39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4992 on replicon NC_009508
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009508  Swit_4992  hypothetical protein  100 
 
 		 881 aa  1792    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2026  hypothetical protein  29.99 
 
 		 897 aa  335  2e-90  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.657836  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15610  hypothetical protein  32.7 
 
 		 868 aa  320  1e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000202138  unclonable  3.13733e-21 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0127  hypothetical protein  29.6 
 
 		 869 aa  315  2.9999999999999996e-84  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0267  hypothetical protein  29.8 
 
 		 872 aa  281  3e-74  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7392  hypothetical protein  28.02 
 
 		 874 aa  276  1.0000000000000001e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3054  hypothetical protein  28.73 
 
 		 896 aa  256  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4456  hypothetical protein  29.65 
 
 		 833 aa  256  1.0000000000000001e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.681645 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4940  hypothetical protein  27.57 
 
 		 878 aa  250  9e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.188257  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3841  hypothetical protein  28.7 
 
 		 895 aa  248  3e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7587  SMC domain-containing protein  26.75 
 
 		 873 aa  239  1e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.328529  normal  0.0896714 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3692  hypothetical protein  26.23 
 
 		 891 aa  212  3e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000374969 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0643  ATPase  25.67 
 
 		 781 aa  204  8e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0107  hypothetical protein  25.09 
 
 		 869 aa  185  3e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6595  hypothetical protein  26.77 
 
 		 880 aa  174  5.999999999999999e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2596  hypothetical protein  25.67 
 
 		 887 aa  143  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.889024  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2640  hypothetical protein  25.67 
 
 		 887 aa  143  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.24246  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06300  hypothetical protein  25.97 
 
 		 854 aa  142  3.9999999999999997e-32  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7689  hypothetical protein  35.32 
 
 		 597 aa  95.9  3e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.140286 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4292  hypothetical protein  45.33 
 
 		 770 aa  56.2  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2428  hypothetical protein  22.92 
 
 		 849 aa  52.4  0.00004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0793097 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3083  hypothetical protein  41.43 
 
 		 796 aa  52.4  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1967  hypothetical protein  38.1 
 
 		 844 aa  51.6  0.00006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.972801  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0892  hypothetical protein  33.33 
 
 		 890 aa  48.5  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.608011 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1494  ABC transporter related  38.55 
 
 		 482 aa  48.1  0.0006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0334764  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2668  hypothetical protein  41.33 
 
 		 695 aa  47.8  0.0009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0018  hypothetical protein  36.11 
 
 		 712 aa  47.4  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.485123  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0471  hypothetical protein  27.11 
 
 		 771 aa  47  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0142  hypothetical protein  36.11 
 
 		 712 aa  47.4  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5100  SMC domain protein  38.67 
 
 		 676 aa  47  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.13432  normal  0.797675 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0449  anticodon nuclease  35.37 
 
 		 366 aa  45.4  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000618209 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2005  anticodon nuclease  32.97 
 
 		 392 aa  45.4  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.924608  normal  0.799191 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2374  anticodon nuclease, putative  32.97 
 
 		 392 aa  45.4  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.815652  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1721  RloC protein, putative  25.44 
 
 		 776 aa  45.8  0.004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1100  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  32.88 
 
 		 276 aa  45.4  0.005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.873778  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2617  putative ATP-binding subunit of urea ABC transport system  35.71 
 
 		 249 aa  45.1  0.006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0781803  normal  0.377264 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1603  ABC transporter, ATP-binding protein  37.66 
 
 		 481 aa  45.1  0.006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1503  hypothetical protein  32.41 
 
 		 792 aa  45.1  0.007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.269689 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1830  hypothetical protein  34.62 
 
 		 955 aa  44.7  0.009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>