22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_0033 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008942  Mlab_0033  hypothetical protein  100 
 
 
743 aa  1501    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1151  hypothetical protein  32.8 
 
 
743 aa  441  9.999999999999999e-123  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.515935  normal  0.0297929 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1533  hypothetical protein  35.38 
 
 
757 aa  412  1e-113  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4238  hypothetical protein  34.98 
 
 
746 aa  411  1e-113  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.648959  hitchhiker  0.00399627 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39480  hypothetical protein  24.48 
 
 
717 aa  228  4e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000519045  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0106  hypothetical protein  25.75 
 
 
721 aa  206  1e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2644  hypothetical protein  23.66 
 
 
643 aa  193  9e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.382571  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3703  hypothetical protein  23.97 
 
 
710 aa  172  2e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0471  hypothetical protein  25.16 
 
 
771 aa  97.4  8e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2637  hypothetical protein  23.45 
 
 
767 aa  97.1  1e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.594259  normal  0.040177 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5563  hypothetical protein  21.01 
 
 
792 aa  94.4  6e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1985  hypothetical protein  23 
 
 
771 aa  92.8  2e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.229709  normal  0.0294644 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2619  hypothetical protein  22.95 
 
 
767 aa  92  3e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.373268 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1868  hypothetical protein  23.15 
 
 
818 aa  86.7  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.141951  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1874  hypothetical protein  21.8 
 
 
753 aa  81.3  0.00000000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0566  hypothetical protein  25.86 
 
 
810 aa  77.4  0.0000000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.913605  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3987  hypothetical protein  22.9 
 
 
803 aa  64.7  0.000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1503  hypothetical protein  19.68 
 
 
792 aa  63.5  0.00000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.269689 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4292  hypothetical protein  19.3 
 
 
770 aa  57.8  0.0000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4229  hypothetical protein  21.35 
 
 
722 aa  53.5  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0264095  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1721  RloC protein, putative  25.36 
 
 
776 aa  46.2  0.002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2620  hypothetical protein  27.41 
 
 
439 aa  45.4  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.98214  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>