30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_2637 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003295  RSc2619  hypothetical protein  93.74 
 
 
767 aa  1507    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.373268 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1868  hypothetical protein  94.39 
 
 
818 aa  1511    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.141951  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2637  hypothetical protein  100 
 
 
767 aa  1592    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.594259  normal  0.040177 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0471  hypothetical protein  41.79 
 
 
771 aa  592  1e-168  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1985  hypothetical protein  41.06 
 
 
771 aa  589  1e-167  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.229709  normal  0.0294644 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5563  hypothetical protein  27.51 
 
 
792 aa  288  2.9999999999999996e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1874  hypothetical protein  27.22 
 
 
753 aa  222  1.9999999999999999e-56  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4229  hypothetical protein  24.62 
 
 
722 aa  201  6e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0264095  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1721  RloC protein, putative  25.46 
 
 
776 aa  191  2.9999999999999997e-47  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0566  hypothetical protein  26.01 
 
 
810 aa  191  5.999999999999999e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.913605  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3987  hypothetical protein  24.77 
 
 
803 aa  175  3.9999999999999995e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1503  hypothetical protein  24.44 
 
 
792 aa  166  2.0000000000000002e-39  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.269689 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3703  hypothetical protein  19.95 
 
 
710 aa  91.7  5e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0033  hypothetical protein  22.89 
 
 
743 aa  90.9  8e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1151  hypothetical protein  23.35 
 
 
743 aa  88.2  5e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.515935  normal  0.0297929 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1533  hypothetical protein  27.37 
 
 
757 aa  87.4  9e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4292  hypothetical protein  22.66 
 
 
770 aa  82.4  0.00000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1488  hypothetical protein  37.4 
 
 
144 aa  76.6  0.000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.016792  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39480  hypothetical protein  26.07 
 
 
717 aa  74.3  0.000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000519045  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2644  hypothetical protein  26.47 
 
 
643 aa  72.8  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.382571  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0106  hypothetical protein  21.97 
 
 
721 aa  69.7  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3841  hypothetical protein  32 
 
 
895 aa  54.7  0.000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4238  hypothetical protein  27.42 
 
 
746 aa  52.8  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.648959  hitchhiker  0.00399627 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1085  DNA repair ATPase-like protein  29.76 
 
 
741 aa  51.6  0.00005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0841172  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0698  hypothetical protein  30.97 
 
 
156 aa  47.4  0.0009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1967  hypothetical protein  36.99 
 
 
844 aa  46.6  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.972801  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2348  hypothetical protein  27.54 
 
 
162 aa  45.4  0.004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3582  ABC transporter-related protein  29.29 
 
 
341 aa  44.7  0.007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0126168  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6595  hypothetical protein  20.12 
 
 
880 aa  44.3  0.009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0111  ABC transporter, ATP-binding protein  29.66 
 
 
341 aa  44.3  0.01  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000413393  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>