclease SbcC, putative  26.67 
 
 
859 aa  57.8  0.0000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1066  chromosome segregation protein SMC  34.48 
 
 
1154 aa  57.8  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0876  chromosome segregation protein SMC2  40.24 
 
 
1151 aa  57.4  0.000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.601564  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0673  SMC domain protein  27.12 
 
 
1116 aa  57.4  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00700495  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0748  SMC domain-containing protein  21.96 
 
 
935 aa  57  0.000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.874201  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1709  exonuclease SbcC  27.86 
 
 
1008 aa  57  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2318  condensin subunit Smc  34.48 
 
 
1154 aa  57  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_490  DNA repair ATPase  26.67 
 
 
859 aa  57  0.000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.0000109294  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2536  chromosome segregation protein SMC  40 
 
 
1170 aa  56.6  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2343  SMC domain protein  31.33 
 
 
912 aa  56.6  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0144  chromosome segregation protein SMC  38.75 
 
 
1170 aa  55.8  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2587  chromosome segregation protein SMC  25.71 
 
 
1151 aa  56.2  0.000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000427179 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0905  SMC domain-containing protein  27.27 
 
 
1022 aa  56.2  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.995306  hitchhiker  0.000299578 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3777  exonuclease SbcC  30.17 
 
 
1103 aa  55.8  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  unclonable  0.00618704  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0851  chromosome segregation protein SMC  30.43 
 
 
1179 aa  55.8  0.000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.687128 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0161  chromosome segregation protein SMC  34.12 
 
 
1167 aa  55.8  0.000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7655  chromosome segregation protein SMC  36.36 
 
 
1148 aa  55.8  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00190533  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0163  chromosome segregation protein SMC  39.02 
 
 
1150 aa  55.8  0.000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1981  chromosome segregation protein SMC  37.5 
 
 
1150 aa  55.8  0.000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.124939 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1669  chromosome segregation protein SMC  25.6 
 
 
1174 aa  55.5  0.000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3877  exonuclease SbcC  27.18 
 
 
1016 aa  55.5  0.000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.371142  normal  0.0827458 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2086  chromosome segregation protein SMC  25.6 
 
 
1174 aa  55.5  0.000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.87089 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4983  chromosome segregation protein SMC  33.33 
 
 
1154 aa  55.5  0.000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.127534  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0497  SMC family protein  36.59 
 
 
1152 aa  54.7  0.000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0500  chromosome segregation protein SMC  36.59 
 
 
1152 aa  55.1  0.000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.169399  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0028  hypothetical protein  28.17 
 
 
768 aa  55.1  0.000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0696  exonuclease SbcC  34.34 
 
 
1007 aa  54.7  0.000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0699  chromosome segregation protein SMC  40 
 
 
1153 aa  54.7  0.000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0762  SMC domain-containing protein  27.67 
 
 
858 aa  54.7  0.000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0108669  decreased coverage  0.00239369 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3179  SMC domain-containing protein  27.13 
 
 
1023 aa  54.7  0.000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0019664  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1732  chromosome segregation protein SMC  30.56 
 
 
1167 aa  54.7  0.000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.109943  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0064  SMC domain protein  37.21 
 
 
1511 aa  54.3  0.00001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0434137 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1577  chromosome segregation protein SMC  30.49 
 
 
1164 aa  53.9  0.00001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0714092  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0613  chromosome segregation protein SMC  36.59 
 
 
1152 aa  54.3  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2898  chromosome segregation protein  26.91 
 
 
891 aa  54.3  0.00001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1538  DNA repair ATPase-like protein  27.56 
 
 
657 aa  53.9  0.00001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.938843  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1488  SMC domain protein  31.41 
 
 
1114 aa  54.3  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2192  chromosome segregation protein SMC  31.33 
 
 
1234 aa  54.3  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1457  chromosome segregation protein SMC  35.29 
 
 
1173 aa  53.5  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1375  DNA repair ATPase  35.71 
 
 
814 aa  53.5  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000000366162  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3248  condensin subunit Smc  37.5 
 
 
1167 aa  53.1  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2952  chromosome segregation protein SMC  30.59 
 
 
1171 aa  53.1  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0128917  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3230  chromosome segregation protein SMC  33.33 
 
 
1170 aa  53.5  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2270  chromosome segregation protein SMC  50 
 
 
1147 aa  53.1  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0454  condensin subunit Smc  23.67 
 
 
1184 aa  53.5  0.00002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1814  chromosome segregation protein SMC  29.41 
 
 
1181 aa  53.5  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0716  chromosome segregation protein SMC  35.37 
 
 
1153 aa  53.1  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1725  nuclease SbcCD, C subunit, putative  27.37 
 
 
813 aa  53.1  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.536729  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0657  chromosome segregation protein SMC  35.37 
 
 
1153 aa  53.1  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.915586  normal  0.754344 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2748  condensin subunit Smc  26.61 
 
 
1162 aa  53.1  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.928329  normal  0.900394 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0768  condensin subunit Smc  36.59 
 
 
1152 aa  52.8  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0371  chromosome segregation protein  25.46 
 
 
890 aa  52.8  0.00003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1564  condensin subunit Smc  25.49 
 
 
1185 aa  53.1  0.00003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1551  SMC domain-containing protein  34.95 
 
 
1074 aa  53.1  0.00003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00625316 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3142  DNA repair ATPase-like protein  31.71 
 
 
875 aa  52.4  0.00004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.49947  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2480  SMC domain-containing protein  49.12 
 
 
699 aa  52.4  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000187418  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4373  chromosome segregation protein SMC  36.47 
 
 
1153 aa  52.4  0.00005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.991905 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0547  chromosome segregation protein SMC  33.33 
 
 
1153 aa  52  0.00005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.725203 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00743  chromosome segregation protein SMC  35.62 
 
 
1167 aa  52  0.00005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2570  SMC domain-containing protein  24.14 
 
 
984 aa  52  0.00005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1095  chromosome segregation protein  32.18 
 
 
1153 aa  51.6  0.00006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.737485  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2049  chromosome segregation protein SMC  35.62 
 
 
1167 aa  51.6  0.00006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2130  chromosome segregation protein  35.62 
 
 
1167 aa  51.6  0.00006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.157775  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>