176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_3801 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_2588  SMC domain protein  55.77 
 
 		 687 aa  651    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.326587  normal  0.642403 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3801  SMC domain-containing protein  100 
 
 		 682 aa  1353    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0420971  hitchhiker  0.000733932 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3083  hypothetical protein  25.07 
 
 		 796 aa  71.6  0.00000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4596  hypothetical protein  26.57 
 
 		 879 aa  67.8  0.0000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0852353  n/a   
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4566  ATPase involved in DNA repair  28.46 
 
 		 1059 aa  65.1  0.000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.134908  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0040  DNA repair ATPase  25.45 
 
 		 1051 aa  59.7  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.00000057692  hitchhiker  0.00102482 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1103  SMC domain protein  33.7 
 
 		 808 aa  59.3  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0892  hypothetical protein  30.89 
 
 		 890 aa  55.1  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.608011 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2709  SMC domain protein  24.63 
 
 		 1036 aa  54.3  0.000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0412  chromosome segregation protein SMC  47.92 
 
 		 1148 aa  53.5  0.00001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0527  SMC domain-containing protein  50 
 
 		 784 aa  53.5  0.00001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0939  SMC domain-containing protein  34.29 
 
 		 812 aa  53.5  0.00001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0924914  normal  0.567341 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3707  SMC domain-containing protein  38.1 
 
 		 881 aa  52.8  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1986  chromosome segregation protein SMC  45.83 
 
 		 1178 aa  52  0.00003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1677  chromosome segregation protein SMC  45.83 
 
 		 1177 aa  52  0.00004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2379  chromosome segregation protein SMC  41.82 
 
 		 1141 aa  51.6  0.00005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.882333  unclonable  0.00000367062 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3319  chromosome segregation protein SMC  39.58 
 
 		 1176 aa  51.2  0.00006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.240957  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1592  chromosome segregation protein, Smc family protein  47.92 
 
 		 1178 aa  50.8  0.00007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00176998  normal  0.493606 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0419  chromosome segregation protein SMC  43.75 
 
 		 1190 aa  50.8  0.00008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.327904  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1169  chromosome segregation protein SMC  43.75 
 
 		 1177 aa  50.8  0.00008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4388  SMC domain-containing protein  35.16 
 
 		 1041 aa  50.8  0.00009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.33249 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1496  chromosome partition protein SmC, putative  45.83 
 
 		 980 aa  50.1  0.0001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2356  chromosome segregation SMC protein  43.75 
 
 		 1173 aa  50.1  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0899656  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2516  chromosome segregation protein SMC  41.67 
 
 		 1138 aa  50.1  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0576231  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0697  chromosome segregation protein SMC  43.75 
 
 		 1164 aa  50.1  0.0001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1381  chromosome segregation protein SMC  34.44 
 
 		 1184 aa  50.4  0.0001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.530369  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3688  SMC domain protein  30 
 
 		 1081 aa  50.1  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.860198 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0498  chromosome segregation protein SMC  41.67 
 
 		 1185 aa  49.3  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0065  SMC domain protein  24.57 
 
 		 985 aa  49.3  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2338  hypothetical protein  39.62 
 
 		 874 aa  49.7  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00000220057  unclonable  0.000000361106 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0643  chromosome segregation protein SMC  45.83 
 
 		 1185 aa  49.7  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.126357  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1514  SMC family protein  43.64 
 
 		 1139 aa  49.7  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.192441  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1165  chromosome segregation protein SMC  35.71 
 
 		 1163 aa  49.7  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.126703  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1272  hypothetical protein  39.62 
 
 		 874 aa  49.7  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2656  chromosome segregation protein SMC  43.75 
 
 		 1138 aa  49.7  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000574242  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1716  chromosome segregation protein SMC  43.75 
 
 		 1196 aa  49.3  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.651651  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0450  SMC domain protein  26 
 
 		 877 aa  49.7  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.292453  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2366  chromosome segregation protein SMC  43.75 
 
 		 1145 aa  49.7  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00122996  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1703  chromosome segregation protein SMC  43.75 
 
 		 1138 aa  49.7  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00557127  hitchhiker  0.00000000707845 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2681  chromosome segregation protein SMC  43.75 
 
 		 1138 aa  49.7  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000886702  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2760  chromosome segregation protein SMC  43.75 
 
 		 1138 aa  49.7  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.494661  unclonable  0.00000956134 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1130  chromosome segregation SMC protein, putative  31.68 
 
 		 1175 aa  48.9  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0953  condensin subunit Smc  47.92 
 
 		 1187 aa  48.9  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1418  chromosome segregation protein SMC  30.38 
 
 		 1181 aa  48.9  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2963  DNA repair ATPase-like protein  34.02 
 
 		 929 aa  48.9  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.547311 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4583  RecF/RecN/SMC N domain, putative  23.23 
 
 		 875 aa  48.9  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3494  chromosome segregation protein SMC  39.58 
 
 		 1177 aa  48.5  0.0004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0101958  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1167  chromosome segregation protein SMC  32.58 
 
 		 1255 aa  48.5  0.0004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.469719  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0753  chromosome segregation protein SMC  45.83 
 
 		 1150 aa  48.5  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0661  SMC domain protein  41.67 
 
 		 1172 aa  48.5  0.0004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1506  chromosome segregation protein SMC  41.67 
 
 		 1142 aa  48.5  0.0004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00012681  hitchhiker  0.00000000387349 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1573  chromosome segregation protein SMC  41.67 
 
