More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_2662 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_2662  ABC transporter related  100 
 
 		 538 aa  1050    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3513  ABC transporter related protein  50.56 
 
 		 541 aa  489  1e-137  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.709638  normal  0.461992 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0942  ABC transporter related  52.12 
 
 		 551 aa  479  1e-134  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.337051  normal  0.0501434 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0298  ABC transporter related  50.46 
 
 		 565 aa  479  1e-134  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3220  ABC transporter, ATP-binding protein  52.23 
 
 		 539 aa  476  1e-133  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.94364  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1054  ABC transporter related  51.32 
 
 		 563 aa  473  1e-132  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.763117  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3154  ABC transporter-related protein  48.81 
 
 		 557 aa  467  9.999999999999999e-131  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7172  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  48.59 
 
 		 547 aa  466  9.999999999999999e-131  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.892646  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13693  dipeptide-transport ATP-binding protein ABC transporter dppD  51.03 
 
 		 548 aa  466  9.999999999999999e-131  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.373881  normal  0.206528 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3912  ABC transporter related protein  46.7 
 
 		 594 aa  462  1e-129  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0030  ABC transporter related  48.43 
 
 		 558 aa  462  1e-129  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2819  ABC transporter related  45.45 
 
 		 571 aa  462  1e-129  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.810211  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34300  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  48.23 
 
 		 661 aa  461  9.999999999999999e-129  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.183589 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1128  ABC transporter related  47.05 
 
 		 588 aa  460  9.999999999999999e-129  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.716333  normal  0.0608285 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4819  ABC transporter related  47.37 
 
 		 619 aa  461  9.999999999999999e-129  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0993193 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2537  ABC transporter related  46.45 
 
 		 573 aa  452  1.0000000000000001e-126  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000203549 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18700  ABC transporter, ATP binding component  52.35 
 
 		 542 aa  449  1e-125  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.106187  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05580  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  51.29 
 
 		 583 aa  450  1e-125  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.158462  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0028  ABC transporter related  48.11 
 
 		 546 aa  446  1.0000000000000001e-124  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0987785  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11080  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  43.64 
 
 		 643 aa  447  1.0000000000000001e-124  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4177  ABC transporter related  47.63 
 
 		 561 aa  448  1.0000000000000001e-124  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4459  ABC transporter related protein  46.21 
 
 		 565 aa  443  1e-123  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3752  ABC transporter related  48.84 
 
 		 597 aa  444  1e-123  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1962  ABC transporter related protein  47.21 
 
 		 573 aa  438  9.999999999999999e-123  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3091  nickel ABC transporter, ATP-binding protein, putative  49.91 
 
 		 548 aa  440  9.999999999999999e-123  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00987515  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2746  ABC transporter related  48.13 
 
 		 575 aa  442  9.999999999999999e-123  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.212206  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0472  ABC transporter related  49.72 
 
 		 545 aa  436  1e-121  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.197295  normal  0.707988 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2961  ABC transporter  50.56 
 
 		 547 aa  436  1e-121  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2314  ABC transporter related  49.15 
 
 		 536 aa  437  1e-121  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.399989  normal  0.717185 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4851  putative ABC transporter ATP-binding protein  47.74 
 
 		 546 aa  432  1e-120  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.508729  normal  0.466263 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7191  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  46.97 
 
 		 564 aa  425  1e-118  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.453207  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1776  ABC transporter related  46.56 
 
 		 597 aa  426  1e-118  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000473334 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1269  ABC transporter related  49.16 
 
 		 559 aa  423  1e-117  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6562  ABC transporter related  49.16 
 
 		 559 aa  423  1e-117  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2386  peptide ABC transporter  46.64 
 
 		 536 aa  421  1e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6168  ABC transporter related  48.98 
 
 		 559 aa  419  1e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.282987  normal  0.0147704 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1602  ABC transporter-like protein  48.59 
 
 		 547 aa  420  1e-116  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4323  ABC transporter related  47.52 
 
 		 547 aa  420  1e-116  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2194  ABC transporter related  45.23 
 
 		 600 aa  421  1e-116  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.966605  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0716  ABC transporter related  42.52 
 
 		 606 aa  422  1e-116  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.953426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5077  ABC transporter related  44.3 
 
 		 549 aa  416  9.999999999999999e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.704503  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1913  ABC transporter related protein  45.3 
 
 		 530 aa  414  1e-114  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4835  putative ABC transporter ATP-binding protein  45.08 
 
 		 572 aa  412  1e-114  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.671613 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5181  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  44.49 
 
 		 578 aa  414  1e-114  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01760  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  44.65 
 
 		 584 aa  414  1e-114  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1642  ABC transporter related  45.3 
 
 		 538 aa  411  1e-113  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7201  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (peptide)  46.53 
 
 		 543 aa  410  1e-113  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0277171  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1268  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  47.42 
 
 		 540 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5116  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  42.61 
 
 		 555 aa  408  1.0000000000000001e-112  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1617  ABC transporter-related protein  44.92 
 
