26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_4229 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_4229  hypothetical protein  100 
 
 		 722 aa  1480    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0264095  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2619  hypothetical protein  25.24 
 
 		 767 aa  201  3.9999999999999996e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.373268 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2637  hypothetical protein  24.62 
 
 		 767 aa  201  5e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.594259  normal  0.040177 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1868  hypothetical protein  25.34 
 
 		 818 aa  197  4.0000000000000005e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.141951  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5563  hypothetical protein  27.41 
 
 		 792 aa  194  4e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1874  hypothetical protein  25.19 
 
 		 753 aa  174  6.999999999999999e-42  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1985  hypothetical protein  24.1 
 
 		 771 aa  160  6e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.229709  normal  0.0294644 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0471  hypothetical protein  24.13 
 
 		 771 aa  153  1e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0566  hypothetical protein  24.1 
 
 		 810 aa  137  6.0000000000000005e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.913605  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1721  RloC protein, putative  22.46 
 
 		 776 aa  133  1.0000000000000001e-29  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1503  hypothetical protein  26.37 
 
 		 792 aa  111  5e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.269689 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3987  hypothetical protein  23.55 
 
 		 803 aa  107  6e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3703  hypothetical protein  27.81 
 
 		 710 aa  89.4  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1533  hypothetical protein  23.46 
 
 		 757 aa  75.5  0.000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2644  hypothetical protein  31.08 
 
 		 643 aa  68.9  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.382571  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39480  hypothetical protein  22.54 
 
 		 717 aa  65.1  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000519045  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1151  hypothetical protein  24.57 
 
 		 743 aa  63.2  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.515935  normal  0.0297929 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4238  hypothetical protein  29.75 
 
 		 746 aa  52.8  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.648959  hitchhiker  0.00399627 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4292  hypothetical protein  32.1 
 
 		 770 aa  52.4  0.00003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0033  hypothetical protein  39.13 
 
 		 743 aa  49.3  0.0003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3841  hypothetical protein  40.91 
 
 		 895 aa  47  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1967  hypothetical protein  34.21 
 
 		 844 aa  47.4  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.972801  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3325  hypothetical protein  27.78 
 
 		 763 aa  46.2  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06300  hypothetical protein  40.91 
 
 		 854 aa  46.2  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3054  hypothetical protein  37.8 
 
 		 896 aa  45.8  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0106  hypothetical protein  25.33 
 
 		 721 aa  44.7  0.007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>