41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_0809 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009788  EcE24377A_D0018  hypothetical protein  52.44 
 
 		 712 aa  753    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.485123  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0809  hypothetical protein  100 
 
 		 703 aa  1451    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000260576 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0142  hypothetical protein  52.15 
 
 		 712 aa  747    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39480  hypothetical protein  24.02 
 
 		 717 aa  50.8  0.00008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000519045  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4940  hypothetical protein  38.75 
 
 		 878 aa  49.7  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.188257  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0686  peptide ABC transporter ATPase  43.28 
 
 		 223 aa  49.7  0.0002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0577  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  37.65 
 
 		 395 aa  48.9  0.0003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1151  cobalt transporter ATP-binding subunit  28.83 
 
 		 276 aa  48.5  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.949542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2586  peptide ABC transporter ATPase  36.23 
 
 		 223 aa  47.4  0.0009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2564  cobalt transporter ATP-binding subunit  32.89 
 
 		 273 aa  46.6  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000482859  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0988  ABC transporter related  25 
 
 		 494 aa  47  0.001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1792  ABC transporter-related protein  34.83 
 
 		 234 aa  47  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.153543  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1985  hypothetical protein  24.68 
 
 		 771 aa  45.8  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.229709  normal  0.0294644 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1758  ABC transporter related  34.33 
 
 		 230 aa  45.8  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.928833  normal  0.246286 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2662  ABC transporter related  35 
 
 		 538 aa  46.2  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0597  ABC transporter-related protein  34.29 
 
 		 509 aa  46.6  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0679613  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4292  hypothetical protein  27.54 
 
 		 770 aa  45.8  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1776  ABC transporter related  36.71 
 
 		 597 aa  45.8  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000473334 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08711  ABC transporter ATPase  26.67 
 
 		 262 aa  45.1  0.004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0132  type I secretion ATP-binding protein  33.75 
 
 		 602 aa  44.7  0.005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2375  ABC transporter related  23.78 
 
 		 271 aa  45.1  0.005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000193813 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1354  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  34.29 
 
 		 252 aa  44.7  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3892  ABC transporter  33.75 
 
 		 602 aa  44.7  0.006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.881504 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4084  type I secretion system ATPase  33.75 
 
 		 602 aa  44.7  0.006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0995  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  37.14 
 
 		 243 aa  44.3  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0515  cobalt ABC transporter ATPase subunit  37.5 
 
 		 271 aa  44.3  0.007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0790003  normal  0.0377696 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0942  ABC transporter related  29.79 
 
 		 551 aa  44.7  0.007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.337051  normal  0.0501434 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3206  ABC transporter related  27.05 
 
 		 255 aa  44.7  0.007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.204307  normal  0.785488 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0005  ABC transporter related  32.94 
 
 		 269 aa  44.3  0.007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.964795  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3811  ABC transporter related  31.63 
 
 		 563 aa  44.3  0.008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.148208 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0168  ABC transporter related protein  29.07 
 
 		 255 aa  44.3  0.008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0275  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  32.39 
 
 		 270 aa  43.9  0.009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2137  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  34.52 
 
 		 264 aa  43.9  0.009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2383  ABC transporter related  34 
 
 		 303 aa  43.9  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.8611  normal  0.599894 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0493  ABC transporter-related protein  33.33 
 
 		 224 aa  44.3  0.009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.352505  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3196  ABC transporter related  24.8 
 
 		 350 aa  44.3  0.009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0864973 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0471  hypothetical protein  22.98 
 
 		 771 aa  43.9  0.009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2845  ABC transporter related  33.71 
 
 		 288 aa  43.9  0.01  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1074  hypothetical protein  35.21 
 
 		 380 aa  43.9  0.01  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6592  ABC transporter, ATP-binding protein  30.91 
 
 		 294 aa  43.9  0.01  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.363745  normal  0.761698 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5563  hypothetical protein  34.83 
 
 		 792 aa  43.9  0.01  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>