90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_0884 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009376  Pars_1811  SMC domain-containing protein  64.97 
 
 
794 aa  972    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.305534 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1444  SMC domain-containing protein  68.27 
 
 
795 aa  1036    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.353031  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1637  SMC domain-containing protein  60.43 
 
 
795 aa  950    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0884  SMC domain-containing protein  100 
 
 
790 aa  1536    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.922995  normal  0.368139 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1882  SMC domain-containing protein  32.17 
 
 
805 aa  291  4e-77  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0300452  normal  0.0368515 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0527  SMC domain-containing protein  26.68 
 
 
784 aa  149  2.0000000000000003e-34  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0762  SMC domain-containing protein  23.91 
 
 
858 aa  103  9e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0108669  decreased coverage  0.00239369 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0302  SMC domain-containing protein  24.55 
 
 
702 aa  89  3e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0985  SMC domain-containing protein  27.19 
 
 
702 aa  89  4e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000497741 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1626  SMC domain protein  25.28 
 
 
978 aa  80.1  0.0000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0068  Rad50 zinc hook domain protein  21.88 
 
 
864 aa  79  0.0000000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.191393  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0961  SMC domain protein  21.41 
 
 
891 aa  73.6  0.00000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000356641  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2437  SMC domain protein  22.52 
 
 
924 aa  64.7  0.000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1142  SMC domain protein  22.86 
 
 
857 aa  62.8  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2789  SMC domain protein  21.21 
 
 
926 aa  63.2  0.00000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0982  SMC domain-containing protein  24.44 
 
 
906 aa  62  0.00000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0171  nuclease SbcCD, C subunit, putative  25.99 
 
 
1030 aa  62  0.00000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0356  SMC domain-containing protein  34.54 
 
 
700 aa  60.8  0.0000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0772  SMC domain protein  24.56 
 
 
961 aa  60.1  0.0000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00238509  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0237  SMC domain-containing protein  25.86 
 
 
993 aa  60.1  0.0000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0769992  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1332  SMC domain-containing protein  25.3 
 
 
993 aa  59.7  0.0000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1495  SMC domain protein  22.92 
 
 
895 aa  60.1  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0652  SMC domain-containing protein  26.03 
 
 
1019 aa  59.3  0.0000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.105285  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0586  SMC domain-containing protein  23 
 
 
993 aa  58.5  0.0000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.594919  normal  0.0182683 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1819  SMC domain-containing protein  28.54 
 
 
702 aa  57.4  0.000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  decreased coverage  0.000524613  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0948  SMC domain protein  21.39 
 
 
789 aa  57.4  0.000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.217826  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1081  SMC domain-containing protein  23.65 
 
 
804 aa  55.8  0.000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000660429  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0823  SMC protein-like protein  24.1 
 
 
910 aa  54.7  0.000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.465313  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53629  DNA repair protein  22.84 
 
 
1306 aa  54.7  0.000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.440366 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0711  SMC domain-containing protein  24.69 
 
 
994 aa  54.7  0.000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.00173757  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1688  hypothetical protein  24.87 
 
 
427 aa  52.8  0.00003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00694516  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0360  chromosome segregation protein  27.71 
 
 
1074 aa  52  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30705  predicted protein  39.19 
 
 
1225 aa  51.6  0.00006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.830885  normal  0.342415 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1257  SMC domain protein  26.95 
 
 
1019 aa  50.8  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.861215  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2051  SMC domain protein  33.33 
 
 
1080 aa  49.7  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.380302  normal  0.930097 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0498  SMC domain-containing protein  23.99 
 
 
642 aa  49.7  0.0002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.29132  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0052  SMC domain protein  22.02 
 
 
1049 aa  49.7  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5894  DNA repair ATPase-like protein  23.47 
 
 
1029 aa  49.3  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0510725  hitchhiker  0.00862936 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1882  SMC domain protein  25.15 
 
 
904 aa  49.3  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.600097  normal  0.549876 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2301  SMC domain protein  23.15 
 
 
987 aa  48.9  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2048  Kinetochore-Ndc80 subunit Spc25  23.1 
 
 
647 aa  49.3  0.0003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0855  SMC domain protein  24.51 
 
 
802 aa  49.3  0.0003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.128097  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1375  DNA repair ATPase  24.25 
 
 
814 aa  49.3  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000000366162  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2570  SMC domain-containing protein  34.52 
 
 
984 aa  49.3  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3179  SMC domain-containing protein  25.85 
 
 
1023 aa  48.9  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0019664  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1213  SMC domain-containing protein  25.67 
 
