36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_3054 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_3054  hypothetical protein  100 
 
 		 896 aa  1807    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4456  hypothetical protein  31.93 
 
 		 833 aa  317  5e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.681645 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0127  hypothetical protein  28.82 
 
 		 869 aa  317  9e-85  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4940  hypothetical protein  33.17 
 
 		 878 aa  313  7.999999999999999e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.188257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4992  hypothetical protein  28.56 
 
 		 881 aa  251  4e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2026  hypothetical protein  27.69 
 
 		 897 aa  248  3e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.657836  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15610  hypothetical protein  28.99 
 
 		 868 aa  238  4e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000202138  unclonable  3.13733e-21 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7392  hypothetical protein  30.3 
 
 		 874 aa  233  1e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0643  ATPase  27.33 
 
 		 781 aa  221  3.9999999999999997e-56  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3841  hypothetical protein  27.51 
 
 		 895 aa  218  4e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0267  hypothetical protein  27.55 
 
 		 872 aa  209  1e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6595  hypothetical protein  30.52 
 
 		 880 aa  197  5.000000000000001e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7587  SMC domain-containing protein  26.04 
 
 		 873 aa  197  6e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.328529  normal  0.0896714 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0107  hypothetical protein  23.45 
 
 		 869 aa  181  4e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3692  hypothetical protein  27.22 
 
 		 891 aa  170  1e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000374969 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2640  hypothetical protein  26.36 
 
 		 887 aa  164  7e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.24246  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2596  hypothetical protein  26.36 
 
 		 887 aa  164  7e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.889024  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06300  hypothetical protein  26.53 
 
 		 854 aa  151  6e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7689  hypothetical protein  30.21 
 
 		 597 aa  72.4  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.140286 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2428  hypothetical protein  22.55 
 
 		 849 aa  68.6  0.0000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0793097 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1967  hypothetical protein  27.21 
 
 		 844 aa  66.2  0.000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.972801  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0892  hypothetical protein  42.05 
 
 		 890 aa  55.8  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.608011 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1363  SMC protein-like  31.01 
 
 		 875 aa  52.8  0.00003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.922778  normal  0.196985 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4292  hypothetical protein  38.55 
 
 		 770 aa  51.2  0.00009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2644  hypothetical protein  31.43 
 
 		 643 aa  50.1  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.382571  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3707  SMC domain-containing protein  36.47 
 
 		 881 aa  49.3  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3111  hypothetical protein  41.11 
 
 		 765 aa  48.9  0.0004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2343  SMC domain protein  36.62 
 
 		 912 aa  48.9  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3982  hypothetical protein  37.66 
 
 		 881 aa  48.5  0.0005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0815711  hitchhiker  0.00348599 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3083  hypothetical protein  40.79 
 
 		 796 aa  48.1  0.0008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3325  hypothetical protein  38.37 
 
 		 763 aa  47.8  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5366  hypothetical protein  31.76 
 
 		 892 aa  45.8  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.786314  normal  0.0115994 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4229  hypothetical protein  37.8 
 
 		 722 aa  45.8  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0264095  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39480  hypothetical protein  35.96 
 
 		 717 aa  45.4  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000519045  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1580  SMC domain protein  26.72 
 
 		 818 aa  45.4  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.338996  normal  0.282314 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2030  DNA repair protein RecN  40.58 
 
 		 551 aa  44.3  0.01  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>