69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_4292 on replicon NC_007901
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007901  Rfer_4292  hypothetical protein  100 
 
 		 770 aa  1569    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3111  hypothetical protein  31.93 
 
 		 765 aa  288  2e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3325  hypothetical protein  28.35 
 
 		 763 aa  283  7.000000000000001e-75  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2619  hypothetical protein  23.08 
 
 		 767 aa  92.4  3e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.373268 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2637  hypothetical protein  23.43 
 
 		 767 aa  90.1  2e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.594259  normal  0.040177 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1868  hypothetical protein  22.77 
 
 		 818 aa  87.4  9e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.141951  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1151  hypothetical protein  24.09 
 
 		 743 aa  67.4  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.515935  normal  0.0297929 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3703  hypothetical protein  20.49 
 
 		 710 aa  65.5  0.000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0106  hypothetical protein  24.34 
 
 		 721 aa  63.5  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5563  hypothetical protein  28.49 
 
 		 792 aa  63.5  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0033  hypothetical protein  20.18 
 
 		 743 aa  61.2  0.00000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1985  hypothetical protein  31.73 
 
 		 771 aa  61.2  0.00000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.229709  normal  0.0294644 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0471  hypothetical protein  30 
 
 		 771 aa  60.1  0.0000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1874  hypothetical protein  27.18 
 
 		 753 aa  57  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4992  hypothetical protein  45.33 
 
 		 881 aa  56.2  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4456  hypothetical protein  24.29 
 
 		 833 aa  55.5  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.681645 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4238  hypothetical protein  22.37 
 
 		 746 aa  55.5  0.000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.648959  hitchhiker  0.00399627 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7392  hypothetical protein  43.24 
 
 		 874 aa  52.8  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4229  hypothetical protein  32.1 
 
 		 722 aa  52.8  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0264095  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0566  hypothetical protein  21.21 
 
 		 810 aa  52  0.00004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.913605  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2026  hypothetical protein  32.11 
 
 		 897 aa  51.6  0.00005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.657836  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4940  hypothetical protein  35.78 
 
 		 878 aa  52  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.188257  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2644  hypothetical protein  28 
 
 		 643 aa  51.6  0.00005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.382571  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3054  hypothetical protein  38.55 
 
 		 896 aa  51.2  0.00007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2596  hypothetical protein  40.48 
 
 		 887 aa  49.7  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.889024  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1533  hypothetical protein  21.86 
 
 		 757 aa  49.7  0.0002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2640  hypothetical protein  40.48 
 
 		 887 aa  49.7  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.24246  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0490  ABC transporter related  26.92 
 
 		 241 aa  49.7  0.0002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39480  hypothetical protein  30.19 
 
 		 717 aa  49.3  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000519045  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3841  hypothetical protein  33.33 
 
 		 895 aa  48.9  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4318  ABC transporter related  33.63 
 
 		 263 aa  49.3  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.274377  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2428  hypothetical protein  39.74 
 
 		 849 aa  48.9  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0793097 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0892  hypothetical protein  33.64 
 
 		 890 aa  48.5  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.608011 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2351  ABC transporter related protein  34.95 
 
 		 260 aa  48.1  0.0006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  9.55453e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06300  hypothetical protein  38.82 
 
 		 854 aa  47.8  0.0008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1085  DNA repair ATPase-like protein  23.04 
 
 		 741 aa  47.8  0.0008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0841172  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1820  ABC transporter related protein  28.57 
 
 		 252 aa  47.4  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.257202  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1006  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  26.32 
 
 		 271 aa  47  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3650  ABC transporter related  30.77 
 
 		 517 aa  47.4  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0294  ABC basic amino acid transporter, ATPase subunit  29.46 
 
 		 265 aa  46.2  0.002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.311717  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0809  hypothetical protein  27.54 
 
 		 703 aa  45.4  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000260576 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2369  ABC transporter related  32.61 
 
 		 246 aa  45.8  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1540  hypothetical protein  22.9 
 
 		 454 aa  45.8  0.003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.172659 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15610  hypothetical protein  32.62 
 
 		 868 aa  45.8  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000202138  unclonable  3.13733e-21 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_12101  ABC transporter for amino acids, ATP binding component  31.43 
 
 		 246 aa  45.8  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3692  hypothetical protein  29.52 
 
 		 891 aa  45.8  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000374969 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14761  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  32.5 
 
 		 248 aa  45.4  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.0558262 
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0018  hypothetical protein  25.18 
 
 		 712 aa  45.4  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.485123  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0142  hypothetical protein  25.18 
 
 		 712 aa  45.1  0.005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1797  ABC transporter related  27.78 
 
 		 254 aa  45.1  0.005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.131538  normal  0.177117 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0934  polar amino acid ABC transporter ATPase  29.91 
 
 		 276 aa  44.7  0.006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0157  ABC transporter related protein  35.82 
 
 		 675 aa  44.7  0.006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2775  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  30.48 
 
 		 254 aa  45.1  0.006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3987  hypothetical protein  38.96 
 
 		 803 aa  44.7  0.006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0324  ABC transporter related  28.57 
 
 		 265 aa  44.7  0.007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3507  ABC transporter related  27.78 
 
 		 254 aa  44.7  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0491012  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2355  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  29.21 
 
 		 242 aa  44.7  0.007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1435  ABC transporter related  28.28 
 
 		 278 aa  44.7  0.007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.627828  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0267  hypothetical protein  34.51 
 
 		 872 aa  44.7  0.007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3399  ABC transporter related  29.07 
 
 		 241 aa  44.7  0.007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1671  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  29 
 
 		 248 aa  44.3  0.008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.513247  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27170  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  31.76 
 
 		 268 aa  44.3  0.008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0131  ABC transporter related  32.53 
 
 		 585 aa  44.3  0.008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0107  hypothetical protein  22.71 
 
 		 869 aa  44.3  0.008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12291  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  30.77 
 
 		 246 aa  44.3  0.009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.782206  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0643  ATPase  26.5 
 
 		 781 aa  44.3  0.009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2805  ABC transporter related protein  28.74 
 
 		 242 aa  44.3  0.009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1503  hypothetical protein  23.98 
 
 		 792 aa  44.3  0.01  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.269689 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3237  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  29.29 
 
 		 259 aa  43.9  0.01  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0314824  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>