52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_3083 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_3083  hypothetical protein  100 
 
 		 796 aa  1597    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2668  hypothetical protein  37.3 
 
 		 695 aa  374  1e-102  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0892  hypothetical protein  37.39 
 
 		 890 aa  370  1e-101  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.608011 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5100  SMC domain protein  37.03 
 
 		 676 aa  345  2e-93  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.13432  normal  0.797675 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1085  DNA repair ATPase-like protein  18.93 
 
 		 741 aa  60.1  0.0000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0841172  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2428  hypothetical protein  32.82 
 
 		 849 aa  58.5  0.0000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0793097 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3801  SMC domain-containing protein  24.05 
 
 		 682 aa  57.8  0.0000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0420971  hitchhiker  0.000733932 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15610  hypothetical protein  32.06 
 
 		 868 aa  56.2  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000202138  unclonable  3.13733e-21 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0762  SMC domain-containing protein  23.8 
 
 		 858 aa  55.5  0.000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0108669  decreased coverage  0.00239369 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3841  hypothetical protein  36.36 
 
 		 895 aa  52.4  0.00003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4992  hypothetical protein  41.43 
 
 		 881 aa  52.4  0.00004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1103  SMC domain protein  38.96 
 
 		 808 aa  52  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0127  hypothetical protein  38.37 
 
 		 869 aa  51.6  0.00006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4596  hypothetical protein  25 
 
 		 879 aa  50.1  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0852353  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7392  hypothetical protein  41.18 
 
 		 874 aa  50.4  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2588  SMC domain protein  32.29 
 
 		 687 aa  50.4  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.326587  normal  0.642403 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3812  chromosome segregation protein SMC  36.11 
 
 		 1198 aa  50.4  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0450  SMC domain protein  25.31 
 
 		 877 aa  50.1  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.292453  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7587  SMC domain-containing protein  35.48 
 
 		 873 aa  49.3  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.328529  normal  0.0896714 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0267  hypothetical protein  38.36 
 
 		 872 aa  49.3  0.0003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4583  RecF/RecN/SMC N domain, putative  24.46 
 
 		 875 aa  48.5  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0961  SMC domain protein  28.04 
 
 		 891 aa  48.5  0.0005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000356641  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3054  hypothetical protein  40.79 
 
 		 896 aa  48.1  0.0006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0040  DNA repair ATPase  27.27 
 
 		 1051 aa  48.1  0.0007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.00000057692  hitchhiker  0.00102482 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1161  hypothetical protein  41.18 
 
 		 800 aa  48.1  0.0007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3692  hypothetical protein  34.94 
 
 		 891 aa  47.8  0.0009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000374969 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2026  hypothetical protein  36.47 
 
 		 897 aa  47.4  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.657836  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0107  hypothetical protein  34.78 
 
 		 869 aa  47.4  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2709  SMC domain protein  22.07 
 
 		 1036 aa  47  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06300  hypothetical protein  39.71 
 
 		 854 aa  46.6  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1967  hypothetical protein  31.72 
 
 		 844 aa  46.6  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.972801  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6595  hypothetical protein  40 
 
 		 880 aa  46.2  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2640  hypothetical protein  39.71 
 
 		 887 aa  46.6  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.24246  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2596  hypothetical protein  39.71 
 
 		 887 aa  46.6  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.889024  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3703  hypothetical protein  21.82 
 
 		 710 aa  45.8  0.003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1272  hypothetical protein  37.93 
 
 		 874 aa  45.8  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2338  hypothetical protein  37.93 
 
 		 874 aa  45.8  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00000220057  unclonable  0.000000361106 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0484  chromosome segregation protein SMC  25.71 
 
 		 1148 aa  45.8  0.003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4566  ATPase involved in DNA repair  34.78 
 
 		 1059 aa  45.4  0.004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.134908  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0003  recombination protein F  46.15 
 
 		 361 aa  45.1  0.005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.1757  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1363  SMC protein-like  31.17 
 
 		 875 aa  45.1  0.005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.922778  normal  0.196985 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0003  DNA replication and repair protein RecF  32.04 
 
 		 370 aa  45.1  0.005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.152297 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_54192  predicted protein  28.83 
 
 		 1099 aa  45.1  0.006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3652  ABC transporter related  29.6 
 
 		 604 aa  44.3  0.008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0985  SMC domain-containing protein  27.96 
 
 		 702 aa  44.3  0.008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000497741 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1348  chromosome segregation protein SMC  30.57 
 
 		 1190 aa  44.3  0.008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.363656  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1270  hypothetical protein  28.67 
 
 		 1181 aa  44.3  0.008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3640  ABC transporter related  30.36 
 
 		 249 aa  44.3  0.009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0644787 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5366  hypothetical protein  30.68 
 
 		 892 aa  44.3  0.009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.786314  normal  0.0115994 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1551  SMC domain-containing protein  25 
 
 		 1074 aa  44.3  0.009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00625316 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1985  hypothetical protein  32.18 
 
 		 771 aa  44.3  0.009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.229709  normal  0.0294644 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0172  DNA sulfur modification protein DndD  26.96 
 
 		 664 aa  44.3  0.01  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>