39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_15610 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_7392  hypothetical protein  50.58 
 
 		 874 aa  823    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15610  hypothetical protein  100 
 
 		 868 aa  1748    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000202138  unclonable  3.13733e-21 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0267  hypothetical protein  37.6 
 
 		 872 aa  555  1e-156  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0127  hypothetical protein  35.11 
 
 		 869 aa  441  9.999999999999999e-123  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7689  hypothetical protein  87.5 
 
 		 597 aa  422  1e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.140286 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4992  hypothetical protein  32.58 
 
 		 881 aa  330  7e-89  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4940  hypothetical protein  31.42 
 
 		 878 aa  310  5e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.188257  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4456  hypothetical protein  31.92 
 
 		 833 aa  309  1.0000000000000001e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.681645 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2026  hypothetical protein  28.68 
 
 		 897 aa  306  1.0000000000000001e-81  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.657836  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0643  ATPase  28.59 
 
 		 781 aa  291  3e-77  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7587  SMC domain-containing protein  28.91 
 
 		 873 aa  276  8e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.328529  normal  0.0896714 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3841  hypothetical protein  30.04 
 
 		 895 aa  270  1e-70  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3692  hypothetical protein  27.57 
 
 		 891 aa  263  8.999999999999999e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000374969 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3054  hypothetical protein  28.27 
 
 		 896 aa  237  8e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6595  hypothetical protein  28.83 
 
 		 880 aa  198  3e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0107  hypothetical protein  23.34 
 
 		 869 aa  153  1e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2640  hypothetical protein  27.37 
 
 		 887 aa  143  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.24246  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2596  hypothetical protein  27.37 
 
 		 887 aa  143  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.889024  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06300  hypothetical protein  27.22 
 
 		 854 aa  134  6e-30  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1967  hypothetical protein  29.07 
 
 		 844 aa  67  0.000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.972801  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3083  hypothetical protein  32.06 
 
 		 796 aa  56.6  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3707  SMC domain-containing protein  33.65 
 
 		 881 aa  55.8  0.000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3982  hypothetical protein  31.71 
 
 		 881 aa  53.1  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0815711  hitchhiker  0.00348599 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0566  hypothetical protein  33.09 
 
 		 810 aa  52  0.00004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.913605  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3987  hypothetical protein  39.76 
 
 		 803 aa  51.2  0.00007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1363  SMC protein-like  36.36 
 
 		 875 aa  51.2  0.00009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.922778  normal  0.196985 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2428  hypothetical protein  40.26 
 
 		 849 aa  49.7  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0793097 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2668  hypothetical protein  36.78 
 
 		 695 aa  48.9  0.0004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2644  hypothetical protein  31.43 
 
 		 643 aa  48.9  0.0004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.382571  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0471  hypothetical protein  27.21 
 
 		 771 aa  48.5  0.0005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1151  hypothetical protein  25.14 
 
 		 743 aa  48.1  0.0006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.515935  normal  0.0297929 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1985  hypothetical protein  26.14 
 
 		 771 aa  48.1  0.0007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.229709  normal  0.0294644 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1721  RloC protein, putative  38.96 
 
 		 776 aa  48.1  0.0007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5100  SMC domain protein  35 
 
 		 676 aa  47.8  0.0008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.13432  normal  0.797675 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39480  hypothetical protein  30 
 
 		 717 aa  47.8  0.0008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000519045  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5366  hypothetical protein  29.29 
 
 		 892 aa  47.8  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.786314  normal  0.0115994 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1494  ABC transporter related  40.26 
 
 		 482 aa  47  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0334764  normal  1 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4292  hypothetical protein  32.62 
 
 		 770 aa  45.8  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1603  ABC transporter, ATP-binding protein  33.33 
 
 		 481 aa  44.7  0.007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>