More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0988 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_0988  ABC transporter related  100 
 
 		 494 aa  1014    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1029  ABC transporter related  40.67 
 
 		 486 aa  334  2e-90  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.114878 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04650  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  37.69 
 
 		 540 aa  320  5e-86  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3337  ABC transporter, ATP-binding protein  34.73 
 
 		 551 aa  282  7.000000000000001e-75  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1914  ABC transporter, ATP-binding protein  33.97 
 
 		 551 aa  270  5.9999999999999995e-71  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3317  ABC transporter, ATP-binding protein  35.27 
 
 		 551 aa  268  2e-70  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3337  ABC transporter, ATP-binding protein  34.8 
 
 		 551 aa  268  2e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.472956  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3105  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  34.8 
 
 		 551 aa  267  2.9999999999999995e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3118  ABC transporter ATP-binding protein  34.35 
 
 		 553 aa  266  5e-70  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.209268  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3364  ABC transporter ATP-binding protein  34.42 
 
 		 551 aa  266  5e-70  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.499953  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3041  ABC transporter related  33.65 
 
 		 553 aa  265  1e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0282297  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3008  cobalt ABC transporter ATP-binding protein  34.91 
 
 		 553 aa  264  3e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3323  ABC transporter, ATP-binding protein  34.61 
 
 		 553 aa  259  7e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2114  ABC transporter-related protein  33.4 
 
 		 549 aa  244  3.9999999999999997e-63  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1456  ABC transporter related  31.1 
 
 		 553 aa  228  2e-58  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.539244 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2501  ABC transporter related  30.8 
 
 		 534 aa  216  9.999999999999999e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15960  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  30.2 
 
 		 547 aa  204  2e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.221964  normal  0.345832 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2676  ABC transporter related  29.32 
 
 		 587 aa  204  3e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0827069  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0231  ABC transporter related  29.71 
 
 		 531 aa  201  3e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0259  hypothetical protein  30.63 
 
 		 469 aa  200  5e-50  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.308359 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0943  ABC transporter related  28.81 
 
 		 547 aa  199  1.0000000000000001e-49  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.742397  normal  0.41118 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1967  ABC transporter related  29.38 
 
 		 557 aa  197  3e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000973453  decreased coverage  0.00000019126 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0563  ABC transporter related  30.04 
 
 		 581 aa  197  4.0000000000000005e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000790645  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3430  ABC transporter related  29.3 
 
 		 530 aa  192  8e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.618683  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3111  ABC transporter related protein  28.49 
 
 		 540 aa  192  1e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0317761  normal  0.310337 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2291  ABC transporter related  28.71 
 
 		 535 aa  192  1e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0180865  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1801  ABC transporter related  31.02 
 
 		 501 aa  191  2.9999999999999997e-47  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1242  ABC transporter related protein  26.99 
 
 		 518 aa  190  5.999999999999999e-47  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1046  ABC transporter related  29.59 
 
 		 564 aa  189  1e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4400  ABC transporter related  28.12 
 
 		 543 aa  185  2.0000000000000003e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.675825  normal  0.828936 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1694  ABC transporter related  28.69 
 
 		 497 aa  181  4e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.118958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0597  ABC transporter-related protein  29.34 
 
 		 509 aa  179  9e-44  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0679613  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8788  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  29.64 
 
 		 550 aa  178  2e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07510  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  27.97 
 
 		 495 aa  176  8e-43  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.568441 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0055  ATPase of ABC-type transport systems  28.91 
 
 		 810 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.165072  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2045  ABC transporter related protein  29.04 
 
 		 482 aa  171  2e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.777914  normal  0.886605 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3888  ABC transporter related  26.56 
 
 		 593 aa  170  5e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000491175  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0824  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  27.87 
 
 		 770 aa  169  1e-40  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1484  ABC transporter related  29.54 
 
 		 471 aa  168  2e-40  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1767  ABC transporter related  28.99 
 
 		 493 aa  168  2e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1598  ABC transporter, ATP-binding protein  27.42 
 
 		 502 aa  168  2.9999999999999998e-40  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0419  ABC transporter ATPase  28.78 
 
 		 537 aa  167  5e-40  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00765157  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3087  ABC transporter related  27.29 
 
 		 498 aa  166  8e-40  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2823  putative cobalt transport system ATP-binding protein  26.9 
 
 		 501 aa  163  6e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.178589 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4124  ABC transporter related  27.88 
 
 		 526 aa  163  6e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000316959 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0331  ABC transporter related  29.29 
 
 		 497 aa  163  7e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.740588  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2158  ABC transporter, ATP-binding protein  26.37 
 
 		 502 aa  163  8.000000000000001e-39  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0430843  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1105  ABC transporter related  27.47 
 
 		 541 aa  163  8.000000000000001e-39  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2703  ABC transporter related  26.72 
 
