12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_1488 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_1488  hypothetical protein  100 
 
 		 144 aa  301  2.0000000000000002e-81  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.016792  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1985  hypothetical protein  39.13 
 
 		 771 aa  89.4  2e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.229709  normal  0.0294644 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0471  hypothetical protein  40 
 
 		 771 aa  86.3  1e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3987  hypothetical protein  37.4 
 
 		 803 aa  81.3  0.000000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2637  hypothetical protein  37.4 
 
 		 767 aa  76.6  0.0000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.594259  normal  0.040177 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2619  hypothetical protein  36.59 
 
 		 767 aa  74.3  0.0000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.373268 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1868  hypothetical protein  36.59 
 
 		 818 aa  73.9  0.0000000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.141951  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1721  RloC protein, putative  39.56 
 
 		 776 aa  71.6  0.000000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0566  hypothetical protein  34.68 
 
 		 810 aa  68.2  0.00000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.913605  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5563  hypothetical protein  32.81 
 
 		 792 aa  58.9  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1503  hypothetical protein  26.06 
 
 		 792 aa  44.7  0.0005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.269689 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4229  hypothetical protein  30.38 
 
 		 722 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0264095  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>