27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJE1721 on replicon NC_003912
Organism: Campylobacter jejuni RM1221



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003912  CJE1721  RloC protein, putative  100 
 
 		 776 aa  1516    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0566  hypothetical protein  34.25 
 
 		 810 aa  407  1.0000000000000001e-112  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.913605  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3987  hypothetical protein  32.42 
 
 		 803 aa  401  9.999999999999999e-111  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1868  hypothetical protein  26.19 
 
 		 818 aa  211  4e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.141951  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2619  hypothetical protein  25.78 
 
 		 767 aa  203  9e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.373268 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2637  hypothetical protein  25.59 
 
 		 767 aa  202  1.9999999999999998e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.594259  normal  0.040177 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0471  hypothetical protein  27.49 
 
 		 771 aa  202  1.9999999999999998e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1985  hypothetical protein  27.49 
 
 		 771 aa  192  2e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.229709  normal  0.0294644 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5563  hypothetical protein  22.68 
 
 		 792 aa  164  7e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4229  hypothetical protein  22.53 
 
 		 722 aa  139  2e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0264095  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1874  hypothetical protein  23.28 
 
 		 753 aa  127  1e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1503  hypothetical protein  21.97 
 
 		 792 aa  110  1e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.269689 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1533  hypothetical protein  28 
 
 		 757 aa  93.6  1e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1151  hypothetical protein  23.75 
 
 		 743 aa  86.7  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.515935  normal  0.0297929 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39480  hypothetical protein  20.6 
 
 		 717 aa  72  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000519045  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1488  hypothetical protein  39.56 
 
 		 144 aa  72  0.00000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.016792  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0106  hypothetical protein  22.28 
 
 		 721 aa  70.9  0.00000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3325  hypothetical protein  21.22 
 
 		 763 aa  66.2  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3703  hypothetical protein  23.91 
 
 		 710 aa  64.7  0.000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4238  hypothetical protein  26.79 
 
 		 746 aa  63.9  0.00000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.648959  hitchhiker  0.00399627 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2644  hypothetical protein  30.18 
 
 		 643 aa  60.5  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.382571  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15610  hypothetical protein  38.96 
 
 		 868 aa  48.1  0.0006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000202138  unclonable  3.13733e-21 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4992  hypothetical protein  25.44 
 
 		 881 aa  45.8  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0033  hypothetical protein  25.36 
 
 		 743 aa  45.8  0.003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2428  hypothetical protein  23.17 
 
 		 849 aa  45.1  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0793097 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7392  hypothetical protein  35.71 
 
 		 874 aa  44.7  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2946  FkbM family methyltransferase  26.92 
 
 		 786 aa  43.9  0.01  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.50506  normal  0.560868 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>