26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_2026 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_2026  hypothetical protein  100 
 
 
897 aa  1840    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.657836  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3841  hypothetical protein  33.59 
 
 
895 aa  469  9.999999999999999e-131  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4992  hypothetical protein  29.99 
 
 
881 aa  343  7e-93  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0127  hypothetical protein  29.46 
 
 
869 aa  340  8e-92  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4940  hypothetical protein  30.91 
 
 
878 aa  331  4e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.188257  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15610  hypothetical protein  28.68 
 
 
868 aa  304  4.0000000000000003e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000202138  unclonable  3.13733e-21 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4456  hypothetical protein  30.56 
 
 
833 aa  300  1e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.681645 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7392  hypothetical protein  29.11 
 
 
874 aa  289  1e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0267  hypothetical protein  28.25 
 
 
872 aa  285  3.0000000000000004e-75  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3054  hypothetical protein  27.91 
 
 
896 aa  250  9e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7587  SMC domain-containing protein  27.22 
 
 
873 aa  234  4.0000000000000004e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.328529  normal  0.0896714 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0643  ATPase  26.79 
 
 
781 aa  218  4e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6595  hypothetical protein  28.13 
 
 
880 aa  202  1.9999999999999998e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3692  hypothetical protein  26.43 
 
 
891 aa  175  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000374969 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0107  hypothetical protein  24.68 
 
 
869 aa  157  1e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06300  hypothetical protein  23.95 
 
 
854 aa  134  1.0000000000000001e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2640  hypothetical protein  24.35 
 
 
887 aa  120  7.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.24246  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2596  hypothetical protein  24.35 
 
 
887 aa  120  7.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.889024  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7689  hypothetical protein  34.51 
 
 
597 aa  94  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.140286 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2428  hypothetical protein  37.84 
 
 
849 aa  52.4  0.00004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0793097 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4292  hypothetical protein  32.11 
 
 
770 aa  51.2  0.00008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3111  hypothetical protein  29.82 
 
 
765 aa  50.8  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3083  hypothetical protein  36.47 
 
 
796 aa  47.4  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1494  ABC transporter related  33.73 
 
 
482 aa  46.2  0.003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0334764  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3087  ABC transporter related  37.14 
 
 
498 aa  45.1  0.006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1967  hypothetical protein  21.34 
 
 
844 aa  44.3  0.01  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.972801  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>