40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_39480 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_2644  hypothetical protein  63.61 
 
 		 643 aa  861    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.382571  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39480  hypothetical protein  100 
 
 		 717 aa  1488    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000519045  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0106  hypothetical protein  33.61 
 
 		 721 aa  364  2e-99  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3703  hypothetical protein  33.8 
 
 		 710 aa  337  5e-91  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1533  hypothetical protein  28.55 
 
 		 757 aa  238  3e-61  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0033  hypothetical protein  24.67 
 
 		 743 aa  228  2e-58  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4238  hypothetical protein  27.19 
 
 		 746 aa  223  9e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.648959  hitchhiker  0.00399627 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1151  hypothetical protein  27.13 
 
 		 743 aa  220  8.999999999999998e-56  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.515935  normal  0.0297929 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5563  hypothetical protein  24.53 
 
 		 792 aa  94.7  5e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0566  hypothetical protein  22.34 
 
 		 810 aa  87.8  6e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.913605  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0471  hypothetical protein  22.31 
 
 		 771 aa  80.1  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1721  RloC protein, putative  20.8 
 
 		 776 aa  79  0.0000000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1985  hypothetical protein  21.4 
 
 		 771 aa  74.7  0.000000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.229709  normal  0.0294644 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2637  hypothetical protein  26.07 
 
 		 767 aa  74.7  0.000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.594259  normal  0.040177 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1868  hypothetical protein  26.07 
 
 		 818 aa  74.3  0.000000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.141951  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3987  hypothetical protein  25.07 
 
 		 803 aa  72.4  0.00000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2619  hypothetical protein  26.92 
 
 		 767 aa  72.4  0.00000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.373268 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1503  hypothetical protein  23.83 
 
 		 792 aa  66.6  0.000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.269689 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1874  hypothetical protein  29.28 
 
 		 753 aa  66.2  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4229  hypothetical protein  21.34 
 
 		 722 aa  64.7  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0264095  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3111  hypothetical protein  22.48 
 
 		 765 aa  55.1  0.000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3841  hypothetical protein  35.96 
 
 		 895 aa  49.3  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0809  hypothetical protein  29.2 
 
 		 703 aa  49.3  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000260576 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4292  hypothetical protein  30.19 
 
 		 770 aa  48.9  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2428  hypothetical protein  25.34 
 
 		 849 aa  48.9  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0793097 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4940  hypothetical protein  28.35 
 
 		 878 aa  47.4  0.0008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.188257  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15610  hypothetical protein  30 
 
 		 868 aa  47.8  0.0008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000202138  unclonable  3.13733e-21 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0267  hypothetical protein  35.42 
 
 		 872 aa  47.4  0.0009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0142  hypothetical protein  29.25 
 
 		 712 aa  47  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1967  hypothetical protein  37.5 
 
 		 844 aa  47.4  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.972801  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06300  hypothetical protein  29.46 
 
 		 854 aa  46.6  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0018  hypothetical protein  29.25 
 
 		 712 aa  47  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.485123  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7392  hypothetical protein  33.61 
 
 		 874 aa  45.8  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0449  anticodon nuclease  27.6 
 
 		 366 aa  45.4  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000618209 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2005  anticodon nuclease  29.52 
 
 		 392 aa  45.1  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.924608  normal  0.799191 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2374  anticodon nuclease, putative  29.52 
 
 		 392 aa  45.1  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.815652  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3054  hypothetical protein  35.96 
 
 		 896 aa  45.4  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7587  SMC domain-containing protein  36.84 
 
 		 873 aa  45.1  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.328529  normal  0.0896714 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2640  hypothetical protein  27.27 
 
 		 887 aa  44.7  0.006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.24246  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2596  hypothetical protein  27.27 
 
 		 887 aa  44.7  0.006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.889024  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>