46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_28736 on replicon NC_009355
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009355  OSTLU_28736  predicted protein  100 
 
 		 1313 aa  2670    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53629  DNA repair protein  30.45 
 
 		 1306 aa  467  9.999999999999999e-131  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.440366 
 
 
-
 
NC_006683  CNN01100  telomere maintenance protein, putative  30.36 
 
 		 1289 aa  454  1.0000000000000001e-126  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.28116  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03619  subunit of MRX complex (Eurofung)  29.13 
 
 		 1319 aa  453  1e-125  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.296767 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_51876  Rad50 DNA repair/recombination protein  28.78 
 
 		 1436 aa  231  7e-59  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.347937  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0527  SMC domain-containing protein  27.78 
 
 		 784 aa  62.8  0.00000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0762  SMC domain-containing protein  25.54 
 
 		 858 aa  55.8  0.000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0108669  decreased coverage  0.00239369 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1617  SMC domain-containing protein  24.43 
 
 		 1057 aa  53.5  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0068  Rad50 zinc hook domain protein  32.2 
 
 		 864 aa  53.5  0.00003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.191393  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0961  SMC domain protein  37.21 
 
 		 891 aa  52  0.00008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000356641  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1922  SMC domain protein  35.58 
 
 		 987 aa  50.8  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.664102 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0243  ABC transporter, ATP-binding protein  41.67 
 
 		 491 aa  50.8  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2301  SMC domain protein  35.58 
 
 		 987 aa  50.8  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1245  SMC domain-containing protein  32.97 
 
 		 693 aa  50.4  0.0002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0122  ABC transporter related protein  36.47 
 
 		 205 aa  49.7  0.0004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.60914  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1725  nuclease SbcCD, C subunit, putative  34.29 
 
 		 813 aa  48.9  0.0006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.536729  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1375  DNA repair ATPase  34.62 
 
 		 814 aa  48.5  0.0007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000000366162  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1661  ABC transporter related  40.98 
 
 		 247 aa  48.9  0.0007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.044489  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05654  DNA repair exonuclease  25.63 
 
 		 1018 aa  48.5  0.0009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1456  ABC transporter related  31.52 
 
 		 553 aa  48.5  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.539244 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3119  ABC transporter related protein  32.84 
 
 		 276 aa  47.8  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1143  ABC transporter related  32.84 
 
 		 276 aa  47.8  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1805  ABC transporter related  43.75 
 
 		 259 aa  47.8  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000033  exonuclease SbcC  27.42 
 
 		 1018 aa  47  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00466596  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1335  ABC transporter related  39.34 
 
 		 238 aa  47  0.002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.43014  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1511  ABC transporter related  30.61 
 
 		 246 aa  47.4  0.002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2456  SMC domain-containing protein  25 
 
 		 1018 aa  47.4  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.053709  unclonable  0.00000627318 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2232  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  29.89 
 
 		 321 aa  47  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.422704  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0898  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  32.1 
 
 		 359 aa  47  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2570  SMC domain-containing protein  36.25 
 
 		 984 aa  46.2  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2402  ABC transporter-related protein  37.1 
 
 		 246 aa  46.2  0.004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2481  ABC transporter, ATP-binding protein  37.93 
 
 		 325 aa  46.2  0.004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2500  ABC transporter related  22.7 
 
 		 262 aa  45.8  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0972134  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2442  ABC transporter related  34.78 
 
 		 316 aa  45.8  0.005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0120547 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3697  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  30.21 
 
 		 242 aa  45.8  0.006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.270266  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0259  hypothetical protein  35.44 
 
 		 469 aa  45.4  0.006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.308359 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0414  ABC transporter related protein  36.23 
 
 		 283 aa  45.4  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.928661 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1637  SMC domain-containing protein  26.71 
 
 		 795 aa  45.4  0.007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0484  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  28.19 
 
 		 353 aa  45.4  0.007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.143952  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2054  general L-amino acid transport ATP-binding subunit  32.89 
 
 		 249 aa  45.1  0.008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.3926  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0620  oligopeptide/dipeptide ABC transporter ATPase subunit  37.23 
 
 		 348 aa  45.4  0.008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1042  ABC transporter related protein  34.21 
 
 		 499 aa  45.1  0.008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.147331 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0353  ABC transporter related protein  35.82 
 
 		 253 aa  45.1  0.009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2966  ABC transporter-like protein  35.71 
 
 		 234 aa  45.1  0.009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2843  exonuclease SbcC, putative  26.15 
 
 		 1018 aa  45.1  0.01  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1874  SMC domain protein  21.48 
 
 		 1021 aa  45.1  0.01  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>