More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0961 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0961  SMC domain protein  100 
 
 		 891 aa  1691    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000356641  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0237  SMC domain-containing protein  29.47 
 
 		 993 aa  199  2.0000000000000003e-49  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0769992  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0711  SMC domain-containing protein  27.15 
 
 		 994 aa  188  4e-46  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.00173757  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0762  SMC domain-containing protein  25.05 
 
 		 858 aa  185  3e-45  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0108669  decreased coverage  0.00239369 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0586  SMC domain-containing protein  26.91 
 
 		 993 aa  173  1e-41  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.594919  normal  0.0182683 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0068  Rad50 zinc hook domain protein  26.27 
 
 		 864 aa  153  2e-35  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.191393  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1495  SMC domain protein  23.28 
 
 		 895 aa  139  2e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2898  chromosome segregation protein  21.7 
 
 		 891 aa  135  3.9999999999999996e-30  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3877  exonuclease SbcC  23.38 
 
 		 1016 aa  131  6e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.371142  normal  0.0827458 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1709  exonuclease SbcC  21.13 
 
 		 1008 aa  127  9e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1081  SMC domain-containing protein  22.09 
 
 		 804 aa  117  1.0000000000000001e-24  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000660429  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0855  SMC domain protein  26.03 
 
 		 802 aa  110  1e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.128097  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0748  SMC domain-containing protein  26.74 
 
 		 935 aa  109  2e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.874201  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3541  exonuclease SbcC  30.88 
 
 		 1003 aa  105  4e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.757761  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2437  SMC domain protein  25 
 
 		 924 aa  102  3e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0696  exonuclease SbcC  30.88 
 
 		 1007 aa  101  6e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1501  SMC-like protein  24.06 
 
 		 888 aa  100  8e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0652  SMC domain-containing protein  34.3 
 
 		 1019 aa  100  1e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.105285  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3179  SMC domain-containing protein  18.08 
 
 		 1023 aa  100  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0019664  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0018  SMC domain protein  23.26 
 
 		 862 aa  98.2  6e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0623828 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1571  chromosome segregation protein SMC  26.31 
 
 		 1170 aa  97.8  7e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4561  exonuclease SbcC  30.41 
 
 		 1007 aa  97.4  9e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1257  SMC domain protein  23.39 
 
 		 1019 aa  97.1  1e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.861215  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0948  SMC domain protein  35.33 
 
 		 789 aa  96.7  2e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.217826  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1332  SMC domain-containing protein  35.29 
 
 		 993 aa  96.3  2e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0525  SMC domain-containing protein  23.81 
 
 		 859 aa  95.9  3e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0315541  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0549  exonuclease SbcC, putative  24.8 
 
 		 859 aa  94.7  8e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0181  chromosome segregation protein  21.75 
 
 		 902 aa  94  1e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1142  SMC domain protein  26.1 
 
 		 857 aa  94  1e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2789  SMC domain protein  21.16 
 
 		 926 aa  92.4  3e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1245  SMC domain-containing protein  26.24 
 
 		 693 aa  91.3  7e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0905  SMC domain-containing protein  28.26 
 
 		 1022 aa  91.3  8e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.995306  hitchhiker  0.000299578 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_490  DNA repair ATPase  24.27 
 
 		 859 aa  90.1  2e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.0000109294  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2951  SMC domain protein  22.91 
 
 		 1031 aa  89.7  2e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00128287  unclonable  0.000000102622 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4093  SMC domain-containing protein  21.88 
 
 		 1022 aa  88.6  5e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.240758  normal  0.708538 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3009  exonuclease SbcC  30.9 
 
 		 1008 aa  87  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.291694  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3111  exonuclease SbcC  30.9 
 
 		 1008 aa  87.4  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0985  SMC domain-containing protein  23.43 
 
 		 702 aa  85.5  0.000000000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000497741 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1637  chromosome segregation protein SMC  26.06 
 
 		 1170 aa  85.1  0.000000000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0527  SMC domain-containing protein  23.07 
 
 		 784 aa  81.3  0.00000000000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1220  chromosome segregation protein SMC  25.5 
 
 		 1164 aa  80.5  0.0000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0939  SMC domain-containing protein  24.02 
 
 		 812 aa  80.5  0.0000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0924914  normal  0.567341 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1484  SMC domain-containing protein  23.1 
 
 		 1061 aa  80.5  0.0000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0728646  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1155  SMC domain-containing protein  34.13 
 
 		 852 aa  79.7  0.0000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1300  SMC domain-containing protein  34.13 
 
 		 852 aa  80.1  0.0000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.975813  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1626  SMC domain protein  28.62 
 
 		 978 aa  80.1  0.0000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0982  SMC domain-containing protein  20.55 
 
 		 906 aa  80.1  0.0000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0772  SMC domain protein  28.34 
 
 		 961 aa  78.2  0.0000000000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00238509  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0360  chromosome segregation protein  26.9 
 
 		 1074 aa  78.2  0.0000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0204  ATP-dependent dsDNA exonuclease (SbcC)-like  27.41 
 
 		 1088 aa  77  0.000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.18794  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1303  SMC domain-containing protein  25.78 
 
 		 1234 aa  77.4  0.000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1006  SMC domain protein  24.44 
 
