30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_0566 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_3987  hypothetical protein  49.37 
 
 
803 aa  783    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0566  hypothetical protein  100 
 
 
810 aa  1666    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.913605  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1721  RloC protein, putative  33.88 
 
 
776 aa  394  1e-108  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2637  hypothetical protein  26.27 
 
 
767 aa  197  9e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.594259  normal  0.040177 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2619  hypothetical protein  25.9 
 
 
767 aa  195  2e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.373268 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1868  hypothetical protein  25.47 
 
 
818 aa  189  2e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.141951  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5563  hypothetical protein  23.85 
 
 
792 aa  183  9.000000000000001e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1985  hypothetical protein  27.24 
 
 
771 aa  183  9.000000000000001e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.229709  normal  0.0294644 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0471  hypothetical protein  26.05 
 
 
771 aa  179  2e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4229  hypothetical protein  24.1 
 
 
722 aa  142  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0264095  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1874  hypothetical protein  23.78 
 
 
753 aa  127  9e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1503  hypothetical protein  22.73 
 
 
792 aa  122  3e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.269689 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1151  hypothetical protein  23.13 
 
 
743 aa  105  5e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.515935  normal  0.0297929 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39480  hypothetical protein  24.56 
 
 
717 aa  83.2  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000519045  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2644  hypothetical protein  24.73 
 
 
643 aa  75.1  0.000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.382571  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0106  hypothetical protein  23.01 
 
 
721 aa  72  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0033  hypothetical protein  23.02 
 
 
743 aa  71.6  0.00000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1488  hypothetical protein  33.08 
 
 
144 aa  68.9  0.0000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.016792  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3703  hypothetical protein  31.25 
 
 
710 aa  64.3  0.000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4238  hypothetical protein  23.03 
 
 
746 aa  55.5  0.000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.648959  hitchhiker  0.00399627 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4292  hypothetical protein  20.42 
 
 
770 aa  52.4  0.00003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15610  hypothetical protein  33.09 
 
 
868 aa  52  0.00005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000202138  unclonable  3.13733e-21 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2005  anticodon nuclease  31.31 
 
 
392 aa  49.7  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.924608  normal  0.799191 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2374  anticodon nuclease, putative  31.31 
 
 
392 aa  49.7  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.815652  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3325  hypothetical protein  21.58 
 
 
763 aa  45.4  0.004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2709  SMC domain protein  22.13 
 
 
1036 aa  45.1  0.005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0040  DNA repair ATPase  30.12 
 
 
1051 aa  44.7  0.007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.00000057692  hitchhiker  0.00102482 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0449  anticodon nuclease  33.33 
 
 
366 aa  44.7  0.007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000618209 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7392  hypothetical protein  25.62 
 
 
874 aa  44.3  0.008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4940  hypothetical protein  23.29 
 
 
878 aa  44.3  0.009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.188257  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>