25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcE24377A_D0018 on replicon NC_009788
Organism: Escherichia coli E24377A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_0809  hypothetical protein  52.44 
 
 		 703 aa  761    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000260576 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0142  hypothetical protein  99.3 
 
 		 712 aa  1460    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0018  hypothetical protein  100 
 
 		 712 aa  1472    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.485123  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4940  hypothetical protein  44.93 
 
 		 878 aa  53.1  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.188257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0528  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  35.29 
 
 		 402 aa  50.1  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2586  peptide ABC transporter ATPase  29.66 
 
 		 223 aa  49.3  0.0002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1004  ABC transporter, ATP-binding protein  27.12 
 
 		 220 aa  48.9  0.0003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2564  cobalt transporter ATP-binding subunit  31.52 
 
 		 273 aa  48.1  0.0006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000482859  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1151  hypothetical protein  22.44 
 
 		 743 aa  47.8  0.0007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.515935  normal  0.0297929 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4456  hypothetical protein  40.58 
 
 		 833 aa  47.8  0.0008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.681645 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2765  ABC transporter related protein  33.73 
 
 		 695 aa  47.4  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39480  hypothetical protein  29.25 
 
 		 717 aa  47  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000519045  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4992  hypothetical protein  36.11 
 
 		 881 aa  47.4  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0249  ABC transporter  26.09 
 
 		 217 aa  47  0.001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0892  hypothetical protein  29.27 
 
 		 890 aa  46.6  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.608011 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2796  ABC transporter related  33.33 
 
 		 580 aa  45.4  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00139459  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3455  ABC transporter-related protein  30.68 
 
 		 254 aa  45.4  0.003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.302044  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0026  ABC transporter related  30.85 
 
 		 273 aa  45.1  0.004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0841  putative cation ABC transporter, ATP-binding protein  26.81 
 
 		 242 aa  45.4  0.004  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.230766  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0571  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  24.76 
 
 		 339 aa  45.1  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2418  ABC transporter, transmembrane region, type 1  28.45 
 
 		 579 aa  45.1  0.005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0870797  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4292  hypothetical protein  25.18 
 
 		 770 aa  45.1  0.005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0590  ABC transporter related protein  29.36 
 
 		 263 aa  44.7  0.006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3083  hypothetical protein  30 
 
 		 796 aa  43.9  0.009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0889  ABC transporter, conserved site  24.5 
 
 		 439 aa  43.9  0.01  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.807362  hitchhiker  0.00457345 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>