 		 1227 aa  76.3  0.000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.817412  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2384  exonuclease SbcC  25.79 
 
 		 1099 aa  75.1  0.000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00297099  hitchhiker  0.00111486 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6131  SMC domain protein  26.59 
 
 		 851 aa  74.3  0.000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.983245 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1084  chromosome segregation protein SMC  27.05 
 
 		 1187 aa  74.3  0.000000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0426  exonuclease subunit SbcC  27.53 
 
 		 1047 aa  73.6  0.00000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.442969  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0927  condensin subunit Smc  29.59 
 
 		 1190 aa  73.6  0.00000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.177469  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0918  exonuclease SbcC  22.3 
 
 		 1009 aa  73.2  0.00000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.286851  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3777  exonuclease SbcC  26.97 
 
 		 1103 aa  73.2  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  unclonable  0.00618704  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1750  SMC domain protein  22.85 
 
 		 445 aa  72.8  0.00000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.524117  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00345  exonuclease, dsDNA, ATP-dependent  26.97 
 
 		 1048 aa  72.4  0.00000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00349  hypothetical protein  26.97 
 
 		 1048 aa  72.4  0.00000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1975  chromosome segregation protein SMC  26.69 
 
 		 1187 aa  72.4  0.00000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0472  exonuclease subunit SbcC  26.97 
 
 		 1047 aa  72.4  0.00000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.227308  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3236  exonuclease subunit SbcC  26.97 
 
 		 1047 aa  72.4  0.00000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.528521  hitchhiker  0.0000322457 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0464  exonuclease subunit SbcC  26.97 
 
 		 1047 aa  72.4  0.00000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0316  exonuclease subunit SbcC  26.97 
 
 		 1047 aa  72.4  0.00000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.53041  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3212  exonuclease SbcC  26.97 
 
 		 1048 aa  72  0.00000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.223053  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0855  chromosome segregation protein SMC  24.84 
 
 		 1200 aa  72  0.00000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00379552  normal  0.0307887 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1799  condensin subunit Smc  26.45 
 
 		 1162 aa  72  0.00000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0884011  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0823  SMC protein-like protein  28.72 
 
 		 910 aa  71.6  0.00000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.465313  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0432  exonuclease subunit SbcC  24.78 
 
 		 1046 aa  71.6  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0944  SMC protein-like protein  23.93 
 
 		 483 aa  71.6  0.00000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.665094  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1725  nuclease SbcCD, C subunit, putative  22.33 
 
 		 813 aa  71.2  0.00000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.536729  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0424  exonuclease subunit SbcC  26.97 
 
 		 1047 aa  71.2  0.00000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0454  condensin subunit Smc  30.77 
 
 		 1184 aa  71.2  0.00000000008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1271  chromosome segregation SMC protein  26.57 
 
 		 1177 aa  71.2  0.00000000008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0451  exonuclease subunit SbcC  24.78 
 
 		 1046 aa  71.2  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.8799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4031  SMC domain-containing protein  25.6 
 
 		 810 aa  70.9  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.515725  normal  0.378288 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0331  chromosome segregation protein SMC  21.63 
 
 		 1201 aa  70.9  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.535871  normal  0.0329796 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0704  ATP-dependent dsDNA exonuclease (SbcC)  25.52 
 
 		 1091 aa  70.5  0.0000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.859038  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1874  SMC domain protein  24.35 
 
 		 1021 aa  70.5  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1730  exonuclease  24.86 
 
 		 1223 aa  70.9  0.0000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0842079  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0865  exonuclease subunit SbcC  27.12 
 
 		 1042 aa  70.9  0.0000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.379439  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00743  chromosome segregation protein SMC  24.1 
 
 		 1167 aa  69.7  0.0000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01848  Chromosome segregation ATPase, sms  24.45 
 
 		 1195 aa  70.1  0.0000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1341  chromosome segregation protein SMC  24.08 
 
 		 1196 aa  70.1  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2451  SMC domain-containing protein  23.4 
 
 		 1232 aa  70.1  0.0000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0302  SMC domain-containing protein  21.75 
 
 		 702 aa  69.7  0.0000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1381  chromosome segregation protein SMC  25.3 
 
 		 1184 aa  69.3  0.0000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.530369  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0356  SMC domain-containing protein  32.4 
 
 		 700 aa  68.9  0.0000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1637  SMC domain-containing protein  22.31 
 
 		 795 aa  69.3  0.0000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3304  exonuclease SbcC  25.14 
 
 		 1227 aa  69.7  0.0000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0724  chromosome segregation SMC protein  24.9 
 
 		 1179 aa  68.9  0.0000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0318  condensin subunit Smc  24.86 
 
 		 1307 aa  68.6  0.0000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3139  nuclease SbcCD, C subunit  23.6 
 
 		 1229 aa  68.9  0.0000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.642669  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2587  chromosome segregation protein SMC  25.51 
 
 		 1189 aa  68.9  0.0000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3278  SMC domain-containing protein  23.6 
 
 		 1229 aa  68.9  0.0000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.116021  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3289  nuclease SbcCD, C subunit  23.6 
 
 		 1220 aa  68.9  0.0000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.267466 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1716  chromosome segregation protein SMC  28.05 
 
 		 1196 aa  68.6  0.0000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.651651  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>