28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_1151 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_1151  hypothetical protein  100 
 
 
743 aa  1526    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.515935  normal  0.0297929 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1533  hypothetical protein  37.08 
 
 
757 aa  495  9.999999999999999e-139  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4238  hypothetical protein  36.18 
 
 
746 aa  470  1.0000000000000001e-131  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.648959  hitchhiker  0.00399627 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0033  hypothetical protein  32.8 
 
 
743 aa  431  1e-119  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0106  hypothetical protein  26.38 
 
 
721 aa  219  2e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39480  hypothetical protein  27.02 
 
 
717 aa  215  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000519045  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2644  hypothetical protein  26.14 
 
 
643 aa  187  7e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.382571  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3703  hypothetical protein  24.74 
 
 
710 aa  154  4e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0566  hypothetical protein  23.13 
 
 
810 aa  99.4  2e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.913605  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3987  hypothetical protein  24.19 
 
 
803 aa  89  3e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2637  hypothetical protein  23.35 
 
 
767 aa  88.2  5e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.594259  normal  0.040177 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2619  hypothetical protein  23.38 
 
 
767 aa  83.6  0.00000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.373268 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5563  hypothetical protein  24.8 
 
 
792 aa  82.4  0.00000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1868  hypothetical protein  23.47 
 
 
818 aa  79  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.141951  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1721  RloC protein, putative  23.76 
 
 
776 aa  77.4  0.0000000000008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0471  hypothetical protein  27.42 
 
 
771 aa  75.9  0.000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1874  hypothetical protein  22.55 
 
 
753 aa  68.2  0.0000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1985  hypothetical protein  34 
 
 
771 aa  68.2  0.0000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.229709  normal  0.0294644 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1503  hypothetical protein  25.93 
 
 
792 aa  65.5  0.000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.269689 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4292  hypothetical protein  24.09 
 
 
770 aa  64.3  0.000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4229  hypothetical protein  24.57 
 
 
722 aa  63.2  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0264095  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3841  hypothetical protein  33.65 
 
 
895 aa  48.9  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15610  hypothetical protein  25.14 
 
 
868 aa  48.5  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000202138  unclonable  3.13733e-21 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0127  hypothetical protein  24.93 
 
 
869 aa  48.1  0.0006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0018  hypothetical protein  22.44 
 
 
712 aa  47.8  0.0007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.485123  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0142  hypothetical protein  22.44 
 
 
712 aa  47.8  0.0008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7392  hypothetical protein  24.66 
 
 
874 aa  47.4  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4456  hypothetical protein  23.28 
 
 
833 aa  45.4  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.681645 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>