30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_3703 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_3703  hypothetical protein  100 
 
 		 710 aa  1474    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39480  hypothetical protein  33.8 
 
 		 717 aa  332  1e-89  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000519045  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2644  hypothetical protein  30.35 
 
 		 643 aa  269  1e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.382571  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0106  hypothetical protein  28.11 
 
 		 721 aa  241  4e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4238  hypothetical protein  25.24 
 
 		 746 aa  191  4e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.648959  hitchhiker  0.00399627 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0033  hypothetical protein  24.03 
 
 		 743 aa  166  2.0000000000000002e-39  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1533  hypothetical protein  22.62 
 
 		 757 aa  164  7e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1151  hypothetical protein  24.74 
 
 		 743 aa  154  4e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.515935  normal  0.0297929 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5563  hypothetical protein  23.4 
 
 		 792 aa  102  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1868  hypothetical protein  21.44 
 
 		 818 aa  100  7e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.141951  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0471  hypothetical protein  23.98 
 
 		 771 aa  96.3  2e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2619  hypothetical protein  22.37 
 
 		 767 aa  95.9  2e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.373268 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2637  hypothetical protein  19.95 
 
 		 767 aa  91.7  4e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.594259  normal  0.040177 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4229  hypothetical protein  27.81 
 
 		 722 aa  89.4  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0264095  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1985  hypothetical protein  22.51 
 
 		 771 aa  81.6  0.00000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.229709  normal  0.0294644 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1874  hypothetical protein  20.74 
 
 		 753 aa  73.9  0.000000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0566  hypothetical protein  31.25 
 
 		 810 aa  64.3  0.000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.913605  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1721  RloC protein, putative  27.45 
 
 		 776 aa  62.8  0.00000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3987  hypothetical protein  40 
 
 		 803 aa  62  0.00000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4292  hypothetical protein  20.37 
 
 		 770 aa  58.9  0.0000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1967  hypothetical protein  23.29 
 
 		 844 aa  52.4  0.00003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.972801  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3054  anticodon nuclease PrrC  24.81 
 
 		 401 aa  49.3  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.165862  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1503  hypothetical protein  31.91 
 
 		 792 aa  47.8  0.0008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.269689 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3841  hypothetical protein  37.78 
 
 		 895 aa  47.4  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0130  anticodon nuclease  29.34 
 
 		 366 aa  46.6  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.4198 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4395  hypothetical protein  31.4 
 
 		 410 aa  45.8  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.414089  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3083  hypothetical protein  21.82 
 
 		 796 aa  45.8  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2396  anticodon nuclease  32.1 
 
 		 377 aa  45.4  0.004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.000000000000459061  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2428  hypothetical protein  31.73 
 
 		 849 aa  44.3  0.007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0793097 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4940  hypothetical protein  33.75 
 
 		 878 aa  44.3  0.008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.188257  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>