28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_3987 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_3987  hypothetical protein  100 
 
 		 803 aa  1656    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0566  hypothetical protein  49.37 
 
 		 810 aa  769    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.913605  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1721  RloC protein, putative  32.04 
 
 		 776 aa  379  1e-103  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2619  hypothetical protein  24.8 
 
 		 767 aa  183  1e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.373268 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2637  hypothetical protein  24.77 
 
 		 767 aa  175  3.9999999999999995e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.594259  normal  0.040177 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1868  hypothetical protein  24.76 
 
 		 818 aa  172  3e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.141951  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0471  hypothetical protein  25.97 
 
 		 771 aa  169  2e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5563  hypothetical protein  24.02 
 
 		 792 aa  166  1.0000000000000001e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1985  hypothetical protein  25.85 
 
 		 771 aa  158  4e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.229709  normal  0.0294644 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1503  hypothetical protein  22.82 
 
 		 792 aa  118  5e-25  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.269689 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4229  hypothetical protein  23.55 
 
 		 722 aa  107  7e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0264095  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1874  hypothetical protein  22.66 
 
 		 753 aa  99.4  3e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1151  hypothetical protein  24.19 
 
 		 743 aa  89  3e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.515935  normal  0.0297929 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1488  hypothetical protein  37.4 
 
 		 144 aa  81.3  0.00000000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.016792  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2644  hypothetical protein  24.42 
 
 		 643 aa  80.1  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.382571  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39480  hypothetical protein  25.07 
 
 		 717 aa  73.2  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000519045  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0106  hypothetical protein  22.35 
 
 		 721 aa  69.7  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1533  hypothetical protein  24.53 
 
 		 757 aa  67.8  0.0000000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4238  hypothetical protein  25.47 
 
 		 746 aa  63.2  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.648959  hitchhiker  0.00399627 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3703  hypothetical protein  40 
 
 		 710 aa  62  0.00000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0033  hypothetical protein  28.86 
 
 		 743 aa  54.7  0.000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15610  hypothetical protein  39.76 
 
 		 868 aa  51.2  0.00008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000202138  unclonable  3.13733e-21 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0267  hypothetical protein  28 
 
 		 872 aa  50.4  0.0001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2709  SMC domain protein  35.23 
 
 		 1036 aa  48.1  0.0006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7392  hypothetical protein  38.96 
 
 		 874 aa  48.1  0.0007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4566  ATPase involved in DNA repair  35 
 
 		 1059 aa  47  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.134908  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0040  DNA repair ATPase  34.15 
 
 		 1051 aa  45.1  0.005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.00000057692  hitchhiker  0.00102482 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4292  hypothetical protein  38.96 
 
 		 770 aa  44.3  0.008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>