33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_0127 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_0127  hypothetical protein  100 
 
 		 869 aa  1774    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15610  hypothetical protein  34.85 
 
 		 868 aa  436  1e-120  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000202138  unclonable  3.13733e-21 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7392  hypothetical protein  33.22 
 
 		 874 aa  422  1e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0267  hypothetical protein  30.87 
 
 		 872 aa  380  1e-104  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4940  hypothetical protein  33 
 
 		 878 aa  375  1e-102  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.188257  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4456  hypothetical protein  33.14 
 
 		 833 aa  357  5e-97  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.681645 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2026  hypothetical protein  29.2 
 
 		 897 aa  339  9.999999999999999e-92  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.657836  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0643  ATPase  29.27 
 
 		 781 aa  315  2.9999999999999996e-84  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3054  hypothetical protein  28.93 
 
 		 896 aa  313  1e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4992  hypothetical protein  29.47 
 
 		 881 aa  310  6.999999999999999e-83  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3841  hypothetical protein  27.7 
 
 		 895 aa  298  4e-79  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7587  SMC domain-containing protein  28.36 
 
 		 873 aa  278  4e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.328529  normal  0.0896714 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6595  hypothetical protein  29.27 
 
 		 880 aa  250  6e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3692  hypothetical protein  26.38 
 
 		 891 aa  244  5e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000374969 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0107  hypothetical protein  26.18 
 
 		 869 aa  215  2.9999999999999995e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2640  hypothetical protein  26.08 
 
 		 887 aa  187  9e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.24246  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2596  hypothetical protein  26.08 
 
 		 887 aa  187  9e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.889024  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06300  hypothetical protein  25.22 
 
 		 854 aa  181  4.999999999999999e-44  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7689  hypothetical protein  35.27 
 
 		 597 aa  128  4.0000000000000003e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.140286 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1967  hypothetical protein  23.97 
 
 		 844 aa  97.1  1e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.972801  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2428  hypothetical protein  23.42 
 
 		 849 aa  57.4  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0793097 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0892  hypothetical protein  44.62 
 
 		 890 aa  52.8  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.608011 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3083  hypothetical protein  38.37 
 
 		 796 aa  51.6  0.00007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2011  DNA repair protein RecN  33.33 
 
 		 580 aa  50.1  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.270463  normal  0.0516704 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1151  hypothetical protein  24.93 
 
 		 743 aa  48.1  0.0007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.515935  normal  0.0297929 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3982  hypothetical protein  32.56 
 
 		 881 aa  47  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0815711  hitchhiker  0.00348599 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3707  SMC domain-containing protein  33.72 
 
 		 881 aa  47.4  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1363  SMC protein-like  35 
 
 		 875 aa  46.6  0.002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.922778  normal  0.196985 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2579  DNA repair protein RecN  30.14 
 
 		 562 aa  45.8  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.183283 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4772  ABC transporter related  33.08 
 
 		 500 aa  45.4  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1342  DNA repair protein RecN  31.85 
 
 		 574 aa  45.4  0.004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1933  ABC transporter related  28.39 
 
 		 272 aa  45.4  0.005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0106  hypothetical protein  26.96 
 
 		 721 aa  44.7  0.009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>