 
806 aa  48.9  0.0004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28736  predicted protein  24.73 
 
 
1313 aa  48.5  0.0005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31440  DNA repair ATPase  27.27 
 
 
986 aa  48.5  0.0005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.651152 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0525  SMC domain-containing protein  22.35 
 
 
859 aa  48.5  0.0005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0315541  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0627  ferric transporter ATP-binding subunit  38.81 
 
 
351 aa  48.1  0.0006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0549  exonuclease SbcC, putative  23.03 
 
 
859 aa  47.8  0.0008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1087  ATP-dependent OLD family endonuclease  44.19 
 
 
616 aa  47  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.14427  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1501  SMC-like protein  26.63 
 
 
888 aa  47.8  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0371  chromosome segregation protein  22.86 
 
 
890 aa  47.4  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2305  SMC domain protein  24.73 
 
 
1025 aa  47.4  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000506659 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_51876  Rad50 DNA repair/recombination protein  25.46 
 
 
1436 aa  47  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.347937  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0004  DNA replication and repair protein RecF  30.43 
 
 
376 aa  47.4  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006684  CNB02640  cohesin complex subunit psm1, putative  38.46 
 
 
1202 aa  47.4  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.176363  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1637  chromosome segregation protein SMC  25.58 
 
 
1170 aa  47.4  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5338  hypothetical protein  24.66 
 
 
1156 aa  47.4  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.498426  decreased coverage  0.0063225 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0627  exonuclease  25.09 
 
 
995 aa  47.4  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.246624  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4388  SMC domain-containing protein  30.49 
 
 
1041 aa  46.2  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.33249 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0733  DNA repair exonuclease, SbcC  40.96 
 
 
962 aa  46.6  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1922  SMC domain protein  21.29 
 
 
987 aa  46.2  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.664102 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_490  DNA repair ATPase  21.91 
 
 
859 aa  46.2  0.003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.0000109294  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0004  recombination protein F  24 
 
 
371 aa  46.2  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.106759  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0004  DNA replication and repair protein RecF  35.29 
 
 
353 aa  45.4  0.004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000383314  n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_3009  SMC domain protein  37.5 
 
 
514 aa  45.4  0.004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0454  putative exonuclease SbcC  25.85 
 
 
1013 aa  45.4  0.004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6131  SMC domain protein  24.86 
 
 
851 aa  45.4  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.983245 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1376  hypothetical protein  27.78 
 
 
663 aa  45.4  0.004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.783168 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02963  subunit of the multiprotein cohesin complex (Eurofung)  38.24 
 
 
1261 aa  45.4  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.869659  normal  0.319828 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0003  DNA replication and repair protein RecF  36.79 
 
 
370 aa  45.1  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0748  SMC domain-containing protein  42.55 
 
 
935 aa  45.1  0.005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.874201  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1924  DNA repair exonuclease, SbcC  34.94 
 
 
995 aa  45.1  0.005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0557877  decreased coverage  0.00069537 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03619  subunit of MRX complex (Eurofung)  22.89 
 
 
1319 aa  45.1  0.006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.296767 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4715  hypothetical protein  47.73 
 
 
255 aa  44.7  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.214433  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6633  hypothetical protein  24.36 
 
 
1156 aa  44.7  0.007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0515539  normal  0.197368 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0003  recombination protein F  27.88 
 
 
379 aa  44.7  0.007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_64147  Structural maintenance of chromosome protein 1 (sister chromatid cohesion complex Cohesin, subunit SMC1)  36.76 
 
 
1240 aa  44.7  0.007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.471232 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2307  SMC domain-containing protein  25 
 
 
676 aa  44.7  0.007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.267261  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1571  chromosome segregation protein SMC  24.9 
 
 
1170 aa  44.7  0.007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1638  ABC transporter related protein  38.04 
 
 
299 aa  44.3  0.008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.374187  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1745  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  39.71 
 
 
324 aa  44.7  0.008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0156804 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6698  hypothetical protein  24.36 
 
 
1156 aa  44.3  0.008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000566514  normal  0.196198 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2356  chromosome segregation SMC protein  33.64 
 
 
1173 aa  44.3  0.009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0899656  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2480  SMC domain-containing protein  39.62 
 
 
699 aa  44.3  0.009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000187418  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5856  hypothetical protein  24.36 
 
 
1156 aa  43.9  0.01  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0304556  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6222  hypothetical protein  24.36 
 
 
1156 aa  43.9  0.01  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.266733  normal  0.0150279 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0339  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  21.15 
 
 
558 aa  44.3  0.01  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>