 		 1142 aa  48.5  0.0004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00374514  hitchhiker  0.000804403 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2463  chromosome segregation protein SMC  41.67 
 
 		 1144 aa  48.5  0.0004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000141924  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1567  chromosome segregation protein SMC  41.67 
 
 		 1142 aa  48.5  0.0004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0218486  hitchhiker  0.0000000844837 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2898  SMC family protein  41.67 
 
 		 1145 aa  48.1  0.0005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3658  chromosome segregation SMC protein, putative  35.14 
 
 		 1162 aa  48.1  0.0005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1817  SMC protein, N-terminal:structural maintenance of chromosome protein SMC, C-terminal:SMCs flexible hinge  35.14 
 
 		 1162 aa  48.1  0.0005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.445184  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0318  condensin subunit Smc  37.5 
 
 		 1307 aa  48.1  0.0005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1174  condensin subunit Smc  39.58 
 
 		 1176 aa  48.1  0.0005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.719475  normal  0.690584 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2437  SMC domain protein  45.1 
 
 		 924 aa  48.1  0.0005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0504  chromosome segregation protein SMC  41.67 
 
 		 1179 aa  48.1  0.0005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0467  SMC domain-containing protein  37.5 
 
 		 1280 aa  48.1  0.0005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3812  chromosome segregation protein SMC  41.3 
 
 		 1198 aa  48.1  0.0005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1882  SMC domain-containing protein  44.9 
 
 		 805 aa  48.1  0.0005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0300452  normal  0.0368515 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3982  hypothetical protein  35.19 
 
 		 881 aa  47.8  0.0006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0815711  hitchhiker  0.00348599 
 
 
-
 
NC_006684  CNB02640  cohesin complex subunit psm1, putative  28.95 
 
 		 1202 aa  47.8  0.0006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.176363  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1799  condensin subunit Smc  39.58 
 
 		 1162 aa  47.8  0.0006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0884011  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44680  putative chromosome segregation protein  32.86 
 
 		 1162 aa  48.1  0.0006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0150952 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1094  chromosome segregation protein SMC  39.58 
 
 		 1176 aa  48.1  0.0006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0349  SMC protein-like  37.5 
 
 		 1318 aa  47.8  0.0007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1970  chromosome segregation protein SMC  47.73 
 
 		 1185 aa  47.8  0.0007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.846909  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0900  chromosome segregation protein SMC  45.83 
 
 		 1150 aa  47.8  0.0007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.188992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3806  chromosome segregation protein SMC  32.86 
 
 		 1162 aa  47.8  0.0007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2849  chromosome segregation protein SMC  41.67 
 
 		 1133 aa  47.4  0.0008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000354618  unclonable  0.0000000590997 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2185  chromosome segregation protein SMC  41.67 
 
 		 1146 aa  47.4  0.0008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1688  chromosome segregation protein SMC  47.73 
 
 		 1185 aa  47.4  0.0009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0515857  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0863  condensin subunit Smc  37.5 
 
 		 1174 aa  47.4  0.0009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1725  nuclease SbcCD, C subunit, putative  31.31 
 
 		 813 aa  47  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.536729  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4276  chromosome segregation protein SMC  32.86 
 
 		 1162 aa  47  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1580  SMC domain protein  42.86 
 
 		 818 aa  47  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.338996  normal  0.282314 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1302  ATP-dependent OLD family endonuclease  44 
 
 		 634 aa  47  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.314426  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3840  chromosome segregation protein SMC  32.86 
 
 		 1162 aa  47  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.509302 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1879  condensin subunit Smc  35.14 
 
 		 1168 aa  47  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00135504  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0927  condensin subunit Smc  39.58 
 
 		 1190 aa  47.4  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.177469  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_64147  Structural maintenance of chromosome protein 1 (sister chromatid cohesion complex Cohesin, subunit SMC1)  30.97 
 
 		 1240 aa  47  0.001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.471232 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3602  chromosome segregation protein SMC  32.86 
 
 		 1162 aa  47  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.111779  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0696  chromosome segregation protein SMC  41.67 
 
 		 1190 aa  47.4  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.21449  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0461  chromosome segregation protein SMC  39.58 
 
 		 1186 aa  47  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4719  chromosome segregation protein SMC  41.67 
 
 		 1176 aa  47  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.430615  normal  0.0169056 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1592  chromosome segregation protein SMC  32.86 
 
 		 1162 aa  47  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.843365  normal  0.195769 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1507  SMC domain protein  41.67 
 
 		 1115 aa  47  0.001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.44218  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2384  exonuclease SbcC  37.5 
 
 		 1099 aa  47  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00297099  hitchhiker  0.00111486 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1975  chromosome segregation protein SMC  39.58 
 
 		 1187 aa  46.2  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0527  chromosome segregation protein SMC  43.75 
 
 		 1193 aa  46.6  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.534964 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0674  condensin subunit Smc  28.42 
 
 		 1199 aa  45.8  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0777  hypothetical protein  27.27 
 
 		 617 aa  46.2  0.002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1271  chromosome segregation SMC protein  37.5 
 
 		 1177 aa  45.8  0.002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2702  putative exonuclease  39.29 
 
 		 881 aa  46.2  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.0098926  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0766  SMC domain protein  41.07 
 
 		 623 aa  46.2  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000557605  normal  0.0228262 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0708  chromosome segregation protein SMC  29.47 
 
 		 1199 aa  46.6  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.175471  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>