30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_2428 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_2428  hypothetical protein  100 
 
 		 849 aa  1753    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0793097 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1967  hypothetical protein  30.99 
 
 		 844 aa  380  1e-104  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.972801  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06300  hypothetical protein  22.41 
 
 		 854 aa  65.9  0.000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3054  hypothetical protein  22.55 
 
 		 896 aa  65.5  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0643  ATPase  25.79 
 
 		 781 aa  58.9  0.0000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3083  hypothetical protein  32.82 
 
 		 796 aa  58.5  0.0000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3841  hypothetical protein  25.71 
 
 		 895 aa  58.2  0.0000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0127  hypothetical protein  23.42 
 
 		 869 aa  57.4  0.000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6595  hypothetical protein  19.45 
 
 		 880 aa  56.2  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4992  hypothetical protein  22.92 
 
 		 881 aa  52.4  0.00004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2026  hypothetical protein  37.84 
 
 		 897 aa  52.4  0.00004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.657836  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0107  hypothetical protein  21.83 
 
 		 869 aa  52  0.00005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2640  hypothetical protein  41.03 
 
 		 887 aa  51.2  0.00008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.24246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7392  hypothetical protein  38.96 
 
 		 874 aa  51.2  0.00008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2596  hypothetical protein  41.03 
 
 		 887 aa  51.2  0.00008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.889024  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15610  hypothetical protein  40.26 
 
 		 868 aa  49.7  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000202138  unclonable  3.13733e-21 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0892  hypothetical protein  31.09 
 
 		 890 aa  49.3  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.608011 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39480  hypothetical protein  25.34 
 
 		 717 aa  48.9  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000519045  normal  1 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4292  hypothetical protein  39.74 
 
 		 770 aa  48.5  0.0005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7587  SMC domain-containing protein  22.92 
 
 		 873 aa  48.5  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.328529  normal  0.0896714 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4940  hypothetical protein  37.21 
 
 		 878 aa  47.8  0.0009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.188257  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4238  hypothetical protein  22.75 
 
 		 746 aa  47  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.648959  hitchhiker  0.00399627 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2338  hypothetical protein  37.84 
 
 		 874 aa  45.4  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00000220057  unclonable  0.000000361106 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5366  hypothetical protein  36.11 
 
 		 892 aa  45.4  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.786314  normal  0.0115994 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1272  hypothetical protein  37.84 
 
 		 874 aa  45.4  0.004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3692  hypothetical protein  36.23 
 
 		 891 aa  45.4  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000374969 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3707  SMC domain-containing protein  47.62 
 
 		 881 aa  45.4  0.005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1721  RloC protein, putative  23.17 
 
 		 776 aa  45.4  0.005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1985  hypothetical protein  22.52 
 
 		 771 aa  44.7  0.008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.229709  normal  0.0294644 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3703  hypothetical protein  31.73 
 
 		 710 aa  44.3  0.009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>