32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_7689 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008782  Ajs_2529  hypothetical protein  86.67 
 
 
684 aa  700    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0104824  hitchhiker  0.000333956 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15590  hypothetical protein  85.95 
 
 
705 aa  686    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.00000000202658  unclonable  2.39416e-21 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7689  hypothetical protein  100 
 
 
597 aa  1236    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.140286 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5332  Sea12  88.41 
 
 
687 aa  704    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4500  DEAD/DEAH box helicase-like  84.27 
 
 
692 aa  676    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.235667  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1963  Pseudomurein-binding repeat protein  75.73 
 
 
683 aa  610  1e-173  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0186142  normal  0.027049 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0264  hypothetical protein  74.4 
 
 
689 aa  588  1e-167  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.942958  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1285  YeeB-like protein  72.73 
 
 
703 aa  588  1e-167  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000202584 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1751  YeeB-like protein  72.19 
 
 
702 aa  580  1e-164  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3314  hypothetical protein  70.51 
 
 
691 aa  568  1e-160  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15610  hypothetical protein  87.5 
 
 
868 aa  421  1e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000202138  unclonable  3.13733e-21 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1466  hypothetical protein  56.28 
 
 
683 aa  412  1e-114  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3042  DEAD-like helicase  54.27 
 
 
669 aa  410  1e-113  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0029  helicase-like  57.1 
 
 
693 aa  412  1e-113  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0760  DEAD/DEAH box helicase-like  50.95 
 
 
646 aa  384  1e-105  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.254087  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7392  hypothetical protein  46.93 
 
 
874 aa  206  8e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0267  hypothetical protein  39.66 
 
 
872 aa  158  2e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0127  hypothetical protein  35.27 
 
 
869 aa  128  2.0000000000000002e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4940  hypothetical protein  35.81 
 
 
878 aa  120  6e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.188257  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0643  ATPase  32.14 
 
 
781 aa  107  8e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3841  hypothetical protein  35.81 
 
 
895 aa  96.3  1e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4992  hypothetical protein  35.32 
 
 
881 aa  96.3  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4456  hypothetical protein  37.85 
 
 
833 aa  95.1  4e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.681645 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2026  hypothetical protein  34.51 
 
 
897 aa  94.4  6e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.657836  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3692  hypothetical protein  26.87 
 
 
891 aa  80.9  0.00000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000374969 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7587  SMC domain-containing protein  28.96 
 
 
873 aa  79.3  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.328529  normal  0.0896714 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3054  hypothetical protein  30.21 
 
 
896 aa  72.4  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6595  hypothetical protein  55.74 
 
 
880 aa  71.6  0.00000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0107  hypothetical protein  28.71 
 
 
869 aa  69.3  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2640  hypothetical protein  62.5 
 
 
887 aa  53.1  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.24246  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2596  hypothetical protein  62.5 
 
 
887 aa  53.1  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.889024  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06300  hypothetical protein  60 
 
 
854 aa  51.2  0.00006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>