 		 576 aa  162  1e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1434  ABC transporter related  29.9 
 
 		 516 aa  162  1e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.305942  normal  0.80431 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1303  ABC transporter related  25.47 
 
 		 481 aa  162  1e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0918882  normal  0.057241 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1541  ABC transporter related  29.37 
 
 		 548 aa  161  2e-38  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.795149  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1420  ABC transporter related  26.52 
 
 		 553 aa  160  4e-38  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.317309  normal  0.7717 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1544  ABC transporter related  26.4 
 
 		 510 aa  160  5e-38  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1759  ABC transporter related  29.1 
 
 		 569 aa  159  7e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3343  ABC transporter related  30.22 
 
 		 960 aa  159  8e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1787  ABC transporter related  29.1 
 
 		 569 aa  159  9e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0679  Sigma 54 interacting domain protein  25.16 
 
 		 463 aa  159  1e-37  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0707  ABC transporter related  24.11 
 
 		 568 aa  159  1e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0149651 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0028  ABC transporter related  27.19 
 
 		 546 aa  159  1e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0987785  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0434  ABC transporter related  26.26 
 
 		 522 aa  158  2e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1662  ABC transporter related  28.92 
 
 		 460 aa  157  3e-37  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1540  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  26.97 
 
 		 562 aa  158  3e-37  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.20129  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0848  ABC transporter related  31.58 
 
 		 451 aa  157  4e-37  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0369  ABC transporter related protein  25.24 
 
 		 568 aa  157  4e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4177  ABC transporter related  28.08 
 
 		 561 aa  157  5.0000000000000005e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0243  ABC transporter, ATP-binding protein  25.62 
 
 		 491 aa  157  6e-37  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2622  ABC transporter, ATP-binding protein  29.49 
 
 		 470 aa  156  7e-37  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2110  ABC transporter related protein  24.86 
 
 		 571 aa  156  9e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.147486  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4459  ABC transporter related protein  27.53 
 
 		 565 aa  155  1e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0225  ABC transporter related  24.58 
 
 		 571 aa  155  1e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1895  ABC transporter related  25.61 
 
 		 574 aa  156  1e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0190897  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2765  ABC transporter related  25.29 
 
 		 570 aa  155  2e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2708  ABC transporter related  25.29 
 
 		 570 aa  155  2e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0817  ABC transporter related  26.94 
 
 		 545 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.252314  normal  0.0669471 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1540  ABC transporter related  30.79 
 
 		 458 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0282  ABC transporter, ATP-binding protein  25.78 
 
 		 489 aa  154  5e-36  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.894539  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2662  ABC transporter related  29.08 
 
 		 538 aa  154  5e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4851  putative ABC transporter ATP-binding protein  27.61 
 
 		 546 aa  154  5e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.508729  normal  0.466263 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2320  ABC transporter related  27.73 
 
 		 514 aa  154  5e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.896424 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1609  ABC transporter related  26.64 
 
 		 478 aa  153  7e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.587371 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1054  ABC transporter related  27.68 
 
 		 563 aa  153  7e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.763117  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2689  ABC transporter related protein  26.65 
 
 		 530 aa  152  1e-35  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0030  ABC transporter related  26.33 
 
 		 558 aa  152  1e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0315  ABC transporter related  28.6 
 
 		 491 aa  151  2e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0767  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  25.61 
 
 		 457 aa  150  4e-35  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.327658  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1490  ABC transporter related  28.24 
 
 		 408 aa  150  4e-35  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.513029  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5273  ABC transporter related  28.17 
 
 		 488 aa  150  5e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4772  ABC transporter related  27.85 
 
 		 500 aa  150  5e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3100  ABC transporter related  27.37 
 
 		 477 aa  150  5e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.503576  normal  0.57162 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5362  ABC transporter related  28.17 
 
 		 488 aa  150  5e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.529783  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2396  ABC-type transport system, putative ATPase component  28.99 
 
 		 456 aa  150  6e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.175921  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2653  ABC transporter related  26.97 
 
 		 490 aa  149  1.0000000000000001e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1272  ABC transporter-related protein  27.37 
 
 		 548 aa  149  1.0000000000000001e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000618356 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2441  ABC transporter related  27.73 
 
 		 449 aa  149  1.0000000000000001e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.166443  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25730  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  28.6 
 
 		 479 aa  149  1.0000000000000001e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6641  ABC transporter related  26.31 
 
 		 542 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.274459 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2059  ABC transporter related  28.48 
 
 		 506 aa  148  2.0000000000000003e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0776584 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3624  ABC transporter related  29.46 
 
 		 966 aa  148  2.0000000000000003e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0090  ABC transporter related  26.96 
 
 		 574 aa  149  2.0000000000000003e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0101014  normal  0.484977 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>