42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_06300 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008705  Mkms_2640  hypothetical protein  78.52 
 
 		 887 aa  1382    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.24246  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06300  hypothetical protein  100 
 
 		 854 aa  1744    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2596  hypothetical protein  78.52 
 
 		 887 aa  1382    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.889024  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0107  hypothetical protein  27.1 
 
 		 869 aa  217  8e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6595  hypothetical protein  26.43 
 
 		 880 aa  187  7e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0127  hypothetical protein  25.22 
 
 		 869 aa  181  4.999999999999999e-44  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4456  hypothetical protein  27.04 
 
 		 833 aa  180  9e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.681645 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0267  hypothetical protein  25.2 
 
 		 872 aa  160  9e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3841  hypothetical protein  24.59 
 
 		 895 aa  153  2e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3054  hypothetical protein  26.41 
 
 		 896 aa  141  4.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4992  hypothetical protein  25.74 
 
 		 881 aa  140  1e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7587  SMC domain-containing protein  24.5 
 
 		 873 aa  137  7.000000000000001e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.328529  normal  0.0896714 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2026  hypothetical protein  23.87 
 
 		 897 aa  133  2.0000000000000002e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.657836  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15610  hypothetical protein  25.74 
 
 		 868 aa  130  8.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000202138  unclonable  3.13733e-21 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0643  ATPase  22.56 
 
 		 781 aa  125  5e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3692  hypothetical protein  24.21 
 
 		 891 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000374969 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4940  hypothetical protein  36.55 
 
 		 878 aa  106  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.188257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7392  hypothetical protein  47.25 
 
 		 874 aa  77.8  0.0000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2428  hypothetical protein  22.41 
 
 		 849 aa  65.9  0.000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0793097 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7689  hypothetical protein  60 
 
 		 597 aa  51.2  0.00009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.140286 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1967  hypothetical protein  24.06 
 
 		 844 aa  49.3  0.0003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.972801  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0892  hypothetical protein  37.66 
 
 		 890 aa  48.5  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.608011 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5563  hypothetical protein  24.66 
 
 		 792 aa  48.1  0.0007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4292  hypothetical protein  38.82 
 
 		 770 aa  47.8  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3083  hypothetical protein  39.71 
 
 		 796 aa  46.6  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39480  hypothetical protein  29.46 
 
 		 717 aa  46.6  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000519045  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1603  ABC transporter, ATP-binding protein  35.38 
 
 		 481 aa  46.2  0.003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4229  hypothetical protein  40.91 
 
 		 722 aa  46.2  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0264095  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12291  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  45.59 
 
 		 246 aa  45.4  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.782206  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3982  hypothetical protein  27.96 
 
 		 881 aa  45.4  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0815711  hitchhiker  0.00348599 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0326  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  32.14 
 
 		 276 aa  45.4  0.004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.339036  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0810  ABC-type polar amino acid transport system ATPase component  26.91 
 
 		 247 aa  45.1  0.005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.64253  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3766  ABC transporter related  37.33 
 
 		 264 aa  45.1  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.343031  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3993  ABC transporter related  44.93 
 
 		 253 aa  45.1  0.006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.564938  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4184  ABC transporter related protein  44.93 
 
 		 253 aa  45.1  0.006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4842  DNA sulfur modification protein DndD  35.9 
 
 		 668 aa  44.7  0.007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.883756 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0219  ABC transporter related  39.71 
 
 		 253 aa  44.7  0.007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3961  ABC transporter related  37.78 
 
 		 248 aa  44.7  0.008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.533772 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0356  SMC domain-containing protein  32.11 
 
 		 700 aa  44.7  0.008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2644  hypothetical protein  28.33 
 
 		 643 aa  44.3  0.009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.382571  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2653  polar amino acid ABC transporter ATPase  39.53 
 
 		 267 aa  44.3  0.01  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1750  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  38.03 
 
 		 248 aa  44.3  0.01  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.79026  normal  0.0336767 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>