22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS668_0106 on replicon NC_009074
Organism: Burkholderia pseudomallei 668



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009074  BURPS668_0106  hypothetical protein  100 
 
 
721 aa  1491    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39480  hypothetical protein  33.43 
 
 
717 aa  359  9.999999999999999e-98  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000519045  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2644  hypothetical protein  31.9 
 
 
643 aa  315  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.382571  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3703  hypothetical protein  28.11 
 
 
710 aa  241  4e-62  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1151  hypothetical protein  26.38 
 
 
743 aa  219  2e-55  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.515935  normal  0.0297929 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1533  hypothetical protein  25.47 
 
 
757 aa  206  1e-51  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4238  hypothetical protein  26.73 
 
 
746 aa  202  1.9999999999999998e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.648959  hitchhiker  0.00399627 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0033  hypothetical protein  25.75 
 
 
743 aa  200  7.999999999999999e-50  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0566  hypothetical protein  24.87 
 
 
810 aa  70.1  0.0000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.913605  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3987  hypothetical protein  22.35 
 
 
803 aa  69.7  0.0000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2637  hypothetical protein  21.97 
 
 
767 aa  69.7  0.0000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.594259  normal  0.040177 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1721  RloC protein, putative  29.24 
 
 
776 aa  68.6  0.0000000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2619  hypothetical protein  22.15 
 
 
767 aa  68.2  0.0000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.373268 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1868  hypothetical protein  22.87 
 
 
818 aa  64.7  0.000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.141951  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5563  hypothetical protein  24.16 
 
 
792 aa  63.5  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1985  hypothetical protein  24.82 
 
 
771 aa  57.8  0.0000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.229709  normal  0.0294644 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0471  hypothetical protein  22.15 
 
 
771 aa  56.6  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4292  hypothetical protein  20.19 
 
 
770 aa  55.5  0.000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1874  hypothetical protein  25.3 
 
 
753 aa  53.5  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1967  hypothetical protein  24.46 
 
 
844 aa  46.2  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.972801  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4229  hypothetical protein  25.33 
 
 
722 aa  44.7  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0264095  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0127  hypothetical protein  26.96 
 
 
869 aa  44.7  0.007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>