42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_7392 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_7392  hypothetical protein  100 
 
 		 874 aa  1772    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15610  hypothetical protein  50.58 
 
 		 868 aa  825    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000202138  unclonable  3.13733e-21 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0267  hypothetical protein  37.72 
 
 		 872 aa  553  1e-156  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0127  hypothetical protein  33.14 
 
 		 869 aa  426  1e-118  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4456  hypothetical protein  31.08 
 
 		 833 aa  325  2e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.681645 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2026  hypothetical protein  29.58 
 
 		 897 aa  301  5e-80  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.657836  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4940  hypothetical protein  30.88 
 
 		 878 aa  297  5e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.188257  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7587  SMC domain-containing protein  27.33 
 
 		 873 aa  290  7e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.328529  normal  0.0896714 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4992  hypothetical protein  28.02 
 
 		 881 aa  290  8e-77  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0643  ATPase  27.45 
 
 		 781 aa  287  7e-76  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3692  hypothetical protein  27.83 
 
 		 891 aa  283  7.000000000000001e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000374969 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3841  hypothetical protein  28.44 
 
 		 895 aa  254  3e-66  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3054  hypothetical protein  30.93 
 
 		 896 aa  243  7.999999999999999e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7689  hypothetical protein  46.93 
 
 		 597 aa  206  2e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.140286 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6595  hypothetical protein  29.18 
 
 		 880 aa  195  3e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2596  hypothetical protein  27.16 
 
 		 887 aa  166  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.889024  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2640  hypothetical protein  27.16 
 
 		 887 aa  166  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.24246  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0107  hypothetical protein  24.86 
 
 		 869 aa  164  5.0000000000000005e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06300  hypothetical protein  47.25 
 
 		 854 aa  77.8  0.0000000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1967  hypothetical protein  31.54 
 
 		 844 aa  66.6  0.000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.972801  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2644  hypothetical protein  25 
 
 		 643 aa  54.7  0.000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.382571  normal  1 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4292  hypothetical protein  43.24 
 
 		 770 aa  52.8  0.00003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1151  hypothetical protein  23.88 
 
 		 743 aa  52.4  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.515935  normal  0.0297929 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3982  hypothetical protein  38.03 
 
 		 881 aa  52.4  0.00004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0815711  hitchhiker  0.00348599 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2428  hypothetical protein  38.96 
 
 		 849 aa  51.6  0.00007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0793097 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3083  hypothetical protein  41.18 
 
 		 796 aa  50.8  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3707  SMC domain-containing protein  39.44 
 
 		 881 aa  50.1  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0892  hypothetical protein  43.94 
 
 		 890 aa  50.1  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.608011 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3987  hypothetical protein  38.96 
 
 		 803 aa  48.1  0.0008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5366  hypothetical protein  38.89 
 
 		 892 aa  47.8  0.0008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.786314  normal  0.0115994 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5100  SMC domain protein  41.54 
 
 		 676 aa  47.4  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.13432  normal  0.797675 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2343  SMC domain protein  29.67 
 
 		 912 aa  47  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2338  hypothetical protein  30 
 
 		 874 aa  46.6  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00000220057  unclonable  0.000000361106 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2668  hypothetical protein  37.33 
 
 		 695 aa  47  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1272  hypothetical protein  30 
 
 		 874 aa  46.6  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1985  hypothetical protein  33.7 
 
 		 771 aa  46.2  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.229709  normal  0.0294644 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1494  ABC transporter related  37.68 
 
 		 482 aa  45.8  0.003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0334764  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39480  hypothetical protein  33.61 
 
 		 717 aa  46.2  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000519045  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1363  SMC protein-like  38.57 
 
 		 875 aa  45.4  0.004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.922778  normal  0.196985 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1420  hypothetical protein  30.91 
 
 		 874 aa  45.4  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.542957  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0471  hypothetical protein  35.14 
 
 		 771 aa  45.4  0.004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1721  RloC protein, putative  36.14 
 
 		 776 aa  44.7  0.008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>