16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_3325 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008687  Pden_3325  hypothetical protein  100 
 
 		 763 aa  1573    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3111  hypothetical protein  55 
 
 		 765 aa  818    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4292  hypothetical protein  28.35 
 
 		 770 aa  274  4.0000000000000004e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2596  hypothetical protein  23.63 
 
 		 887 aa  65.5  0.000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.889024  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2640  hypothetical protein  23.63 
 
 		 887 aa  65.5  0.000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.24246  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1721  RloC protein, putative  21.35 
 
 		 776 aa  61.2  0.00000007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1985  hypothetical protein  21.23 
 
 		 771 aa  61.2  0.00000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.229709  normal  0.0294644 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1967  hypothetical protein  21.06 
 
 		 844 aa  49.3  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.972801  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4456  hypothetical protein  31.25 
 
 		 833 aa  49.7  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.681645 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0643  ATPase  26.62 
 
 		 781 aa  49.7  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0471  hypothetical protein  23.6 
 
 		 771 aa  49.3  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3054  hypothetical protein  38.37 
 
 		 896 aa  47.8  0.0008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4229  hypothetical protein  27.78 
 
 		 722 aa  46.2  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0264095  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4940  hypothetical protein  22.55 
 
 		 878 aa  45.1  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.188257  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3841  hypothetical protein  30.93 
 
 		 895 aa  44.7  0.007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1540  hypothetical protein  21.35 
 
 		 454 aa  44.7  0.007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.172659 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>