32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_5563 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_5563  hypothetical protein  100 
 
 		 792 aa  1639    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1874  hypothetical protein  29.49 
 
 		 753 aa  301  2e-80  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1985  hypothetical protein  27.94 
 
 		 771 aa  293  8e-78  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.229709  normal  0.0294644 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2637  hypothetical protein  27.51 
 
 		 767 aa  292  2e-77  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.594259  normal  0.040177 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1868  hypothetical protein  27.6 
 
 		 818 aa  291  5.0000000000000004e-77  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.141951  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0471  hypothetical protein  28.14 
 
 		 771 aa  290  6e-77  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2619  hypothetical protein  27.85 
 
 		 767 aa  286  8e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.373268 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4229  hypothetical protein  27.41 
 
 		 722 aa  198  4.0000000000000005e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0264095  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1503  hypothetical protein  27.2 
 
 		 792 aa  197  5.000000000000001e-49  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.269689 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0566  hypothetical protein  23.8 
 
 		 810 aa  186  1.0000000000000001e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.913605  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3987  hypothetical protein  24.59 
 
 		 803 aa  168  2.9999999999999998e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1721  RloC protein, putative  22.67 
 
 		 776 aa  153  1e-35  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3703  hypothetical protein  23.4 
 
 		 710 aa  103  9e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39480  hypothetical protein  24.59 
 
 		 717 aa  97.4  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000519045  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4238  hypothetical protein  23.07 
 
 		 746 aa  94  9e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.648959  hitchhiker  0.00399627 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1533  hypothetical protein  23.37 
 
 		 757 aa  93.6  1e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0033  hypothetical protein  20.62 
 
 		 743 aa  90.5  1e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1151  hypothetical protein  24.53 
 
 		 743 aa  84  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.515935  normal  0.0297929 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2644  hypothetical protein  21.26 
 
 		 643 aa  67.8  0.0000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.382571  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0106  hypothetical protein  24.32 
 
 		 721 aa  63.5  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3111  hypothetical protein  22.34 
 
 		 765 aa  60.8  0.00000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0699  hypothetical protein  41.82 
 
 		 76 aa  59.7  0.0000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0698  hypothetical protein  30.89 
 
 		 156 aa  58.9  0.0000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1488  hypothetical protein  32.81 
 
 		 144 aa  58.9  0.0000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.016792  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0700  hypothetical protein  52.94 
 
 		 62 aa  55.1  0.000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4292  hypothetical protein  33.56 
 
 		 770 aa  53.9  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06300  hypothetical protein  24.66 
 
 		 854 aa  53.1  0.00002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1967  hypothetical protein  30.95 
 
 		 844 aa  49.3  0.0003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.972801  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3841  hypothetical protein  37.84 
 
 		 895 aa  46.2  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4992  hypothetical protein  23.78 
 
 		 881 aa  44.7  0.007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16300  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain protein  28.18 
 
 		 542 aa  44.3  0.008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4940  hypothetical protein  33.33 
 
 		 878 aa  44.3  0.009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.188257  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>