 		 547 aa  406  1.0000000000000001e-112  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.683358  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6678  ABC transporter related  44.28 
 
 		 562 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.736042 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2057  ABC transporter related  45.3 
 
 		 537 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0471715  normal  0.693771 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5904  ABC transporter related  42.4 
 
 		 555 aa  402  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.969657  normal  0.702258 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29680  ABC transporter, ATP binding component  46.6 
 
 		 537 aa  404  1e-111  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0246021  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2236  ATPase  46.31 
 
 		 554 aa  403  1e-111  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.274783 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4080  ABC transporter related  44.53 
 
 		 542 aa  402  1e-111  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3489  glutathione import ATP-binding protein GsiA  45.51 
 
 		 537 aa  403  1e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2563  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  41.86 
 
 		 571 aa  402  1e-111  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000295279  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0658  ABC peptide transporter  44.38 
 
 		 533 aa  404  1e-111  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4449  ABC transporter related  43.84 
 
 		 545 aa  402  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.875798 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4026  ABC transporter related  42.62 
 
 		 546 aa  400  9.999999999999999e-111  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.393631  normal  0.697509 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3606  ABC transporter related  44.34 
 
 		 566 aa  399  9.999999999999999e-111  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2549  ABC transporter related  44.59 
 
 		 530 aa  402  9.999999999999999e-111  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.165477 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1310  ABC transporter related  45.66 
 
 		 544 aa  400  9.999999999999999e-111  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0559382  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1832  ABC transporter related  43.12 
 
 		 606 aa  400  9.999999999999999e-111  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0149  ABC transporter related  47.54 
 
 		 528 aa  400  9.999999999999999e-111  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.171505  normal  0.324969 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6874  ABC transporter related  42.23 
 
 		 555 aa  397  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0245  ABC transporter related  45.18 
 
 		 542 aa  396  1e-109  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4135  ABC transporter related  43.66 
 
 		 545 aa  396  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3363  ABC transporter related  43.66 
 
 		 542 aa  395  1e-108  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1810  ABC transporter related  44.38 
 
 		 566 aa  393  1e-108  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.295405  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6665  ABC transporter related  41.77 
 
 		 611 aa  392  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00669103 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1819  ATPase components of various ABC-type transport systems contain duplicated ATPase  43.73 
 
 		 593 aa  394  1e-108  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0376212  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0425  ABC transporter related  44.1 
 
 		 569 aa  394  1e-108  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.703933  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0701  peptide ABC transporter ATPase  44.83 
 
 		 543 aa  393  1e-108  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5758  ABC transporter related  43.58 
 
 		 611 aa  394  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14270  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  43.35 
 
 		 577 aa  392  1e-108  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2459  glutathione import ATP-binding protein GsiA  44.98 
 
 		 529 aa  393  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.798953 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2402  ABC transporter related  41.77 
 
 		 615 aa  392  1e-108  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1749  ABC transporter related  43.41 
 
 		 599 aa  393  1e-108  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.84058  normal  0.153665 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0800  ABC transporter related  45.35 
 
 		 540 aa  394  1e-108  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.614188  normal  0.588931 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0561  ABC transporter for peptide ATP-binding protein  40.22 
 
 		 566 aa  392  1e-108  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0504  ABC transporter related protein  44.42 
 
 		 562 aa  393  1e-108  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00492  ABC transporter ATPase component  41.14 
 
 		 571 aa  394  1e-108  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2776  ABC transporter related  44.07 
 
 		 539 aa  392  1e-108  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001975  peptide ABC transporter ATP-binding protein  41.32 
 
 		 571 aa  393  1e-108  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.175781  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4108  ABC transporter related  40.79 
 
 		 612 aa  389  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3720  ABC transporter, ATP-binding protein  43.15 
 
 		 536 aa  390  1e-107  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.59645  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0625  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  41.17 
 
 		 623 aa  391  1e-107  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2826  ABC transporter related  41.22 
 
 		 572 aa  392  1e-107  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0515832  normal  0.0638843 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2031  ABC transporter ATP-binding protein  41.09 
 
 		 539 aa  392  1e-107  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00115375  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3002  ABC transporter related  43.86 
 
 		 531 aa  390  1e-107  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3434  ABC transporter related  45.4 
 
 		 536 aa  390  1e-107  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.560851 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4143  ABC transporter related  42.32 
 
 		 556 aa  390  1e-107  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.538724 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3722  ABC transporter related  44.07 
 
 		 535 aa  390  1e-107  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00680128  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2339  ABC transporter related  43.39 
 
 		 530 aa  389  1e-107  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1804  ABC transporter related  44.47 
 
 		 537 aa  391  1e-107  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.147708 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4251  ABC transporter related  43.58 
 
 		 558 aa  389  1e-107  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.214566 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0594  ABC transporter related  47.05 
 
 		 530 aa  389  1e-107  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2356  ABC transporter related  44.64 
 
 		 543 aa  389  1e-107  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.10022 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>