29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_1363 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007969  Pcryo_1363  SMC protein-like  100 
 
 
875 aa  1788    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.922778  normal  0.196985 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0450  SMC domain protein  33.56 
 
 
877 aa  486  1e-136  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.292453  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1420  hypothetical protein  32.81 
 
 
874 aa  475  1e-132  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.542957  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1272  hypothetical protein  31.54 
 
 
874 aa  470  1.0000000000000001e-131  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2338  hypothetical protein  31.96 
 
 
874 aa  470  1.0000000000000001e-131  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00000220057  unclonable  0.000000361106 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5366  hypothetical protein  32.66 
 
 
892 aa  444  1e-123  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.786314  normal  0.0115994 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3982  hypothetical protein  30.92 
 
 
881 aa  430  1e-119  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0815711  hitchhiker  0.00348599 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3707  SMC domain-containing protein  31.68 
 
 
881 aa  396  1e-109  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1830  hypothetical protein  25.23 
 
 
955 aa  150  9e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1103  SMC domain protein  42.59 
 
 
808 aa  56.6  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1085  DNA repair ATPase-like protein  24.84 
 
 
741 aa  55.8  0.000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0841172  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0302  SMC domain-containing protein  24.66 
 
 
702 aa  55.5  0.000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3054  hypothetical protein  31.01 
 
 
896 aa  52.8  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0267  hypothetical protein  23.52 
 
 
872 aa  52.8  0.00003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15610  hypothetical protein  36.36 
 
 
868 aa  50.8  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000202138  unclonable  3.13733e-21 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0003  DNA replication and repair protein RecF  28.69 
 
 
365 aa  50.1  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1626  SMC domain protein  25.43 
 
 
978 aa  48.1  0.0007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1350  SMC domain-containing protein  27.66 
 
 
1174 aa  48.1  0.0007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2963  DNA repair ATPase-like protein  39.29 
 
 
929 aa  47.8  0.0008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.547311 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4456  hypothetical protein  30.3 
 
 
833 aa  46.6  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.681645 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0127  hypothetical protein  35 
 
 
869 aa  46.6  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3083  hypothetical protein  31.17 
 
 
796 aa  45.4  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4360  putative ATP-dependent dsDNA exonuclease  30 
 
 
986 aa  45.1  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.288982  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7392  hypothetical protein  38.57 
 
 
874 aa  45.4  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf735  chromosome segregation ATPase Smc  28.12 
 
 
978 aa  45.1  0.006  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0643  ATPase  32.29 
 
 
781 aa  44.7  0.007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1271  chromosome segregation SMC protein  33.33 
 
 
1177 aa  44.7  0.009  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1967  hypothetical protein  32.61 
 
 
844 aa  44.3  0.009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.972801  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4596  hypothetical protein  38.18 
 
 
879 aa  44.3  0.009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0852353  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>