27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_0643 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_0643  ATPase  100 
 
 		 781 aa  1615    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0127  hypothetical protein  29.27 
 
 		 869 aa  315  2.9999999999999996e-84  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15610  hypothetical protein  28.62 
 
 		 868 aa  283  7.000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000202138  unclonable  3.13733e-21 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7392  hypothetical protein  27.12 
 
 		 874 aa  271  2.9999999999999997e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4940  hypothetical protein  28.07 
 
 		 878 aa  256  1.0000000000000001e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.188257  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0267  hypothetical protein  26.41 
 
 		 872 aa  242  2e-62  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4456  hypothetical protein  28.29 
 
 		 833 aa  230  7e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.681645 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3841  hypothetical protein  25.55 
 
 		 895 aa  225  3e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3054  hypothetical protein  27.33 
 
 		 896 aa  211  3e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2026  hypothetical protein  26.58 
 
 		 897 aa  210  8e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.657836  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4992  hypothetical protein  25.67 
 
 		 881 aa  199  2.0000000000000003e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7587  SMC domain-containing protein  23.51 
 
 		 873 aa  190  1e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.328529  normal  0.0896714 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6595  hypothetical protein  23.89 
 
 		 880 aa  179  1e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3692  hypothetical protein  24.2 
 
 		 891 aa  166  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000374969 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0107  hypothetical protein  24.29 
 
 		 869 aa  141  3.9999999999999997e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06300  hypothetical protein  22.56 
 
 		 854 aa  125  4e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2640  hypothetical protein  23.32 
 
 		 887 aa  119  3e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.24246  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2596  hypothetical protein  23.32 
 
 		 887 aa  119  3e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.889024  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7689  hypothetical protein  32.14 
 
 		 597 aa  107  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.140286 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1967  hypothetical protein  30.38 
 
 		 844 aa  58.9  0.0000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.972801  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2428  hypothetical protein  25.79 
 
 		 849 aa  58.9  0.0000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0793097 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3325  hypothetical protein  26.62 
 
 		 763 aa  49.7  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3111  hypothetical protein  31.82 
 
 		 765 aa  45.1  0.005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1363  SMC protein-like  32.29 
 
 		 875 aa  44.7  0.006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.922778  normal  0.196985 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1264  ABC transporter related protein  27.67 
 
 		 600 aa  45.1  0.006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.931219  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4292  hypothetical protein  26.5 
 
 		 770 aa  44.3  0.009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0961  SMC domain protein  33.33 
 
 		 891 aa  44.3  0.01  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000356641  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>