26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_C6595 on replicon NC_007509
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007509  Bcep18194_C6595  hypothetical protein  100 
 
 
880 aa  1802    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0107  hypothetical protein  25.32 
 
 
869 aa  267  7e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4456  hypothetical protein  28.9 
 
 
833 aa  256  1.0000000000000001e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.681645 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0127  hypothetical protein  29.27 
 
 
869 aa  256  2.0000000000000002e-66  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4940  hypothetical protein  29.85 
 
 
878 aa  235  3e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.188257  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0267  hypothetical protein  27.47 
 
 
872 aa  222  1.9999999999999999e-56  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3054  hypothetical protein  30.07 
 
 
896 aa  200  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15610  hypothetical protein  29.24 
 
 
868 aa  200  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000202138  unclonable  3.13733e-21 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2026  hypothetical protein  27.18 
 
 
897 aa  197  5.000000000000001e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.657836  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7392  hypothetical protein  29.21 
 
 
874 aa  193  1e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06300  hypothetical protein  26.55 
 
 
854 aa  191  5.999999999999999e-47  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0643  ATPase  24.26 
 
 
781 aa  185  3e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2596  hypothetical protein  26.11 
 
 
887 aa  178  3e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.889024  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2640  hypothetical protein  26.11 
 
 
887 aa  178  3e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.24246  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3841  hypothetical protein  25.27 
 
 
895 aa  174  6.999999999999999e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7587  SMC domain-containing protein  28.79 
 
 
873 aa  174  9e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.328529  normal  0.0896714 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4992  hypothetical protein  26.45 
 
 
881 aa  173  1e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3692  hypothetical protein  27.08 
 
 
891 aa  154  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000374969 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1967  hypothetical protein  22.27 
 
 
844 aa  74.7  0.000000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.972801  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7689  hypothetical protein  55.74 
 
 
597 aa  71.6  0.00000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.140286 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2428  hypothetical protein  19.45 
 
 
849 aa  57  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0793097 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2619  hypothetical protein  21.19 
 
 
767 aa  53.9  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.373268 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2668  hypothetical protein  30.69 
 
 
695 aa  47  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0892  hypothetical protein  36.05 
 
 
890 aa  46.6  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.608011 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2637  hypothetical protein  20.43 
 
 
767 aa  46.2  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.594259  normal  0.040177 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3083  hypothetical protein  40 
 
 
796 aa  46.2  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>