37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_A4940 on replicon NC_007510
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007510  Bcep18194_A4940  hypothetical protein  100 
 
 		 878 aa  1772    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.188257  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4456  hypothetical protein  62.33 
 
 		 833 aa  1011    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.681645 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0127  hypothetical protein  33.22 
 
 		 869 aa  389  1e-107  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2026  hypothetical protein  30.99 
 
 		 897 aa  348  2e-94  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.657836  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3054  hypothetical protein  33.21 
 
 		 896 aa  329  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15610  hypothetical protein  31.39 
 
 		 868 aa  327  5e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000202138  unclonable  3.13733e-21 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7392  hypothetical protein  30.82 
 
 		 874 aa  312  2e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0267  hypothetical protein  29.11 
 
 		 872 aa  275  4.0000000000000004e-72  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0643  ATPase  28.36 
 
 		 781 aa  274  4.0000000000000004e-72  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3841  hypothetical protein  28.6 
 
 		 895 aa  269  2e-70  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4992  hypothetical protein  27.98 
 
 		 881 aa  265  2e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6595  hypothetical protein  29.85 
 
 		 880 aa  245  3e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7587  SMC domain-containing protein  27.31 
 
 		 873 aa  230  8e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.328529  normal  0.0896714 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3692  hypothetical protein  28.41 
 
 		 891 aa  216  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000374969 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0107  hypothetical protein  23.46 
 
 		 869 aa  159  2e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2640  hypothetical protein  26.8 
 
 		 887 aa  154  5e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.24246  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2596  hypothetical protein  26.8 
 
 		 887 aa  154  5e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.889024  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7689  hypothetical protein  35.81 
 
 		 597 aa  120  9.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.140286 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06300  hypothetical protein  36.55 
 
 		 854 aa  106  2e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0018  hypothetical protein  44.93 
 
 		 712 aa  53.5  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.485123  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0142  hypothetical protein  44.93 
 
 		 712 aa  53.5  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2644  hypothetical protein  25.86 
 
 		 643 aa  52  0.00005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.382571  normal  1 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4292  hypothetical protein  35.78 
 
 		 770 aa  51.6  0.00006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1967  hypothetical protein  36.59 
 
 		 844 aa  51.6  0.00006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.972801  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1985  hypothetical protein  23.63 
 
 		 771 aa  50.4  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.229709  normal  0.0294644 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0809  hypothetical protein  38.75 
 
 		 703 aa  49.7  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000260576 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2428  hypothetical protein  37.21 
 
 		 849 aa  47.8  0.0008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0793097 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39480  hypothetical protein  28.35 
 
 		 717 aa  47.8  0.0009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000519045  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0586  SMC domain-containing protein  29.52 
 
 		 993 aa  46.2  0.002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.594919  normal  0.0182683 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1503  hypothetical protein  33.77 
 
 		 792 aa  46.2  0.002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.269689 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1874  hypothetical protein  22.8 
 
 		 753 aa  45.8  0.004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3325  hypothetical protein  22.55 
 
 		 763 aa  44.7  0.007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0471  hypothetical protein  28.18 
 
 		 771 aa  44.7  0.009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0566  hypothetical protein  23.29 
 
 		 810 aa  44.3  0.01  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.913605  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1085  DNA repair ATPase-like protein  27.41 
 
 		 741 aa  44.3  0.01  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0841172  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3703  hypothetical protein  33.75 
 
 		 710 aa  44.3  0.01  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5563  hypothetical protein  33.33 
 
 		 792 aa  44.3  0.01  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>