28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_1533 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010003  Pmob_1533  hypothetical protein  100 
 
 		 757 aa  1507    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1151  hypothetical protein  37.08 
 
 		 743 aa  504  1e-141  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.515935  normal  0.0297929 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4238  hypothetical protein  35.87 
 
 		 746 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.648959  hitchhiker  0.00399627 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0033  hypothetical protein  35.38 
 
 		 743 aa  412  1e-114  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39480  hypothetical protein  28.42 
 
 		 717 aa  235  3e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000519045  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0106  hypothetical protein  25.47 
 
 		 721 aa  214  7e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2644  hypothetical protein  26.76 
 
 		 643 aa  191  5e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.382571  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3703  hypothetical protein  22.62 
 
 		 710 aa  175  1.9999999999999998e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1721  RloC protein, putative  27.85 
 
 		 776 aa  102  3e-20  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5563  hypothetical protein  23.37 
 
 		 792 aa  96.3  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1868  hypothetical protein  25.69 
 
 		 818 aa  88.6  4e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.141951  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1503  hypothetical protein  20.84 
 
 		 792 aa  87.4  9e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.269689 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2637  hypothetical protein  27.37 
 
 		 767 aa  87.4  0.000000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.594259  normal  0.040177 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2619  hypothetical protein  27.34 
 
 		 767 aa  82  0.00000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.373268 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1874  hypothetical protein  24.41 
 
 		 753 aa  81.3  0.00000000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4229  hypothetical protein  23.3 
 
 		 722 aa  75.1  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0264095  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3987  hypothetical protein  22.47 
 
 		 803 aa  74.3  0.000000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0471  hypothetical protein  23.78 
 
 		 771 aa  74.3  0.000000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1985  hypothetical protein  23.73 
 
 		 771 aa  73.6  0.00000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.229709  normal  0.0294644 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4292  hypothetical protein  21.52 
 
 		 770 aa  50.8  0.00008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0449  anticodon nuclease  25.5 
 
 		 366 aa  50.8  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000618209 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0130  anticodon nuclease  23.61 
 
 		 366 aa  49.3  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.4198 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2620  hypothetical protein  31.71 
 
 		 439 aa  48.1  0.0006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.98214  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2005  anticodon nuclease  23.74 
 
 		 392 aa  47.8  0.0008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.924608  normal  0.799191 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2374  anticodon nuclease, putative  23.74 
 
 		 392 aa  47.8  0.0008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.815652  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1539  hypothetical protein  25.99 
 
 		 235 aa  46.2  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.930014  normal  0.268516 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0926  anticodon nuclease  30.51 
 
 		 390 aa  46.2  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000288709  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2396  anticodon nuclease  33 
 
 		 377 aa  45.8  0.003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.000000000000459061  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>