27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_3692 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_3692  hypothetical protein  100 
 
 		 891 aa  1840    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000374969 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7587  SMC domain-containing protein  45.85 
 
 		 873 aa  723    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.328529  normal  0.0896714 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7392  hypothetical protein  27.83 
 
 		 874 aa  274  6e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15610  hypothetical protein  27.57 
 
 		 868 aa  251  3e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000202138  unclonable  3.13733e-21 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0127  hypothetical protein  26.38 
 
 		 869 aa  244  5e-63  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0267  hypothetical protein  26.61 
 
 		 872 aa  243  1e-62  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4992  hypothetical protein  26.32 
 
 		 881 aa  209  2e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4456  hypothetical protein  26.35 
 
 		 833 aa  203  9.999999999999999e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.681645 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4940  hypothetical protein  27.78 
 
 		 878 aa  192  2.9999999999999997e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.188257  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3841  hypothetical protein  26.78 
 
 		 895 aa  182  2e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2026  hypothetical protein  26.43 
 
 		 897 aa  171  6e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.657836  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3054  hypothetical protein  27.36 
 
 		 896 aa  166  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0643  ATPase  24.2 
 
 		 781 aa  166  3e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6595  hypothetical protein  26.98 
 
 		 880 aa  152  2e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0107  hypothetical protein  24.08 
 
 		 869 aa  131  6e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2596  hypothetical protein  24.42 
 
 		 887 aa  126  1e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.889024  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2640  hypothetical protein  24.42 
 
 		 887 aa  126  1e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.24246  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06300  hypothetical protein  24.21 
 
 		 854 aa  112  2.0000000000000002e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7689  hypothetical protein  26.87 
 
 		 597 aa  80.9  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.140286 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1967  hypothetical protein  45.59 
 
 		 844 aa  54.3  0.00001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.972801  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3083  hypothetical protein  34.94 
 
 		 796 aa  47.8  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0892  hypothetical protein  36.36 
 
 		 890 aa  47  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.608011 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3056  ABC transporter related  26.86 
 
 		 223 aa  47  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0381  ATPase  33.33 
 
 		 718 aa  46.2  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.700678  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2668  hypothetical protein  27.17 
 
 		 695 aa  46.2  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2428  hypothetical protein  36.23 
 
 		 849 aa  45.4  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0793097 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4292  hypothetical protein  29.52 
 
 		 770 aa  45.1  0.005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>