25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_3982 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_3982  hypothetical protein  100 
 
 		 881 aa  1804    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0815711  hitchhiker  0.00348599 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5366  hypothetical protein  49.83 
 
 		 892 aa  820    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.786314  normal  0.0115994 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3707  SMC domain-containing protein  63.45 
 
 		 881 aa  1145    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0450  SMC domain protein  36.12 
 
 		 877 aa  515  1e-144  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.292453  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2338  hypothetical protein  35.66 
 
 		 874 aa  466  1e-129  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00000220057  unclonable  0.000000361106 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1272  hypothetical protein  35.55 
 
 		 874 aa  465  1e-129  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1420  hypothetical protein  35.43 
 
 		 874 aa  450  1e-125  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.542957  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1363  SMC protein-like  30.73 
 
 		 875 aa  425  1e-117  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.922778  normal  0.196985 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1830  hypothetical protein  26.23 
 
 		 955 aa  107  8e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1085  DNA repair ATPase-like protein  33.13 
 
 		 741 aa  63.9  0.00000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0841172  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1161  hypothetical protein  20.27 
 
 		 800 aa  59.3  0.0000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1103  SMC domain protein  26.27 
 
 		 808 aa  53.5  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15610  hypothetical protein  31.71 
 
 		 868 aa  52.8  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000202138  unclonable  3.13733e-21 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7392  hypothetical protein  38.03 
 
 		 874 aa  52  0.00005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0267  hypothetical protein  28.69 
 
 		 872 aa  51.2  0.00007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3054  hypothetical protein  37.66 
 
 		 896 aa  48.5  0.0005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3801  SMC domain-containing protein  35.09 
 
 		 682 aa  48.1  0.0007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0420971  hitchhiker  0.000733932 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0127  hypothetical protein  32.56 
 
 		 869 aa  47  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2588  SMC domain protein  38.46 
 
 		 687 aa  46.6  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.326587  normal  0.642403 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1967  hypothetical protein  33.68 
 
 		 844 aa  45.8  0.004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.972801  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06300  hypothetical protein  27.96 
 
 		 854 aa  45.4  0.005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2843  exonuclease SbcC, putative  36.92 
 
 		 1018 aa  44.3  0.009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1948  ATPase AAA-2 domain protein  38.04 
 
 		 812 aa  44.3  0.009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0130841  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0327  ATPase AAA-2 domain protein  33.71 
 
 		 810 aa  44.3  0.01  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00200367  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4360  putative ATP-dependent dsDNA exonuclease  43.08 
 
 		 986 aa  44.3  0.01  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.288982  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>