22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_3111 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_3111  hypothetical protein  100 
 
 		 765 aa  1548    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3325  hypothetical protein  55 
 
 		 763 aa  830    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4292  hypothetical protein  31.93 
 
 		 770 aa  293  9e-78  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5563  hypothetical protein  22.62 
 
 		 792 aa  63.9  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0471  hypothetical protein  20.15 
 
 		 771 aa  62.4  0.00000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39480  hypothetical protein  22.52 
 
 		 717 aa  60.5  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000519045  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1985  hypothetical protein  19.17 
 
 		 771 aa  59.3  0.0000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.229709  normal  0.0294644 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3703  hypothetical protein  22.59 
 
 		 710 aa  54.7  0.000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2637  hypothetical protein  20.85 
 
 		 767 aa  52.8  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.594259  normal  0.040177 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1151  hypothetical protein  22.22 
 
 		 743 aa  52.8  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.515935  normal  0.0297929 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1503  hypothetical protein  22.4 
 
 		 792 aa  53.1  0.00002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.269689 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2026  hypothetical protein  29.82 
 
 		 897 aa  50.8  0.00008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.657836  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1868  hypothetical protein  20.9 
 
 		 818 aa  51.2  0.00008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.141951  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3054  hypothetical protein  41.11 
 
 		 896 aa  48.9  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1967  hypothetical protein  32.97 
 
 		 844 aa  48.1  0.0006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.972801  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1507  SMC domain protein  38.57 
 
 		 1115 aa  45.8  0.003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.44218  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0643  ATPase  31.82 
 
 		 781 aa  45.4  0.004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4238  hypothetical protein  19.21 
 
 		 746 aa  45.1  0.005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.648959  hitchhiker  0.00399627 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1533  hypothetical protein  20.2 
 
 		 757 aa  44.7  0.006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1874  hypothetical protein  24.17 
 
 		 753 aa  44.3  0.008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0696  SMC domain protein  34.52 
 
 		 618 aa  44.3  0.008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1219  anticodon nuclease  31.65 
 
 		 378 aa  43.9  0.01  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0244306  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>